MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 7178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018610	GTTA	2	8	1788277	1788284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_018610	A	6	6	1788303	1788308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_018610	TAT	2	6	1788309	1788314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_018610	AATT	2	8	1788350	1788357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018610	GAT	2	6	1788425	1788430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_018610	TCA	2	6	1788449	1788454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_018610	TTCA	2	8	1788470	1788477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_018610	TCC	2	6	1789772	1789777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_018610	ACC	2	6	1789834	1789839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_018610	GCA	2	6	1789894	1789899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_018610	ACCA	2	8	1789945	1789952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_018610	TC	3	6	1789956	1789961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_018610	AATC	2	8	1790013	1790020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_018610	ATT	2	6	1790686	1790691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_018610	ATC	2	6	1790713	1790718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_018610	AGA	2	6	1790756	1790761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_018610	ATA	2	6	1791914	1791919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018610	TAAT	2	8	1791955	1791962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_018610	AAT	2	6	1793470	1793475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018610	A	7	7	1793498	1793504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_018610	CTT	2	6	1793586	1793591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_018610	CAA	2	6	1793603	1793608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_018610	CTTC	2	8	1793665	1793672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_018610	TGA	2	6	1793693	1793698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018610	GATT	2	8	1793718	1793725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018610	GTT	2	6	1793732	1793737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_018610	A	7	7	1794326	1794332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_018610	CAA	2	6	1795057	1795062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_018610	GTAT	2	8	1795070	1795077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018610	ATT	2	6	1795149	1795154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_018610	TAT	2	6	1798347	1798352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_018610	ATA	2	6	1798360	1798365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018610	ATA	2	6	1798379	1798384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_018610	A	7	7	1798421	1798427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018610	CTA	2	6	1801274	1801279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_018610	ATT	2	6	1801282	1801287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018610	TCCG	2	8	1801425	1801432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_018610	TCCG	2	8	1801518	1801525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_018610	ATA	2	6	1802235	1802240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_018610	TGG	2	6	1802302	1802307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_018610	TC	3	6	1802321	1802326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_018610	ATG	2	6	1802352	1802357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018610	TGC	2	6	1802409	1802414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_018610	GCA	2	6	1802441	1802446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_018610	GCA	2	6	1802533	1802538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_018610	GCA	2	6	1802625	1802630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_018610	A	6	6	1802723	1802728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_018610	CCT	2	6	1802754	1802759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_018610	ATC	2	6	1802915	1802920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_018610	TAAT	2	8	1802921	1802928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018610	TCAAA	2	10	1803248	1803257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5052	NC_018610	AT	3	6	1805586	1805591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_018610	TCA	2	6	1805595	1805600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_018610	ATA	2	6	1805601	1805606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018610	CAA	2	6	1805616	1805621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_018610	TA	3	6	1805633	1805638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018610	A	6	6	1805643	1805648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_018610	AG	3	6	1805789	1805794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_018610	TAT	2	6	1805850	1805855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_018610	AGC	2	6	1805878	1805883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_018610	TCC	2	6	1806577	1806582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_018610	AT	3	6	1806615	1806620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_018610	TCCC	2	8	1807460	1807467	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5064	NC_018610	ATGT	2	8	1807470	1807477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_018610	A	6	6	1807482	1807487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_018610	ATT	2	6	1807501	1807506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_018610	GTC	2	6	1807542	1807547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_018610	TCC	2	6	1807764	1807769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_018610	A	7	7	1808804	1808810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018610	TGA	2	6	1810418	1810423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_018610	TCGG	2	8	1810474	1810481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_018610	T	6	6	1810942	1810947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_018610	CCCT	2	8	1810985	1810992	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5079	NC_018610	TCG	2	6	1811285	1811290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_018610	CT	3	6	1811327	1811332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_018610	TTCAA	2	10	1811374	1811383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5082	NC_018610	ATTT	2	8	1813559	1813566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_018610	ATG	2	6	1815104	1815109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5085	NC_018610	ATT	2	6	1815696	1815701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_018610	ATTT	2	8	1815705	1815712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_018610	TC	3	6	1818871	1818876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_018610	ACA	3	9	1819976	1819984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_018610	T	6	6	1820002	1820007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_018610	TAT	2	6	1820011	1820016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_018610	AAT	2	6	1820114	1820119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018610	GTG	2	6	1820164	1820169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018610	TCG	2	6	1820176	1820181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_018610	CTGC	2	8	1820185	1820192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_018610	CGC	2	6	1820246	1820251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_018610	CAA	2	6	1820263	1820268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_018610	CTT	2	6	1820311	1820316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_018610	GCCA	2	8	1820546	1820553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_018610	GCG	2	6	1820582	1820587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_018610	GTTAA	2	10	1820673	1820682	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_018610	ATC	2	6	1820715	1820720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_018610	CAAAA	2	10	1820723	1820732	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5103	NC_018610	ATC	2	6	1822978	1822983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_018610	A	6	6	1822996	1823001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_018610	TAA	2	6	1823087	1823092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_018610	TC	3	6	1823197	1823202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_018610	CT	3	6	1823214	1823219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_018610	CTCTT	2	10	1823240	1823249	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5109	NC_018610	TAA	2	6	1823268	1823273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_018610	ATC	2	6	1823288	1823293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_018610	ACA	2	6	1823294	1823299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_018610	T	6	6	1824714	1824719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_018610	TAAA	2	8	1824763	1824770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_018610	ATG	2	6	1824793	1824798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_018610	GGT	2	6	1824802	1824807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_018610	AAT	2	6	1824842	1824847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_018610	ATT	2	6	1824887	1824892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5119	NC_018610	ACGCAA	2	12	1826389	1826400	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_018610	ATG	2	6	1827200	1827205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_018610	CAT	2	6	1827242	1827247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_018610	TCC	2	6	1827994	1827999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_018610	TCA	2	6	1828000	1828005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_018610	TTTAC	2	10	1828012	1828021	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5125	NC_018610	CATT	2	8	1828061	1828068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_018610	GGA	2	6	1828079	1828084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_018610	ATT	2	6	1828606	1828611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_018610	TTC	2	6	1830772	1830777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_018610	T	7	7	1830834	1830840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_018610	GGA	2	6	1830906	1830911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_018610	CTG	2	6	1834228	1834233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_018610	AGG	2	6	1834300	1834305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_018610	AATG	2	8	1834331	1834338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_018610	GGA	2	6	1834405	1834410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_018610	CAT	2	6	1834412	1834417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_018610	TCC	2	6	1836546	1836551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5137	NC_018610	AGCA	2	8	1836598	1836605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5138	NC_018610	ATT	2	6	1837128	1837133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_018610	ATTA	2	8	1837157	1837164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_018610	TA	3	6	1837173	1837178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_018610	CTTG	2	8	1837199	1837206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5142	NC_018610	GA	3	6	1837250	1837255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_018610	TAAA	2	8	1837267	1837274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_018610	CAA	2	6	1839514	1839519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_018610	T	6	6	1839540	1839545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_018610	A	6	6	1840758	1840763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_018610	AT	3	6	1841378	1841383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_018610	ATCT	2	8	1841401	1841408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5149	NC_018610	TAAA	2	8	1842834	1842841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_018610	ATT	2	6	1842853	1842858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_018610	TGG	2	6	1844069	1844074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_018610	CA	3	6	1844103	1844108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5153	NC_018610	AG	3	6	1844135	1844140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5154	NC_018610	T	6	6	1849890	1849895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_018610	CAT	2	6	1849944	1849949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5158	NC_018610	ATTTT	2	10	1852812	1852821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5160	NC_018610	A	6	6	1852920	1852925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_018610	T	6	6	1853470	1853475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_018610	TAT	2	6	1853477	1853482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_018610	CAA	2	6	1853634	1853639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5164	NC_018610	TTC	2	6	1853677	1853682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5165	NC_018610	ATTT	3	12	1855514	1855525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_018610	GTC	2	6	1855557	1855562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5171	NC_018610	CCT	2	6	1858368	1858373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5172	NC_018610	ATTAT	2	10	1858387	1858396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_018610	TACT	2	8	1859292	1859299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5226	NC_018610	TG	3	6	1886245	1886250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_018610	A	7	7	1895324	1895330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_018610	ATTTT	2	10	1895341	1895350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5261	NC_018610	A	6	6	1895516	1895521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_018610	TTA	2	6	1895575	1895580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5265	NC_018610	ATT	2	6	1898242	1898247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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