MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755

Total Repeats: 8355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_018587	TAAAA	2	10	2803408	2803417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_018587	CTA	2	6	2803420	2803425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_018587	TAG	2	6	2803439	2803444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_018587	CAAAC	2	10	2804402	2804411	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8005	NC_018587	AAT	2	6	2804735	2804740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_018587	CTC	2	6	2804741	2804746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_018587	TCT	2	6	2804749	2804754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_018587	TAG	2	6	2806532	2806537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_018587	TAT	2	6	2806541	2806546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_018587	TTG	2	6	2806553	2806558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_018587	AAG	2	6	2806559	2806564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_018587	GTT	2	6	2806574	2806579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_018587	CTT	2	6	2806592	2806597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_018587	GAT	2	6	2806619	2806624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_018587	ACC	4	12	2806676	2806687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_018587	A	7	7	2806709	2806715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_018587	A	7	7	2807642	2807648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_018587	CCT	2	6	2807649	2807654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_018587	CTT	2	6	2807681	2807686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_018587	TTA	2	6	2807764	2807769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_018587	TCC	2	6	2809145	2809150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_018587	TTTA	2	8	2809161	2809168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_018587	AAAC	2	8	2809267	2809274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8024	NC_018587	CTC	2	6	2809316	2809321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_018587	A	6	6	2809396	2809401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_018587	TCTT	2	8	2809428	2809435	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8027	NC_018587	AC	3	6	2809453	2809458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_018587	A	7	7	2809465	2809471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_018587	GTAA	2	8	2809476	2809483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_018587	TTC	2	6	2809517	2809522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_018587	CAA	2	6	2809558	2809563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_018587	A	6	6	2809736	2809741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_018587	ATT	2	6	2810474	2810479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_018587	A	6	6	2810506	2810511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_018587	ACT	2	6	2810513	2810518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_018587	TA	3	6	2810542	2810547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_018587	ATC	2	6	2810585	2810590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_018587	TGC	2	6	2810654	2810659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_018587	TTCC	2	8	2810660	2810667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_018587	CTTTT	2	10	2811067	2811076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8041	NC_018587	TAT	2	6	2812647	2812652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_018587	AGA	2	6	2812662	2812667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_018587	GGCTA	2	10	2812676	2812685	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8044	NC_018587	T	6	6	2812692	2812697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_018587	CAAA	2	8	2812700	2812707	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8046	NC_018587	A	6	6	2812705	2812710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_018587	TAA	3	9	2814688	2814696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_018587	TGA	2	6	2814706	2814711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_018587	A	7	7	2814761	2814767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_018587	TCC	2	6	2820678	2820683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_018587	TC	3	6	2820726	2820731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_018587	ATA	2	6	2820794	2820799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_018587	ATA	2	6	2820802	2820807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_018587	AAGA	2	8	2820844	2820851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_018587	ATTT	2	8	2820907	2820914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_018587	TTAG	2	8	2820938	2820945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_018587	ATT	2	6	2820964	2820969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_018587	TTGGA	2	10	2821571	2821580	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_018587	AAT	2	6	2821587	2821592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_018587	AT	3	6	2821649	2821654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_018587	AGAA	2	8	2824895	2824902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_018587	CTC	2	6	2827712	2827717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_018587	A	7	7	2827720	2827726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_018587	GCG	2	6	2827745	2827750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_018587	TATAG	2	10	2827759	2827768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_018587	AAT	2	6	2827810	2827815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_018587	TCTT	2	8	2827827	2827834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8068	NC_018587	A	6	6	2829700	2829705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_018587	TTCA	2	8	2829716	2829723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8071	NC_018587	CCT	2	6	2830743	2830748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8072	NC_018587	TA	3	6	2830758	2830763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_018587	ATG	2	6	2830774	2830779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8075	NC_018587	AAC	2	6	2831629	2831634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_018587	A	7	7	2831669	2831675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_018587	TAA	2	6	2831715	2831720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_018587	A	6	6	2840199	2840204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8081	NC_018587	ATT	2	6	2843901	2843906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_018587	A	7	7	2843911	2843917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_018587	T	6	6	2843943	2843948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_018587	ACCT	2	8	2844340	2844347	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8085	NC_018587	TCC	2	6	2845002	2845007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8087	NC_018587	A	8	8	2845085	2845092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8089	NC_018587	TATAT	2	10	2845839	2845848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_018587	TTA	2	6	2846026	2846031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_018587	ATA	2	6	2846047	2846052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_018587	AGTA	2	8	2846111	2846118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_018587	ATGG	2	8	2846123	2846130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_018587	A	7	7	2847898	2847904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_018587	CGA	2	6	2847905	2847910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8101	NC_018587	CTC	2	6	2849495	2849500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_018587	T	6	6	2849506	2849511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_018587	A	6	6	2849593	2849598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8105	NC_018587	CAC	2	6	2849709	2849714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_018587	CT	3	6	2849722	2849727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8107	NC_018587	TAC	2	6	2849746	2849751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8109	NC_018587	TC	3	6	2850316	2850321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8114	NC_018587	TA	3	6	2856376	2856381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_018587	CTA	2	6	2856411	2856416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_018587	TAGAA	2	10	2856524	2856533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_018587	CAT	2	6	2856556	2856561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8120	NC_018587	T	7	7	2858266	2858272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_018587	TAG	2	6	2858302	2858307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_018587	TA	3	6	2858313	2858318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_018587	A	6	6	2858332	2858337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_018587	ATTG	2	8	2860036	2860043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_018587	CAAA	2	8	2860077	2860084	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8126	NC_018587	CT	3	6	2862288	2862293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_018587	T	6	6	2864077	2864082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_018587	CCT	2	6	2864087	2864092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_018587	TAG	2	6	2864177	2864182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8131	NC_018587	T	6	6	2865716	2865721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_018587	T	6	6	2865734	2865739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.