MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018591	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018591	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018591	AAATG	2	10	24027	24036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018591	GAAAA	2	10	34358	34367	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018591	AGATA	2	10	34615	34624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018591	AAAGG	2	10	35586	35595	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018591	TTCTA	2	10	36080	36089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018591	GACTT	2	10	51381	51390	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018591	ATGGT	2	10	53632	53641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018591	AAATA	2	10	55688	55697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018591	TAAAA	2	10	56670	56679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018591	TTATG	2	10	58877	58886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018591	AGTAG	2	10	79014	79023	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018591	TTTTA	2	10	83487	83496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018591	ATTTT	2	10	92823	92832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018591	AAATT	2	10	96865	96874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018591	AGCGG	2	10	97449	97458	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018591	GGAAA	2	10	98628	98637	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018591	ATATC	2	10	113165	113174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018591	AGAGA	2	10	127382	127391	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018591	TTACT	2	10	128821	128830	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018591	AAAGT	2	10	131062	131071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018591	GATAA	2	10	153781	153790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018591	ATATG	2	10	160761	160770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018591	TTGTA	2	10	172814	172823	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018591	ATAGA	2	10	193520	193529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018591	TTGTC	2	10	199046	199055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018591	ACAAA	2	10	199411	199420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018591	ATATA	2	10	207157	207166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018591	GTGAG	2	10	210993	211002	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018591	GAGTG	2	10	215288	215297	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018591	AGCCG	2	10	223465	223474	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_018591	GAAAA	2	10	231593	231602	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018591	GAATA	2	10	234682	234691	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018591	AAATT	2	10	236367	236376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018591	TAATT	2	10	236568	236577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018591	TCGTG	2	10	237727	237736	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018591	AAGGT	2	10	239195	239204	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018591	TAATT	2	10	242587	242596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018591	TCGTG	2	10	243746	243755	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018591	AAGGT	2	10	245214	245223	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018591	GGCAT	2	10	262506	262515	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018591	AGTGA	2	10	284621	284630	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018591	AATTA	2	10	286779	286788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018591	AGGTA	2	10	290919	290928	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018591	TGGCT	2	10	296915	296924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018591	ACTAA	2	10	298291	298300	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018591	TATAA	2	10	303517	303526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018591	AAAGA	2	10	306747	306756	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018591	TTATT	2	10	329303	329312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018591	TATCA	2	10	332232	332241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018591	ATTTT	2	10	332260	332269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018591	GAAAT	2	10	332393	332402	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018591	TAAAA	2	10	346287	346296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018591	ATTGT	2	10	356729	356738	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018591	TTTTA	2	10	366736	366745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018591	AGGAG	2	10	370877	370886	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018591	ATAGA	2	10	371180	371189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018591	GTGAT	2	10	393964	393973	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018591	GAAAC	2	10	399095	399104	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018591	ATTTT	2	10	409319	409328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018591	CAAAA	2	10	416647	416656	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018591	TAGAT	2	10	425873	425882	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018591	AGGTG	2	10	447925	447934	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018591	GGAAA	2	10	453050	453059	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018591	TTTAT	2	10	486499	486508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018591	TTTCT	2	10	490872	490881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018591	TCGAA	2	10	506745	506754	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018591	TTATT	2	10	508585	508594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018591	CTATG	2	10	508751	508760	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018591	CGAGG	2	10	510975	510984	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018591	ATACA	2	10	514670	514679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018591	AAAGA	2	10	515699	515708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018591	ATAAA	2	10	528927	528936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018591	AAAAC	2	10	540939	540948	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018591	GTTTT	2	10	540961	540970	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018591	AAACA	2	10	543459	543468	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018591	ATGGA	2	10	548827	548836	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018591	GTTTT	2	10	557160	557169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018591	TATAG	2	10	561814	561823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018591	GAAAA	2	10	565925	565934	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018591	TAGAC	2	10	582134	582143	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018591	TAAAA	2	10	588063	588072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018591	CTATG	2	10	595508	595517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018591	AAAGA	2	10	600962	600971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018591	ATAAA	2	10	615933	615942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018591	AGAAT	2	10	616803	616812	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018591	TGGAA	2	10	616931	616940	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018591	AATCA	2	10	619934	619943	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018591	TATAA	2	10	627878	627887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018591	ATTGA	2	10	627915	627924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018591	ATTAA	2	10	641223	641232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018591	ATATA	2	10	672695	672704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018591	AAATT	2	10	691467	691476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018591	CTTTT	2	10	713766	713775	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018591	TATAA	2	10	715338	715347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018591	TAAAA	2	10	715811	715820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018591	ATCAA	2	10	716411	716420	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018591	ATTTT	2	10	716430	716439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018591	TAAAA	2	10	717484	717493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018591	GAAAT	2	10	740075	740084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018591	TTACT	2	10	748097	748106	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018591	ATTTA	2	10	753749	753758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018591	GGGGA	2	10	763503	763512	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018591	TATTT	2	10	769741	769750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018591	AGAGA	2	10	769891	769900	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018591	CTTTT	2	10	770866	770875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018591	CTTTT	2	10	820508	820517	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018591	TAGTT	2	10	820521	820530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018591	TGAAA	2	10	839418	839427	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018591	AATGA	2	10	856305	856314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018591	GTATA	2	10	875821	875830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018591	AATAA	2	10	880235	880244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018591	ATTTT	2	10	883821	883830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018591	GTTTT	2	10	896756	896765	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018591	AAATT	2	10	897833	897842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018591	AGGAA	2	10	898356	898365	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018591	GATGA	2	10	910446	910455	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018591	ATAGA	2	10	919153	919162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018591	ATCTT	2	10	920333	920342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018591	TAATT	2	10	924542	924551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018591	ATTTT	2	10	924809	924818	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018591	AATGT	2	10	932210	932219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018591	TTATA	2	10	955949	955958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018591	ATAAC	2	10	971941	971950	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018591	TTTTA	2	10	973405	973414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018591	ATAGA	2	10	977317	977326	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018591	TATAA	2	10	991578	991587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018591	TGAAA	2	10	1001070	1001079	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018591	ATTTT	2	10	1006527	1006536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018591	TTTAT	2	10	1006762	1006771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018591	ATGAG	2	10	1026538	1026547	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018591	TTTTA	2	10	1033669	1033678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018591	TAAAA	2	10	1033734	1033743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018591	TATAA	2	10	1048206	1048215	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018591	TCTAT	2	10	1060977	1060986	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018591	AGATA	2	10	1064666	1064675	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018591	GAGAG	2	10	1073609	1073618	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018591	AAATG	2	10	1078267	1078276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018591	TTCTA	2	10	1078282	1078291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018591	CAAAC	2	10	1078448	1078457	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_018591	TTTTC	2	10	1082166	1082175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018591	AGTTT	2	10	1092061	1092070	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018591	CAAAA	2	10	1094427	1094436	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018591	ACTAA	2	10	1094606	1094615	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018591	TAGGA	2	10	1109053	1109062	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018591	GTTTT	2	10	1109063	1109072	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_018591	AAAAG	2	10	2622479	2622488	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_018591	TCGTT	2	10	2659732	2659741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
333	NC_018591	CAAGG	2	10	2659778	2659787	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
334	NC_018591	GAAAA	2	10	2659809	2659818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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350	NC_018591	GGCTA	2	10	2783218	2783227	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.