MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 9348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018641	A	7	7	1633227	1633233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_018641	CTTT	2	8	1635318	1635325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_018641	GTC	2	6	1635374	1635379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_018641	TCA	2	6	1635388	1635393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_018641	AGG	2	6	1635397	1635402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_018641	GCA	2	6	1636448	1636453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_018641	GCC	2	6	1636468	1636473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_018641	T	6	6	1636474	1636479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_018641	TCGA	2	8	1636514	1636521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_018641	TCC	2	6	1636772	1636777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_018641	GCT	2	6	1636833	1636838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_018641	TCAG	2	8	1636853	1636860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_018641	CGA	2	6	1636861	1636866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_018641	A	7	7	1637874	1637880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_018641	CGTA	2	8	1637882	1637889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_018641	TTAGTT	2	12	1639171	1639182	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_018641	GAT	2	6	1639196	1639201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018641	TGA	2	6	1639245	1639250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_018641	A	6	6	1639284	1639289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018641	TCA	2	6	1639609	1639614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_018641	CTCG	2	8	1639691	1639698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_018641	CTA	2	6	1639764	1639769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_018641	GCC	2	6	1639798	1639803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_018641	ACT	2	6	1640363	1640368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_018641	ATT	2	6	1640974	1640979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5028	NC_018641	CTT	2	6	1644000	1644005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_018641	AAG	2	6	1644030	1644035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018641	CCT	2	6	1648978	1648983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_018641	GAT	2	6	1648999	1649004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_018641	A	6	6	1649046	1649051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018641	TCATA	2	10	1652215	1652224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5034	NC_018641	TAAA	2	8	1659355	1659362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018641	A	6	6	1659360	1659365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_018641	CGT	2	6	1659429	1659434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_018641	CTAC	2	8	1659468	1659475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_018641	GCA	2	6	1659498	1659503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_018641	GCT	2	6	1659692	1659697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_018641	AGT	2	6	1659736	1659741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_018641	TAA	2	6	1659767	1659772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_018641	AAT	2	6	1662794	1662799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018641	ACGA	2	8	1662832	1662839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_018641	TCGT	2	8	1662859	1662866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_018641	ACA	2	6	1662958	1662963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_018641	TGT	2	6	1662987	1662992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5048	NC_018641	AAT	2	6	1663165	1663170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_018641	TCT	2	6	1663215	1663220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5053	NC_018641	AGTT	2	8	1668673	1668680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_018641	ATG	2	6	1668761	1668766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018641	GCC	2	6	1668779	1668784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5057	NC_018641	TGC	2	6	1669940	1669945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5059	NC_018641	ATA	3	9	1672044	1672052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5061	NC_018641	GAA	2	6	1674409	1674414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5100	NC_018641	CG	5	10	1678912	1678921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5110	NC_018641	CG	3	6	1680798	1680803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_018641	CTGTT	2	10	1681729	1681738	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5112	NC_018641	GTT	2	6	1681749	1681754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_018641	GTC	2	6	1681832	1681837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_018641	T	6	6	1685292	1685297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_018641	A	7	7	1688578	1688584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5120	NC_018641	T	6	6	1688630	1688635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_018641	CAA	2	6	1688829	1688834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_018641	A	6	6	1688869	1688874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_018641	ATT	2	6	1688992	1688997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_018641	CCTTT	2	10	1690697	1690706	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5125	NC_018641	ATT	2	6	1691595	1691600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_018641	CAA	2	6	1691621	1691626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5129	NC_018641	ATCA	2	8	1694097	1694104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_018641	AAT	2	6	1694187	1694192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_018641	GCA	2	6	1694235	1694240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_018641	CTA	2	6	1694269	1694274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_018641	TCCGA	2	10	1694737	1694746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5134	NC_018641	TTG	2	6	1694772	1694777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5136	NC_018641	T	6	6	1696243	1696248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_018641	ATA	2	6	1696256	1696261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_018641	A	6	6	1697372	1697377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_018641	GCT	2	6	1697378	1697383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_018641	ACC	2	6	1697409	1697414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5142	NC_018641	AC	3	6	1699839	1699844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5143	NC_018641	TCC	2	6	1701020	1701025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5144	NC_018641	CGG	2	6	1701981	1701986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_018641	TTTGA	2	10	1701991	1702000	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_018641	GTG	2	6	1702055	1702060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5148	NC_018641	CCT	2	6	1702098	1702103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5149	NC_018641	TTCT	2	8	1702186	1702193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5150	NC_018641	TCC	3	9	1702243	1702251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5151	NC_018641	ATC	2	6	1702308	1702313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5152	NC_018641	AGAT	2	8	1702375	1702382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_018641	CTT	2	6	1702416	1702421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5154	NC_018641	AAC	2	6	1702437	1702442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5155	NC_018641	ATC	2	6	1702449	1702454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5157	NC_018641	TAAAA	2	10	1702489	1702498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_018641	GC	3	6	1703327	1703332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5159	NC_018641	GCA	2	6	1703345	1703350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_018641	AACT	2	8	1704315	1704322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5164	NC_018641	AAT	2	6	1704324	1704329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_018641	TTA	2	6	1704335	1704340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_018641	ATT	2	6	1704346	1704351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5172	NC_018641	TTAA	2	8	1705224	1705231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_018641	AAT	2	6	1705232	1705237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_018641	A	7	7	1705688	1705694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5175	NC_018641	AGAT	2	8	1705722	1705729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5176	NC_018641	ATTC	2	8	1705804	1705811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5178	NC_018641	AAC	2	6	1705881	1705886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5203	NC_018641	CAAA	2	8	1706998	1707005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5204	NC_018641	TTG	2	6	1707041	1707046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5230	NC_018641	AGCAT	2	10	1718591	1718600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5231	NC_018641	CAAA	2	8	1718605	1718612	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5232	NC_018641	CCGCG	2	10	1718622	1718631	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5236	NC_018641	TCACC	2	10	1722384	1722393	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5240	NC_018641	TCCT	2	8	1726313	1726320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5241	NC_018641	ATT	3	9	1726330	1726338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_018641	ACT	2	6	1726551	1726556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5243	NC_018641	ACA	2	6	1726661	1726666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5244	NC_018641	TGT	2	6	1726690	1726695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_018641	A	7	7	1726832	1726838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_018641	AGC	2	6	1726851	1726856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_018641	CCT	2	6	1727246	1727251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5250	NC_018641	CCT	2	6	1732513	1732518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5252	NC_018641	CACT	2	8	1732607	1732614	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_018641	TAC	2	6	1732657	1732662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_018641	T	6	6	1732715	1732720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_018641	AGC	2	6	1737131	1737136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5256	NC_018641	GTC	2	6	1737144	1737149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_018641	TTA	2	6	1741857	1741862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_018641	TCG	2	6	1741958	1741963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_018641	GCTGT	2	10	1742114	1742123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5262	NC_018641	CAC	2	6	1743681	1743686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_018641	TCC	2	6	1745573	1745578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_018641	GAC	2	6	1745599	1745604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5282	NC_018641	AATC	2	8	1749375	1749382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5283	NC_018641	ACA	2	6	1749437	1749442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5286	NC_018641	CATT	2	8	1749509	1749516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5292	NC_018641	ATG	2	6	1749655	1749660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5294	NC_018641	ATT	2	6	1749769	1749774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5295	NC_018641	TCAA	2	8	1749839	1749846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5299	NC_018641	CTGAG	2	10	1751980	1751989	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5306	NC_018641	AGCC	2	8	1752196	1752203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5322	NC_018641	ATG	2	6	1753134	1753139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5326	NC_018641	GCCA	2	8	1753351	1753358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5331	NC_018641	AAT	2	6	1753633	1753638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5332	NC_018641	TC	3	6	1753645	1753650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5333	NC_018641	CTT	2	6	1754487	1754492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5334	NC_018641	T	6	6	1754491	1754496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5342	NC_018641	A	6	6	1757267	1757272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5343	NC_018641	A	6	6	1759178	1759183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5344	NC_018641	TTGT	2	8	1759390	1759397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5347	NC_018641	TTA	2	6	1759521	1759526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5359	NC_018641	A	7	7	1765716	1765722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_018641	CGT	2	6	1767572	1767577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5362	NC_018641	T	6	6	1767669	1767674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_018641	A	6	6	1767679	1767684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_018641	GA	3	6	1767686	1767691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_018641	TC	3	6	1767712	1767717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5366	NC_018641	AAT	2	6	1771669	1771674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5373	NC_018641	ATGA	2	8	1773215	1773222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_018641	TCA	2	6	1773234	1773239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5376	NC_018641	TTG	2	6	1773297	1773302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5378	NC_018641	AAC	2	6	1777310	1777315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5380	NC_018641	AGTT	2	8	1778142	1778149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_018641	A	7	7	1778176	1778182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_018641	AATG	2	8	1778408	1778415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_018641	T	7	7	1778441	1778447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5384	NC_018641	GTG	2	6	1778499	1778504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_018641	CTGCGA	2	12	1778549	1778560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5386	NC_018641	TGCCA	2	10	1778703	1778712	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5387	NC_018641	CGC	2	6	1778715	1778720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5388	NC_018641	T	6	6	1778750	1778755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_018641	GAA	2	6	1778809	1778814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5390	NC_018641	TCTAA	2	10	1780200	1780209	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5391	NC_018641	A	6	6	1786126	1786131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_018641	T	6	6	1786144	1786149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_018641	AC	4	8	1789874	1789881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_018641	CCT	2	6	1789916	1789921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5395	NC_018641	TCA	2	6	1789951	1789956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5397	NC_018641	AGCC	2	8	1790278	1790285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5432	NC_018641	GAA	2	6	1803527	1803532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5434	NC_018641	TCT	2	6	1803547	1803552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5500	NC_018641	GCT	2	6	1833385	1833390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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