MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018587	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018587	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018587	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018587	CAGGTT	2	12	147271	147282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018587	ACACTT	2	12	172799	172810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018587	AATAAA	2	12	199116	199127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018587	GAAAAC	2	12	226139	226150	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018587	ATTCAA	2	12	237031	237042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018587	AAGGAA	2	12	238602	238613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018587	TAGGCG	2	12	240255	240266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018587	ATTCAA	2	12	243050	243061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018587	AAGGAA	2	12	244621	244632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018587	TAGGCG	2	12	246274	246285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018587	AGTCAA	2	12	248088	248099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018587	TTATAT	2	12	262873	262884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018587	AACTTT	2	12	298583	298594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018587	TAAAAA	2	12	303952	303963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018587	AATACA	2	12	308401	308412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018587	CATAGA	2	12	357830	357841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018587	TAGTTT	2	12	399538	399549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018587	TTGTTT	2	12	417074	417085	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018587	ACAAAA	2	12	475349	475360	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018587	AAATGT	2	12	556874	556885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018587	AAATGT	2	12	557003	557014	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018587	AAATGT	2	12	557519	557530	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018587	AAATGT	2	12	566405	566416	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018587	AGATTT	2	12	574536	574547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018587	AAATAA	2	12	614838	614849	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018587	ATCATT	2	12	643201	643212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018587	TGTAAA	2	12	665136	665147	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018587	ATCATT	2	12	687420	687431	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018587	GAATAA	2	12	714503	714514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018587	GTTTTA	2	12	720148	720159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018587	TATAGG	2	12	737364	737375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018587	AATTAG	2	12	764811	764822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018587	TGTTGA	2	12	775867	775878	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018587	TTACTT	2	12	855498	855509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018587	AAATAG	2	12	891206	891217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018587	GTAATC	2	12	898009	898020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018587	TTACAA	2	12	898027	898038	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018587	ATGAAA	2	12	906631	906642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018587	TTGACT	2	12	1029636	1029647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018587	AGGAAG	2	12	1039827	1039838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018587	AACAAT	2	12	1078830	1078841	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018587	CTTTTT	2	12	1095129	1095140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018587	GTGCAT	2	12	1129009	1129020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018587	AATCCC	2	12	1136556	1136567	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018587	TTAATT	2	12	1137791	1137802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018587	AAATAA	2	12	1140805	1140816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018587	TTTAGT	2	12	1144694	1144705	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018587	CTTTTT	2	12	1183054	1183065	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018587	TAGATA	2	12	1204243	1204254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018587	CTTTTT	2	12	1217518	1217529	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018587	GAAAAA	2	12	1247482	1247493	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018587	TATTAA	2	12	1279609	1279620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018587	GTACAA	2	12	1392891	1392902	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018587	ATTAAG	2	12	1426146	1426157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018587	TAATCA	2	12	1426255	1426266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018587	TACCAA	2	12	1444188	1444199	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018587	TTTCAT	2	12	1470348	1470359	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018587	CTCTTC	2	12	1573035	1573046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018587	TAAAAA	2	12	1588496	1588507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018587	TCATTA	2	12	1609357	1609368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018587	GGTTGT	2	12	1623682	1623693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018587	GGTTGT	2	12	1625155	1625166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018587	GAATAA	2	12	1626709	1626720	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018587	GTAAAC	2	12	1627860	1627871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018587	ACAAAA	2	12	1636484	1636495	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018587	AAAATA	2	12	1640804	1640815	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018587	TAAAAA	2	12	1641714	1641725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018587	CTTATT	2	12	1727709	1727720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018587	CGCCTA	2	12	1731217	1731228	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018587	TTTCCT	2	12	1732869	1732880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018587	TTGAAT	2	12	1734441	1734452	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018587	CGCCTA	2	12	1888956	1888967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018587	TTTCCT	2	12	1890608	1890619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018587	TTGAAT	2	12	1892181	1892192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018587	AAATGG	2	12	1893165	1893176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018587	GTTTTG	2	12	1900133	1900144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018587	TCGGCA	2	12	1908670	1908681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018587	GCATCG	2	12	1908685	1908696	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018587	GCATCC	2	12	1908703	1908714	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018587	GCATCG	2	12	1908715	1908726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018587	TCGGCA	2	12	1908760	1908771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018587	GCATCC	3	18	1908829	1908846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018587	TCAGCG	2	12	1908850	1908861	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018587	GCATCA	3	18	1908883	1908900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018587	GCATCC	2	12	1908919	1908930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018587	GCGTCA	3	18	1908955	1908972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018587	GCGTCA	4	24	1909033	1909056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018587	GCATCC	2	12	1909081	1909092	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018587	TCCGCA	2	12	1909192	1909203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018587	TCCGCA	2	12	1909222	1909233	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018587	TCAGCA	3	18	1909240	1909257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018587	CGTAAG	2	12	1909286	1909297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018587	CATCAG	2	12	1909298	1909309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018587	ATCAGC	2	12	1909323	1909334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018587	CTCTAT	2	12	2000877	2000888	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018587	TCATTT	2	12	2002075	2002086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018587	GTTTTC	2	12	2029244	2029255	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018587	CAAAAA	2	12	2046967	2046978	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018587	GAAAAA	2	12	2050827	2050838	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018587	TTCACT	2	12	2203408	2203419	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018587	ATTCAA	2	12	2214138	2214149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018587	TATATT	2	12	2275632	2275643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018587	AATTTT	2	12	2333038	2333049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018587	AAATTG	2	12	2339214	2339225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018587	CTCTGT	2	12	2346058	2346069	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018587	TTATTT	2	12	2401078	2401089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018587	TAATAC	2	12	2429818	2429829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018587	CGCCTA	2	12	2450614	2450625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018587	TTTCCT	2	12	2452517	2452528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018587	TTGAAT	2	12	2454089	2454100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018587	TTGTCT	2	12	2564634	2564645	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018587	TTATTT	2	12	2602052	2602063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018587	CTTTTT	2	12	2604117	2604128	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018587	ATCCCA	2	12	2624030	2624041	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018587	TTTTTA	2	12	2635858	2635869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018587	CGCCTA	2	12	2681270	2681281	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018587	TTTCCT	2	12	2683173	2683184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018587	TTGAAT	2	12	2684745	2684756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018587	CCTCTT	2	12	2736526	2736537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018587	TAAATC	2	12	2763514	2763525	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018587	TATCAA	2	12	2909663	2909674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018587	TAAAAA	2	12	2909747	2909758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018587	AAGTAT	2	12	2910614	2910625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.