MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC5850

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018592	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018592	GCAAAA	2	12	14090	14101	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018592	AGAAAA	2	12	76628	76639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018592	CAACTG	2	12	138175	138186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018592	AATAAA	2	12	194012	194023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018592	GAAAAC	2	12	220548	220559	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018592	ATTCAA	2	12	231435	231446	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018592	AAGGAA	2	12	233006	233017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018592	TAGGCG	2	12	234659	234670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018592	ATTCAA	2	12	237457	237468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018592	AAGGAA	2	12	239028	239039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018592	TAGGCG	2	12	240681	240692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018592	AGTCAA	2	12	242496	242507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018592	TTATAT	2	12	257279	257290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018592	AACTTT	2	12	282342	282353	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018592	AATACA	2	12	290933	290944	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018592	TTGGTT	2	12	332145	332156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018592	AAATGA	2	12	388611	388622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018592	ATGATA	2	12	390430	390441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018592	AGTGCT	2	12	402061	402072	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018592	TTGTTT	2	12	410740	410751	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018592	ACAAAA	2	12	465763	465774	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018592	TTAAAT	2	12	489280	489291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018592	CTATAA	2	12	491049	491060	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018592	AGATTT	2	12	550564	550575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018592	ATCATT	2	12	620699	620710	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018592	ATCATT	2	12	663373	663384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018592	TATAGG	2	12	707864	707875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018592	ATCTCA	2	12	737916	737927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018592	TACAAA	2	12	759238	759249	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018592	AGAAAA	2	12	759368	759379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018592	TTACTT	2	12	834488	834499	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018592	TGAAAT	2	12	844356	844367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018592	AAATAG	2	12	870958	870969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018592	GTAATC	2	12	877760	877771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018592	TTACAA	2	12	877778	877789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018592	ATGAAA	2	12	886384	886395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018592	TTGACT	2	12	1010412	1010423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018592	AGGAAG	2	12	1020605	1020616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018592	CTTTTT	2	12	1080346	1080357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018592	TTATGG	2	12	1118538	1118549	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018592	TTTAGT	2	12	1122546	1122557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018592	TTTTAA	2	12	1157081	1157092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018592	CTTTTT	2	12	1195075	1195086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018592	GAAAAA	2	12	1225058	1225069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018592	GATATT	2	12	1230432	1230443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018592	AAGACG	2	12	1244519	1244530	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018592	TATTAA	2	12	1295116	1295127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018592	TATTAA	2	12	1445866	1445877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018592	ATAAAA	2	12	1480046	1480057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018592	TTTCAT	2	12	1488440	1488451	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018592	CTCTTC	2	12	1591113	1591124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018592	GGTATA	2	12	1624368	1624379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018592	GGTTGT	2	12	1641765	1641776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018592	GGTTGT	2	12	1643236	1643247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018592	AAGAAT	2	12	1644788	1644799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018592	GTAAAC	2	12	1645941	1645952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018592	AAAATA	2	12	1658885	1658896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018592	TAAAAA	2	12	1659795	1659806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018592	TAAAAA	2	12	1686538	1686549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018592	ATGAAA	2	12	1705493	1705504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018592	CGCCTA	2	12	1746276	1746287	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018592	TTTCCT	2	12	1747928	1747939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018592	AAAAAC	2	12	1819815	1819826	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018592	CGCCTA	2	12	1850249	1850260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018592	TTTCCT	2	12	1851901	1851912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018592	TTGAAT	2	12	1853473	1853484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018592	GTTTTA	2	12	1861392	1861403	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018592	AAAAAG	2	12	1944018	1944029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018592	CTCTAT	2	12	1961737	1961748	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018592	TCATTT	2	12	1962935	1962946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018592	GTTTTC	2	12	1990103	1990114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018592	CAAAAA	2	12	2007829	2007840	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018592	GAAAAA	2	12	2011690	2011701	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018592	TTTTAT	2	12	2107387	2107398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018592	ATTCAA	2	12	2165025	2165036	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018592	TTATAT	2	12	2227974	2227985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018592	AATTTT	2	12	2282053	2282064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018592	AAATTG	2	12	2288228	2288239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018592	CTCTGT	2	12	2295074	2295085	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018592	ATAAAT	2	12	2333182	2333193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018592	TAATAC	2	12	2378170	2378181	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018592	CGCCTA	2	12	2398915	2398926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018592	TTTCCT	2	12	2400818	2400829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018592	TTGAAT	2	12	2402390	2402401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018592	TAAAAT	2	12	2477387	2477398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018592	TTCAAA	2	12	2486029	2486040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018592	CTTTTT	2	12	2551257	2551268	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018592	ATCCCA	2	12	2571172	2571183	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018592	AAAAGA	2	12	2577003	2577014	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018592	TTTTTA	2	12	2582999	2583010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018592	CGCCTA	2	12	2633013	2633024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018592	TTTCCT	2	12	2634916	2634927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018592	TTGAAT	2	12	2636488	2636499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018592	TTATCA	2	12	2643064	2643075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018592	TCTAGG	2	12	2643858	2643869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018592	CCTCTT	2	12	2688500	2688511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018592	TAAATC	2	12	2709971	2709982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018592	TTAACT	2	12	2824463	2824474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018592	AAATGA	2	12	2850698	2850709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018592	AAGTAT	2	12	2851635	2851646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018592	CAGAGA	2	12	2854567	2854578	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018592	TCTGAC	2	12	2854628	2854639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.