MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2540

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018586	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018586	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018586	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018586	ATTTAT	2	12	81561	81572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018586	GCTGTG	2	12	87086	87097	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018586	CAGGTT	2	12	143384	143395	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018586	ACACTT	2	12	170995	171006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018586	AATAAA	2	12	197303	197314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018586	GAAAAC	2	12	224221	224232	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018586	ATTCAA	2	12	235121	235132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018586	AAGGAA	2	12	236692	236703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018586	TAGGCG	2	12	238345	238356	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018586	ATTCAA	2	12	241140	241151	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018586	AAGGAA	2	12	242711	242722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018586	TAGGCG	2	12	244364	244375	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018586	AGTCAA	2	12	246178	246189	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018586	TTATAT	2	12	260963	260974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018586	AACTTT	2	12	296679	296690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018586	TAAAAA	2	12	302048	302059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018586	AATACA	2	12	306497	306508	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018586	CATAGA	2	12	356642	356653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018586	AAATTT	2	12	379976	379987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018586	TAAAGA	2	12	416784	416795	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018586	TTGTTT	2	12	423158	423169	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018586	AAATGT	2	12	554837	554848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018586	AGATTT	2	12	562968	562979	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018586	AAATAA	2	12	603271	603282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018586	ATCATT	2	12	631629	631640	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018586	TGTAAA	2	12	653570	653581	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018586	ATCATT	2	12	675842	675853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018586	GAATAA	2	12	702926	702937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018586	GTTTTA	2	12	708619	708630	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018586	TATAGG	2	12	725836	725847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018586	AATTAG	2	12	753281	753292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018586	TGTTGA	2	12	764337	764348	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018586	TTACTT	2	12	843971	843982	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018586	AAATAG	2	12	880410	880421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018586	GTAATC	2	12	887213	887224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018586	TTACAA	2	12	887231	887242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018586	ATGAAA	2	12	895835	895846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018586	TTGACT	2	12	1018839	1018850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018586	AGGAAG	2	12	1029018	1029029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018586	AACAAT	2	12	1068020	1068031	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018586	CTTTTT	2	12	1084319	1084330	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018586	AAATAA	2	12	1124265	1124276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018586	TTTAGT	2	12	1128141	1128152	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018586	CTTTTT	2	12	1166455	1166466	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018586	CTTTTT	2	12	1200921	1200932	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018586	GAAAAA	2	12	1230884	1230895	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018586	AAGACG	2	12	1249448	1249459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018586	TAAAAA	2	12	1272215	1272226	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018586	TATTAA	2	12	1304921	1304932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018586	GTACAA	2	12	1418205	1418216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018586	ATTAAG	2	12	1472837	1472848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018586	TAATCA	2	12	1472946	1472957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018586	TACCAA	2	12	1490879	1490890	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018586	CTCTTC	2	12	1619726	1619737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018586	TCATTA	2	12	1656049	1656060	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018586	GGTTGT	2	12	1670373	1670384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018586	GAATAA	2	12	1671926	1671937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018586	GTAAAC	2	12	1673077	1673088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018586	ACAAAA	2	12	1681701	1681712	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018586	AAAATA	2	12	1686021	1686032	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018586	TAAAAA	2	12	1686931	1686942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018586	CTTATT	2	12	1772927	1772938	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018586	CGCCTA	2	12	1776431	1776442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018586	TTTCCT	2	12	1778083	1778094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018586	TTGAAT	2	12	1779655	1779666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018586	CGCCTA	2	12	1880549	1880560	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018586	TTTCCT	2	12	1882201	1882212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018586	TTGAAT	2	12	1883773	1883784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018586	AAATGG	2	12	1884757	1884768	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018586	GTTTTG	2	12	1891723	1891734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018586	CTCTAT	2	12	1992311	1992322	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018586	TCATTT	2	12	1993509	1993520	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018586	GTTTTC	2	12	2020678	2020689	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018586	CAAAAA	2	12	2038401	2038412	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018586	GAAAAA	2	12	2042261	2042272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018586	TAACAT	2	12	2054898	2054909	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018586	TTCACT	2	12	2210423	2210434	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018586	ATTCAA	2	12	2221153	2221164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018586	TATATT	2	12	2282646	2282657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018586	AATTTT	2	12	2340331	2340342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018586	AAATTG	2	12	2346507	2346518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018586	CTCTGT	2	12	2353351	2353362	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018586	TTATTT	2	12	2408370	2408381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018586	TAATAC	2	12	2437114	2437125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018586	TTTCCT	2	12	2459813	2459824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018586	TTGAAT	2	12	2461385	2461396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018586	TTGTCT	2	12	2571581	2571592	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018586	CTTTTT	2	12	2611065	2611076	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018586	ATCCCA	2	12	2630979	2630990	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018586	TTTTTA	2	12	2642807	2642818	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018586	CGCCTA	2	12	2688219	2688230	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018586	TTTCCT	2	12	2690122	2690133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018586	TTGAAT	2	12	2691694	2691705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018586	CCTCTT	2	12	2742418	2742429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018586	TAAATC	2	12	2765439	2765450	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018586	TATCAA	2	12	2919956	2919967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018586	TAAAAA	2	12	2920040	2920051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018586	AAGTAT	2	12	2920907	2920918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.