MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755

Total Repeats: 360

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018587	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018587	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018587	AAATG	2	10	24024	24033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018587	GAAAA	2	10	34356	34365	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018587	AGATA	2	10	34612	34621	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018587	AAAGG	2	10	35583	35592	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018587	TTCTA	2	10	36077	36086	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018587	GACTT	2	10	51378	51387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018587	ATGGT	2	10	53629	53638	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018587	AAATA	2	10	55685	55694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018587	TAAAA	2	10	56667	56676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018587	TTATG	2	10	58874	58883	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018587	AGTAG	2	10	79013	79022	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018587	TTTTA	2	10	83486	83495	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018587	ATTTT	2	10	92822	92831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018587	ATATC	2	10	113163	113172	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018587	AGAGA	2	10	127380	127389	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018587	TTACT	2	10	128819	128828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018587	AAAGT	2	10	131060	131069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018587	GATAA	2	10	153779	153788	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018587	AATAA	2	10	154885	154894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018587	ATATG	2	10	160759	160768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018587	TTGTA	2	10	172812	172821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018587	ATAGA	2	10	193515	193524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018587	TTGTC	2	10	199041	199050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018587	ACAAA	2	10	199406	199415	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018587	ATATA	2	10	207151	207160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018587	GTGAG	2	10	210987	210996	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018587	ATTTA	2	10	212049	212058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018587	GAGTG	2	10	215281	215290	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018587	AGCCG	2	10	223458	223467	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018587	GAAAA	2	10	231995	232004	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018587	GAATA	2	10	235083	235092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018587	AAATT	2	10	236768	236777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018587	TAATT	2	10	236969	236978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018587	TCGTG	2	10	238128	238137	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018587	AAGGT	2	10	239596	239605	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018587	TAATT	2	10	242988	242997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018587	TCGTG	2	10	244147	244156	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018587	AAGGT	2	10	245615	245624	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018587	GGCAT	2	10	262907	262916	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018587	AGTGA	2	10	285022	285031	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018587	AATTA	2	10	287180	287189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018587	AGGTA	2	10	291320	291329	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018587	TGGCT	2	10	297316	297325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018587	ACTAA	2	10	298692	298701	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018587	TATAA	2	10	303918	303927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018587	AAAGA	2	10	307146	307155	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018587	TTATT	2	10	329701	329710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018587	TATCA	2	10	332630	332639	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018587	ATTTT	2	10	332658	332667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018587	GAAAT	2	10	332791	332800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018587	TAAAA	2	10	346686	346695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018587	ATTGT	2	10	357128	357137	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018587	TTTTA	2	10	367135	367144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018587	AGGAG	2	10	371276	371285	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018587	ATAGA	2	10	371579	371588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018587	GTGAT	2	10	394363	394372	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018587	GAAAC	2	10	399494	399503	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018587	CAAAA	2	10	417046	417055	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018587	TAGAT	2	10	426272	426281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018587	AGGTG	2	10	448324	448333	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018587	GGAAA	2	10	453449	453458	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018587	CTTAT	2	10	467946	467955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018587	TTTAT	2	10	486899	486908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018587	TTTCT	2	10	491272	491281	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018587	TTATT	2	10	508986	508995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018587	CTATG	2	10	509152	509161	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018587	CGAGG	2	10	511376	511385	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018587	ATACA	2	10	515071	515080	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018587	ATAAA	2	10	529328	529337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018587	AAAAC	2	10	541339	541348	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018587	GTTTT	2	10	541361	541370	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018587	AAACA	2	10	543859	543868	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018587	ATGGA	2	10	549227	549236	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018587	GTTTT	2	10	557560	557569	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018587	TATAG	2	10	562214	562223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018587	GAAAA	2	10	566324	566333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018587	TAGAC	2	10	582533	582542	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018587	TAAAA	2	10	588462	588471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018587	CTATG	2	10	595907	595916	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018587	AAAGA	2	10	601361	601370	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018587	ATAAA	2	10	616332	616341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018587	AGAAT	2	10	617203	617212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018587	AATCA	2	10	620334	620343	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018587	TATAA	2	10	628278	628287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018587	ATTGA	2	10	628316	628325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018587	ATTAA	2	10	641624	641633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018587	ATATA	2	10	673093	673102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018587	ATCAA	2	10	682778	682787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018587	ATTTT	2	10	682797	682806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018587	TAAAA	2	10	683851	683860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018587	GAAAT	2	10	706442	706451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018587	TTACT	2	10	714465	714474	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018587	ATTTA	2	10	720069	720078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018587	GGGGA	2	10	729822	729831	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018587	TATTT	2	10	736060	736069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018587	AGAGA	2	10	736210	736219	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018587	CTTTT	2	10	737185	737194	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018587	CTTTT	2	10	786827	786836	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018587	TAGTT	2	10	786840	786849	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018587	TGAAA	2	10	805734	805743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018587	AATGA	2	10	822827	822836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018587	GTATA	2	10	842343	842352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018587	AATAA	2	10	846757	846766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018587	ATTTT	2	10	850343	850352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018587	TTTTC	2	10	855623	855632	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018587	GTTTT	2	10	862529	862538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018587	AAATT	2	10	863606	863615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018587	AGGAA	2	10	864129	864138	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018587	GATGA	2	10	876219	876228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018587	ATAGA	2	10	884936	884945	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018587	ATCTT	2	10	886116	886125	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018587	TAATT	2	10	890325	890334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018587	ATTTT	2	10	890592	890601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018587	AATGT	2	10	897993	898002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018587	TTATA	2	10	921731	921740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018587	ATAAC	2	10	937722	937731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018587	TTTTA	2	10	939187	939196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018587	ATAGA	2	10	943099	943108	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018587	TATAA	2	10	957360	957369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018587	TGAAA	2	10	966852	966861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018587	ATTTT	2	10	972312	972321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018587	TTTAT	2	10	972547	972556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018587	ATGAG	2	10	992324	992333	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018587	TTTTA	2	10	999455	999464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018587	TAAAA	2	10	999520	999529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018587	TATAA	2	10	1013991	1014000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018587	TCTAT	2	10	1026762	1026771	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018587	AGATA	2	10	1030452	1030461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018587	GAGAG	2	10	1039395	1039404	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018587	AAATG	2	10	1044053	1044062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018587	TTCTA	2	10	1044068	1044077	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018587	CAAAC	2	10	1044234	1044243	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018587	TTTTC	2	10	1047952	1047961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018587	AGTTT	2	10	1057847	1057856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018587	CAAAA	2	10	1060213	1060222	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018587	ACTAA	2	10	1060392	1060401	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018587	TAGGA	2	10	1074840	1074849	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018587	GTTTT	2	10	1074850	1074859	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018587	TAAAC	2	10	1078864	1078873	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018587	CTTTT	2	10	1079348	1079357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018587	AAAGC	2	10	1085279	1085288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018587	TTATT	2	10	1085322	1085331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018587	AAGTT	2	10	1089024	1089033	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018587	ATAAA	2	10	1089078	1089087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018587	GCTAT	2	10	1089950	1089959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.