MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2540

Total Repeats: 1146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018586	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018586	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018586	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018586	GCTT	2	8	14135	14142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018586	ATGC	2	8	14556	14563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018586	AAAT	2	8	28904	28911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018586	AGGA	2	8	29082	29089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018586	CCTT	2	8	37489	37496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018586	AAAT	2	8	44790	44797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018586	ATAA	2	8	51352	51359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018586	AGTG	2	8	51429	51436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018586	TTAG	2	8	52162	52169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018586	GTTA	2	8	53527	53534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018586	GCTC	2	8	53582	53589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018586	ATTC	2	8	53986	53993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018586	TATT	2	8	54955	54962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018586	ACTT	2	8	55680	55687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018586	GTTA	2	8	58881	58888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018586	AATA	2	8	64312	64319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018586	CATA	2	8	64923	64930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018586	CATA	2	8	78996	79003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018586	TCTA	2	8	79055	79062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018586	TAGT	2	8	81512	81519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018586	TTTA	2	8	81536	81543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018586	ATAA	2	8	83262	83269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018586	AGAA	2	8	83352	83359	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018586	AATG	2	8	86061	86068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018586	AAAC	2	8	87222	87229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018586	AACC	2	8	90315	90322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018586	CTAA	2	8	90361	90368	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018586	TTAT	2	8	90406	90413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018586	AATA	2	8	90561	90568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018586	ATTT	2	8	92270	92277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018586	GGAA	2	8	92352	92359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018586	AATA	2	8	108525	108532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018586	AAAT	2	8	108545	108552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018586	AACA	2	8	111889	111896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018586	CTTT	2	8	114286	114293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018586	GAAT	2	8	114327	114334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018586	GGAG	2	8	114343	114350	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018586	TGTT	2	8	123443	123450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018586	ACTT	2	8	125043	125050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018586	ATAG	2	8	125092	125099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018586	AAAT	2	8	126034	126041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018586	TAAA	2	8	139173	139180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018586	TTGG	2	8	139184	139191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018586	ACCA	2	8	139220	139227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018586	TGGA	2	8	140807	140814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018586	TGCG	2	8	145428	145435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018586	TCCC	2	8	148304	148311	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_018586	TGGT	2	8	149595	149602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018586	ATTA	2	8	161256	161263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018586	TACT	2	8	175643	175650	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018586	AAGT	2	8	175665	175672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018586	GCTA	2	8	191674	191681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018586	GAAT	2	8	194475	194482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018586	TTGC	2	8	197734	197741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018586	TAAT	2	8	198685	198692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018586	AAAT	2	8	198798	198805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018586	CAAA	2	8	198832	198839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018586	TCAT	2	8	198928	198935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018586	GAAA	2	8	202191	202198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018586	CATA	2	8	202267	202274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018586	ATTT	2	8	202286	202293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018586	AGCA	2	8	203447	203454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018586	ACTT	2	8	205468	205475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018586	GAAA	2	8	209059	209066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018586	TCAA	2	8	210376	210383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018586	AATA	2	8	214009	214016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018586	TTTG	2	8	214034	214041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018586	TCTT	2	8	215385	215392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018586	GAAT	2	8	215423	215430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018586	GAAG	2	8	219009	219016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018586	GGGA	2	8	221134	221141	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018586	AATT	2	8	222122	222129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018586	GAAG	2	8	222202	222209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018586	ATTA	2	8	224168	224175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018586	ATAG	2	8	224206	224213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018586	AATA	2	8	224323	224330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018586	AATT	2	8	228461	228468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018586	ATAG	2	8	228490	228497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018586	AAAT	2	8	229482	229489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018586	CTTT	2	8	229529	229536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018586	AAAC	2	8	234833	234840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018586	TAGA	2	8	234898	234905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018586	CGAA	2	8	235202	235209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018586	CCTG	2	8	235269	235276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018586	AGCC	2	8	236603	236610	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018586	TGTT	2	8	236764	236771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018586	AGAA	2	8	237156	237163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018586	AAAG	2	8	237259	237266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018586	TACT	2	8	237698	237705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018586	CACG	2	8	237719	237726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018586	AGTG	2	8	238458	238465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018586	GGAA	2	8	238512	238519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018586	TAGG	2	8	239086	239093	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018586	ATGG	2	8	239269	239276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018586	ATCG	2	8	239847	239854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018586	CGAA	2	8	241221	241228	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018586	CCTG	2	8	241288	241295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018586	AGCC	2	8	242622	242629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018586	TGTT	2	8	242783	242790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018586	AGAA	2	8	243175	243182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018586	AAAG	2	8	243278	243285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018586	TACT	2	8	243717	243724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018586	CACG	2	8	243738	243745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018586	AGTG	2	8	244477	244484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018586	GGAA	2	8	244531	244538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018586	TAGG	2	8	245105	245112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018586	ATGG	2	8	245288	245295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018586	ATCG	2	8	245866	245873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018586	ATAA	2	8	246126	246133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018586	TAGG	2	8	246142	246149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018586	TGAA	2	8	256131	256138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018586	AGAA	2	8	261109	261116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018586	ACAT	2	8	261158	261165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018586	ACAA	2	8	264626	264633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018586	AAGG	2	8	265169	265176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018586	TCTT	2	8	265988	265995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018586	AAAT	2	8	266021	266028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018586	TTCG	2	8	275186	275193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018586	AATT	2	8	275694	275701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018586	CGAA	2	8	283726	283733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018586	TAGA	2	8	285295	285302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018586	TTCA	2	8	285871	285878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018586	ATTT	2	8	290079	290086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018586	TAAA	2	8	290109	290116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018586	ATAC	2	8	291933	291940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018586	TGAA	2	8	293809	293816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018586	AAAG	2	8	295517	295524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018586	TAAA	2	8	296719	296726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018586	TTTG	2	8	296736	296743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018586	ACAT	2	8	298987	298994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018586	CTAT	2	8	305189	305196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018586	ATTA	2	8	314497	314504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018586	TAAA	2	8	318139	318146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018586	GTTA	2	8	318219	318226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018586	TAAT	2	8	319578	319585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018586	AGGC	2	8	319638	319645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018586	TAAA	2	8	319681	319688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018586	CTTA	2	8	320521	320528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018586	TAAA	2	8	320542	320549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018586	GAAG	2	8	325674	325681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018586	GATT	2	8	327557	327564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018586	AGAT	2	8	329317	329324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018586	TTTA	2	8	329330	329337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018586	TAAT	2	8	330250	330257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018586	AAAT	2	8	330287	330294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018586	TGAA	2	8	336775	336782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_018586	TTTA	2	8	343871	343878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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