MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018591	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018591	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018591	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018591	CAGATT	2	12	98011	98022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018591	CAGGTT	2	12	147273	147284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018591	ACACTT	2	12	172801	172812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018591	AATAAA	2	12	199121	199132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018591	GAAAAC	2	12	226146	226157	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018591	ATTCAA	2	12	236630	236641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018591	AAGGAA	2	12	238201	238212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018591	TAGGCG	2	12	239854	239865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018591	ATTCAA	2	12	242649	242660	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018591	AAGGAA	2	12	244220	244231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018591	TAGGCG	2	12	245873	245884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018591	AGTCAA	2	12	247687	247698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018591	TTATAT	2	12	262472	262483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018591	TTTATA	2	12	291103	291114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018591	AACTTT	2	12	298182	298193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018591	TAAAAA	2	12	303551	303562	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018591	AATACA	2	12	308002	308013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018591	CATAGA	2	12	357431	357442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018591	TAGTTT	2	12	399139	399150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018591	TTGTTT	2	12	416675	416686	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018591	ACAAAA	2	12	474950	474961	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018591	AAATGT	2	12	556474	556485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018591	AAATGT	2	12	556603	556614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018591	AAATGT	2	12	557119	557130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018591	AAATGT	2	12	566006	566017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018591	AGATTT	2	12	574137	574148	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018591	AAATAA	2	12	614439	614450	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018591	ATCATT	2	12	642800	642811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018591	TGTAAA	2	12	664738	664749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018591	TAAAAA	2	12	684269	684280	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018591	GACAAT	2	12	690538	690549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018591	AAACAA	2	12	716261	716272	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018591	ATCATT	2	12	721053	721064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018591	GAATAA	2	12	748135	748146	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018591	GTTTTA	2	12	753828	753839	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018591	TATAGG	2	12	771046	771057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018591	AATTAG	2	12	798492	798503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018591	TGTTGA	2	12	809548	809559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018591	TTACTT	2	12	888976	888987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018591	AAATAG	2	12	925423	925434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018591	GTAATC	2	12	932226	932237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018591	TTACAA	2	12	932244	932255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018591	ATGAAA	2	12	940849	940860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018591	TTGACT	2	12	1063851	1063862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018591	AGGAAG	2	12	1074041	1074052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018591	AACAAT	2	12	1113043	1113054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018591	CTTTTT	2	12	1129342	1129353	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018591	GTGCAT	2	12	1163220	1163231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018591	AATCCC	2	12	1170768	1170779	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018591	TTAATT	2	12	1172003	1172014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018591	AAATAA	2	12	1175017	1175028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018591	TTTAGT	2	12	1178906	1178917	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018591	CTTTTT	2	12	1217266	1217277	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018591	TAGATA	2	12	1238454	1238465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018591	CTTTTT	2	12	1251730	1251741	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018591	GAAAAA	2	12	1281694	1281705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018591	TATTAA	2	12	1313824	1313835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018591	GTACAA	2	12	1427114	1427125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018591	ATTAAG	2	12	1460369	1460380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018591	TAATCA	2	12	1460478	1460489	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018591	TACCAA	2	12	1478410	1478421	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018591	TTTCAT	2	12	1504572	1504583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018591	CTCTTC	2	12	1607261	1607272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018591	TAAAAA	2	12	1622722	1622733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018591	TCATTA	2	12	1643585	1643596	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018591	GGTTGT	2	12	1657909	1657920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018591	GGTTGT	2	12	1659383	1659394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018591	GAATAA	2	12	1660937	1660948	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018591	GTAAAC	2	12	1662088	1662099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018591	ACAAAA	2	12	1670712	1670723	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018591	AAAATA	2	12	1675032	1675043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018591	TAAAAA	2	12	1675942	1675953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018591	CTTATT	2	12	1761937	1761948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018591	CGCCTA	2	12	1765442	1765453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018591	TTTCCT	2	12	1767094	1767105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018591	TTGAAT	2	12	1768666	1768677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018591	CGCCTA	2	12	1868286	1868297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018591	TTTCCT	2	12	1869938	1869949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018591	TTGAAT	2	12	1871510	1871521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018591	AAATGG	2	12	1872494	1872505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018591	GTTTTG	2	12	1879462	1879473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018591	CTCTAT	2	12	1980136	1980147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018591	TCATTT	2	12	1981334	1981345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018591	GTTTTC	2	12	2008503	2008514	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018591	CAAAAA	2	12	2026228	2026239	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018591	GAAAAA	2	12	2030088	2030099	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018591	AGAAAA	2	12	2036927	2036938	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018591	TTCACT	2	12	2173867	2173878	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018591	ATTCAA	2	12	2184598	2184609	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018591	TATATT	2	12	2246091	2246102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018591	AATTTT	2	12	2303775	2303786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018591	AAATTG	2	12	2309951	2309962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018591	CTCTGT	2	12	2316795	2316806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018591	TTATTT	2	12	2371819	2371830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018591	TAATAC	2	12	2400560	2400571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018591	CGCCTA	2	12	2421356	2421367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018591	TTTCCT	2	12	2423259	2423270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018591	TTGAAT	2	12	2424831	2424842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018591	TTGTCT	2	12	2535169	2535180	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018591	TTATTT	2	12	2572589	2572600	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018591	CTTTTT	2	12	2574654	2574665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018591	ATCCCA	2	12	2594568	2594579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018591	TTTTTA	2	12	2606396	2606407	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018591	CGCCTA	2	12	2651813	2651824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018591	TTTCCT	2	12	2653716	2653727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018591	TTGAAT	2	12	2655288	2655299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018591	CCTCTT	2	12	2707068	2707079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018591	TAAATC	2	12	2734056	2734067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018591	TATCAA	2	12	2880205	2880216	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018591	TAAAAA	2	12	2880289	2880300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018591	AAGTAT	2	12	2881156	2881167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.