MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2376

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018590	TACAT	2	10	290	299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018590	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018590	AAATG	2	10	26034	26043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018590	AAATA	2	10	46923	46932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018590	TAAAA	2	10	47905	47914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018590	CCATG	2	10	50041	50050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018590	TTTTG	2	10	55758	55767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018590	AAGAT	2	10	69455	69464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018590	GGTAG	2	10	99886	99895	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018590	ATATC	2	10	106651	106660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018590	TACTG	2	10	118921	118930	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018590	AAAGT	2	10	121159	121168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018590	AGTAG	2	10	135488	135497	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018590	ATAAA	2	10	136700	136709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018590	GATAA	2	10	138877	138886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018590	TTGTA	2	10	158415	158424	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018590	ATAGA	2	10	179088	179097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018590	TTGTC	2	10	184610	184619	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018590	AAAAT	2	10	184689	184698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018590	ACAAA	2	10	184975	184984	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018590	ATATA	2	10	192710	192719	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018590	GTGAG	2	10	196546	196555	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018590	ATTTA	2	10	197608	197617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018590	GAGTG	2	10	200833	200842	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018590	AGCCG	2	10	209012	209021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_018590	TTTTC	2	10	216985	216994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018590	GAAAA	2	10	217136	217145	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018590	GAAAA	2	10	217340	217349	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018590	GAATA	2	10	220427	220436	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018590	AAATT	2	10	222112	222121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018590	TAATT	2	10	222313	222322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018590	TCGTG	2	10	223472	223481	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018590	AAGGT	2	10	224940	224949	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018590	TAATT	2	10	228310	228319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018590	TCGTG	2	10	229469	229478	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018590	AAGGT	2	10	230937	230946	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018590	GGCAT	2	10	248238	248247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018590	GTAGT	2	10	253941	253950	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018590	AGTGA	2	10	265915	265924	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018590	TTTAA	2	10	269851	269860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018590	TGGCT	2	10	275143	275152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018590	ACTAA	2	10	278211	278220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018590	AAAGA	2	10	290317	290326	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018590	ATAAA	2	10	301104	301113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018590	TTATT	2	10	315193	315202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018590	ATTGT	2	10	345067	345076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018590	ATAGA	2	10	355785	355794	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018590	AAAAT	2	10	361939	361948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018590	CACAC	2	10	365587	365596	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_018590	TGAAA	2	10	367068	367077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018590	GTGAT	2	10	382467	382476	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018590	GAAAC	2	10	387597	387606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018590	AAAAG	2	10	389439	389448	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018590	CAAAA	2	10	413330	413339	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018590	AGGTG	2	10	441808	441817	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018590	GGAAA	2	10	449411	449420	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018590	TAAAA	2	10	458364	458373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018590	AACAT	2	10	466673	466682	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018590	AAGAA	2	10	471338	471347	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018590	CTTAT	2	10	473123	473132	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018590	ATTTT	2	10	504004	504013	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018590	ATACA	2	10	508494	508503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018590	CAATC	2	10	511097	511106	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018590	AAACA	2	10	533884	533893	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018590	TATAG	2	10	543687	543696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018590	TAGAC	2	10	564017	564026	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018590	TAAAA	2	10	569944	569953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018590	AAAGA	2	10	582818	582827	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018590	ATAAA	2	10	597777	597786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018590	AATCA	2	10	601753	601762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018590	ATTGA	2	10	609714	609723	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018590	ATTAA	2	10	623026	623035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018590	TAAAA	2	10	647474	647483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018590	GAAAT	2	10	655069	655078	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018590	ATCAA	2	10	658088	658097	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018590	ATTTT	2	10	658107	658116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018590	GAAAT	2	10	681099	681108	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018590	TTACT	2	10	686446	686455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018590	TTATC	2	10	691370	691379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018590	TTCTA	2	10	692373	692382	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018590	GGGGA	2	10	704758	704767	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018590	TATTT	2	10	710995	711004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018590	AGAGA	2	10	711145	711154	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018590	CTTTT	2	10	712120	712129	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018590	TATAA	2	10	736261	736270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018590	CTTTT	2	10	762138	762147	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018590	AAAAT	2	10	781659	781668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018590	GTATA	2	10	815614	815623	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018590	TAATA	2	10	818277	818286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018590	AATAA	2	10	820029	820038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018590	ATTTT	2	10	823615	823624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018590	TAATA	2	10	837823	837832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018590	TTTTA	2	10	838658	838667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018590	ATAGA	2	10	853564	853573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018590	TTTTA	2	10	857674	857683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018590	AATGT	2	10	865074	865083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018590	TTATA	2	10	888810	888819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018590	GCTAT	2	10	908457	908466	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018590	ATAGA	2	10	910178	910187	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018590	TATAA	2	10	924439	924448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018590	TGAAA	2	10	933932	933941	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018590	TTTTA	2	10	941334	941343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018590	TTTAT	2	10	941626	941635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018590	ATGAG	2	10	961404	961413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018590	TTTTA	2	10	968538	968547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018590	TAAAA	2	10	968603	968612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018590	TATAA	2	10	983065	983074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018590	TCTAT	2	10	995838	995847	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018590	AGATA	2	10	999535	999544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018590	GAGAG	2	10	1008463	1008472	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018590	TTCTA	2	10	1013136	1013145	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018590	CAAAC	2	10	1013302	1013311	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018590	TTTTC	2	10	1017021	1017030	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018590	GTTTT	2	10	1026917	1026926	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018590	TTTAG	2	10	1029321	1029330	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018590	ATAAA	2	10	1029340	1029349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018590	TAAAA	2	10	1029351	1029360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018590	ACTAA	2	10	1029463	1029472	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018590	TAGGA	2	10	1043921	1043930	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018590	GTTTT	2	10	1043931	1043940	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018590	CTTTT	2	10	1048428	1048437	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018590	AAAGC	2	10	1054358	1054367	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018590	TTATT	2	10	1054401	1054410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018590	AAGTT	2	10	1058103	1058112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018590	ATAAA	2	10	1058157	1058166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018590	GCTAT	2	10	1059029	1059038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018590	AATAA	2	10	1061090	1061099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018590	AGTAA	2	10	1069028	1069037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018590	CAAAT	2	10	1095893	1095902	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018590	GTATA	2	10	1113499	1113508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018590	AAATA	2	10	1145646	1145655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018590	TAAAA	2	10	1179322	1179331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018590	ATTTA	2	10	1179350	1179359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018590	TCTTT	2	10	1198847	1198856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018590	ACTTG	2	10	1214224	1214233	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018590	AGAGA	2	10	1214259	1214268	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018590	AAGAA	2	10	1216721	1216730	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018590	TACTA	2	10	1225701	1225710	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018590	TAAAA	2	10	1225746	1225755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018590	AACTA	2	10	1232454	1232463	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018590	TGATT	2	10	1261231	1261240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018590	TACTT	2	10	1271682	1271691	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018590	TTTAT	2	10	1287348	1287357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018590	GAATA	2	10	1287555	1287564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018590	TTAAA	2	10	1346147	1346156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018590	ATACT	2	10	1356976	1356985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_018590	TAAAA	2	10	1460564	1460573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_018590	TCATT	2	10	1477321	1477330	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_018590	TATCA	2	10	1662192	1662201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_018590	TTTCA	2	10	1716695	1716704	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_018590	TATTT	2	10	2381668	2381677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_018590	TCCTC	2	10	2386068	2386077	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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285	NC_018590	TATCA	2	10	2475748	2475757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_018590	TACCA	2	10	2477192	2477201	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
287	NC_018590	TGCTG	2	10	2482519	2482528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_018590	GCTTT	2	10	2490198	2490207	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
289	NC_018590	ATAAA	2	10	2490211	2490220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018590	GTTTG	2	10	2508009	2508018	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018590	GAAAG	2	10	2519866	2519875	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018590	TAGAA	2	10	2529452	2529461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_018590	AAGTC	2	10	2534220	2534229	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
295	NC_018590	TTTAT	2	10	2534230	2534239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_018590	AAAAG	2	10	2535022	2535031	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_018590	ATTAT	2	10	2537391	2537400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_018590	TAAAA	2	10	2556730	2556739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_018590	TTTTC	2	10	2557906	2557915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_018590	TTATA	2	10	2566556	2566565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_018590	TTTTA	2	10	2566973	2566982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_018590	CACCC	2	10	2570382	2570391	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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309	NC_018590	TTTTA	2	10	2580838	2580847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_018590	ATTAA	2	10	2664445	2664454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_018590	TAAAA	2	10	2672155	2672164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_018590	CAAAC	2	10	2673150	2673159	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
323	NC_018590	CTTTT	2	10	2679810	2679819	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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327	NC_018590	TATAT	2	10	2714584	2714593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_018590	TAAAA	2	10	2752401	2752410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
329	NC_018590	TAAAA	2	10	2775365	2775374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_018590	AAACC	2	10	2776250	2776259	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
331	NC_018590	CTTTT	2	10	2776276	2776285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_018590	CACTC	2	10	2796173	2796182	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
333	NC_018590	TATCA	2	10	2839485	2839494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.