MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018610	TCTTT	2	10	1747	1756	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018610	TCATT	2	10	3078	3087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018610	GTAAA	2	10	12176	12185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018610	AATGA	2	10	15998	16007	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018610	TGAGA	2	10	16095	16104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018610	GTTTA	2	10	20383	20392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018610	CTAAA	2	10	21841	21850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018610	TAAAA	2	10	56425	56434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018610	ACTTG	2	10	67167	67176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018610	AAATC	2	10	67194	67203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018610	ATTAG	2	10	81354	81363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018610	GAAAA	2	10	93226	93235	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018610	TCCAA	2	10	127110	127119	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018610	GTTTA	2	10	128063	128072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018610	GTTGG	2	10	129978	129987	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018610	TGATT	2	10	133002	133011	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018610	TGCTT	2	10	133078	133087	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018610	CCATA	2	10	154528	154537	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018610	AATTT	2	10	167639	167648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018610	ATTAA	2	10	182417	182426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018610	ATTCA	2	10	186541	186550	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018610	TGTGG	2	10	199425	199434	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018610	CAATT	2	10	212060	212069	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018610	AAATC	2	10	213853	213862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018610	CAAAA	2	10	220012	220021	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018610	AAAGG	2	10	220885	220894	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018610	TAACA	2	10	221835	221844	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018610	TTGGG	2	10	221995	222004	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018610	ATTTC	2	10	224313	224322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018610	AACAA	2	10	236434	236443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018610	TTTTA	2	10	237635	237644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018610	TGATA	2	10	244191	244200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018610	ATAAA	2	10	248970	248979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018610	AATTT	2	10	260291	260300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018610	TGACA	2	10	270556	270565	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018610	TAGTC	2	10	278891	278900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018610	AATTA	2	10	278955	278964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018610	CGAAG	2	10	286498	286507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018610	TTGGT	2	10	290004	290013	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018610	GTGGA	2	10	290173	290182	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018610	AATTT	2	10	290214	290223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018610	ACATT	2	10	301878	301887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018610	GAAGA	2	10	301929	301938	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018610	GTTTT	2	10	302052	302061	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018610	AATTG	2	10	319792	319801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018610	CATGC	2	10	329441	329450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018610	TTTCT	2	10	329680	329689	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018610	TTTGT	2	10	333377	333386	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018610	TGGAT	2	10	334200	334209	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018610	AAATA	2	10	341193	341202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018610	TTAAA	2	10	351209	351218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018610	TTGAT	2	10	365340	365349	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018610	TCCTT	2	10	367738	367747	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018610	GTTTT	2	10	368802	368811	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018610	AGTTT	2	10	387652	387661	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018610	TTATC	2	10	400259	400268	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018610	TGATT	2	10	401533	401542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018610	AGGAA	2	10	401786	401795	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018610	TTTAC	2	10	401819	401828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018610	CTCTT	2	10	406212	406221	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018610	TAGGC	2	10	416616	416625	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018610	TGAAA	2	10	426785	426794	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018610	TTATG	2	10	431039	431048	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018610	AATAT	2	10	461250	461259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018610	CAAAC	2	10	479217	479226	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_018610	AATAT	2	10	479480	479489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018610	TGAAT	2	10	479566	479575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018610	GGAAT	2	10	484553	484562	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018610	AATCC	2	10	492109	492118	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018610	AAATC	2	10	492556	492565	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018610	TAGGC	2	10	496952	496961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018610	TAAAA	2	10	501621	501630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018610	AAAAT	2	10	508929	508938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018610	GGTAT	2	10	510000	510009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018610	GAGTG	2	10	516210	516219	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018610	TTTTA	2	10	532389	532398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018610	AATCA	2	10	540139	540148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018610	ATTTT	2	10	547982	547991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018610	GTACC	2	10	549593	549602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_018610	TTTGT	2	10	550740	550749	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018610	TTATA	2	10	559706	559715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018610	AATTT	2	10	567305	567314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018610	GTGTT	2	10	567391	567400	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018610	AAATC	2	10	567419	567428	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018610	TTTGC	2	10	579569	579578	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018610	ATTTA	2	10	599917	599926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018610	TGAAT	2	10	607730	607739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018610	TAGTA	2	10	616851	616860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018610	TGAAT	2	10	625257	625266	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018610	ATATA	2	10	628034	628043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018610	AAAAG	2	10	632541	632550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018610	TTCGT	2	10	636338	636347	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018610	GGTGC	2	10	638992	639001	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018610	GATAT	2	10	643164	643173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018610	TATTC	2	10	644347	644356	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018610	TTTTA	2	10	658350	658359	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018610	TAAAA	2	10	678961	678970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018610	AAGGT	2	10	683070	683079	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018610	TAGGC	2	10	690984	690993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018610	CGAAA	2	10	694761	694770	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018610	ATTTG	2	10	698750	698759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018610	TGATT	2	10	702426	702435	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018610	TGAAT	2	10	705078	705087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018610	TCATC	2	10	709721	709730	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018610	ATTTT	2	10	717537	717546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018610	AAATA	2	10	717838	717847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018610	TAGGC	2	10	719621	719630	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018610	CCAAA	2	10	723883	723892	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_018610	AGATA	2	10	725816	725825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018610	CATCA	2	10	729309	729318	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018610	TGAGC	2	10	730587	730596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018610	GTCTG	2	10	733157	733166	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018610	TCGTG	2	10	733491	733500	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018610	GTTAA	2	10	734408	734417	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018610	TTATG	2	10	768996	769005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018610	AGAAA	2	10	773897	773906	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018610	TAATA	2	10	784811	784820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018610	TAATC	2	10	798845	798854	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018610	TTCTA	2	10	809466	809475	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018610	AGGAA	2	10	809693	809702	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018610	TAATC	2	10	821804	821813	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018610	TTCAA	2	10	838453	838462	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018610	TTCAA	2	10	838577	838586	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018610	GTCTG	2	10	854839	854848	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018610	TCGTG	2	10	855173	855182	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018610	GTTAA	2	10	856090	856099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018610	AACAT	2	10	865212	865221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018610	TATAT	2	10	872210	872219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018610	TGAAT	2	10	882563	882572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018610	TCGCA	2	10	883177	883186	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_018610	AATTA	2	10	884207	884216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018610	ACATC	2	10	886354	886363	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018610	TTTGA	2	10	905109	905118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018610	TCGAT	2	10	906636	906645	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018610	TAGGC	2	10	909736	909745	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018610	TACGA	2	10	920871	920880	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018610	ATACA	2	10	922858	922867	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018610	AAAAT	2	10	932488	932497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018610	GAGAA	2	10	932625	932634	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018610	GCCAT	2	10	933689	933698	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_018610	AAAGT	2	10	945091	945100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018610	ATTCA	2	10	947766	947775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018610	TAATT	2	10	954450	954459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018610	AAGTA	2	10	973643	973652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018610	TTTTC	2	10	973754	973763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018610	TTTTG	2	10	973813	973822	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018610	CTTTT	2	10	974016	974025	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_018610	TATTT	2	10	987921	987930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018610	TACTT	2	10	1014460	1014469	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_018610	GAACC	2	10	2021304	2021313	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
282	NC_018610	GTTCA	2	10	2021343	2021352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
283	NC_018610	ATTCA	2	10	2025086	2025095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_018610	TAATA	2	10	2026377	2026386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_018610	GTTTG	2	10	2041965	2041974	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.