MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes ATCC 19117

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018584	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018584	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018584	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018584	CAGGTT	2	12	149043	149054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018584	ACACTT	2	12	176960	176971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018584	AATAAA	2	12	203282	203293	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018584	GAAAAC	2	12	229879	229890	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018584	ATTCAA	2	12	240759	240770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018584	AAGGAA	2	12	242330	242341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018584	TAGGCG	2	12	243983	243994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018584	ATTCAA	2	12	246778	246789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018584	AAGGAA	2	12	248349	248360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018584	TAGGCG	2	12	250002	250013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018584	AGTCAA	2	12	251816	251827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018584	TTATAT	2	12	266602	266613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018584	AACTTT	2	12	302316	302327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018584	TAAAAA	2	12	307685	307696	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018584	AATACA	2	12	312134	312145	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018584	CATAGA	2	12	371092	371103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018584	CAAAAG	2	12	395834	395845	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018584	TAGTTT	2	12	418824	418835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018584	TTGTTT	2	12	434330	434341	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018584	TAATTA	2	12	480161	480172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018584	AAGTCA	2	12	488744	488755	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018584	TTTTTA	2	12	491586	491597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018584	TTAAAT	2	12	531307	531318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018584	CTATAA	2	12	533077	533088	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018584	AAATGT	2	12	584237	584248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018584	AGATTT	2	12	592368	592379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018584	AAATAA	2	12	632670	632681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018584	ATCATT	2	12	661026	661037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018584	TGTAAA	2	12	682962	682973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018584	ATCATT	2	12	702805	702816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018584	GAATAA	2	12	729871	729882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018584	GTTTTA	2	12	735564	735575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018584	TATAGG	2	12	752781	752792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018584	AATTAG	2	12	780228	780239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018584	TGTTGA	2	12	791285	791296	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018584	TTACTT	2	12	867784	867795	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018584	AAATAG	2	12	904185	904196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018584	GTAATC	2	12	910988	910999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018584	TTACAA	2	12	911006	911017	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018584	ATGAAA	2	12	919610	919621	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018584	TTGACT	2	12	1045097	1045108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018584	AGGAAG	2	12	1055286	1055297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018584	AACAAT	2	12	1094290	1094301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018584	CTTTTT	2	12	1110591	1110602	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018584	GCTACG	2	12	1148011	1148022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018584	TGAATA	2	12	1148082	1148093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018584	AAATAA	2	12	1150097	1150108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018584	TTTAGT	2	12	1153984	1153995	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018584	CTTTTT	2	12	1192361	1192372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018584	CTTTTT	2	12	1225163	1225174	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018584	GAAAAA	2	12	1255128	1255139	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018584	TATTAA	2	12	1287698	1287709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018584	GTACAA	2	12	1400983	1400994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018584	ATTAAG	2	12	1434237	1434248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018584	TAATCA	2	12	1434346	1434357	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018584	TACCAA	2	12	1452268	1452279	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018584	TTTCAT	2	12	1478428	1478439	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018584	CTCTTC	2	12	1581112	1581123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018584	TAAAAA	2	12	1596573	1596584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018584	TCATTA	2	12	1617435	1617446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018584	GAATAA	2	12	1633313	1633324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018584	GTAAAC	2	12	1634464	1634475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018584	ACAAAA	2	12	1643088	1643099	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018584	AAAATA	2	12	1647407	1647418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018584	TAAAAA	2	12	1648317	1648328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018584	CTTATT	2	12	1734332	1734343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018584	CGCCTA	2	12	1737835	1737846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018584	TTTCCT	2	12	1739487	1739498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018584	TTGAAT	2	12	1741059	1741070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018584	CGCCTA	2	12	1842513	1842524	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018584	TTTCCT	2	12	1844165	1844176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018584	TTGAAT	2	12	1845737	1845748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018584	AAATGG	2	12	1846721	1846732	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018584	GTTTTG	2	12	1853689	1853700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018584	AAAAGA	2	12	1936571	1936582	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018584	CTCTAT	2	12	1955895	1955906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018584	TCATTT	2	12	1957093	1957104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018584	GTTTTC	2	12	1984260	1984271	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018584	CAAAAA	2	12	2001985	2001996	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018584	GAAAAA	2	12	2005845	2005856	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018584	TTCACT	2	12	2156151	2156162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018584	ATTCAA	2	12	2166881	2166892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018584	TTTAAT	2	12	2202693	2202704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018584	TATATT	2	12	2229780	2229791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018584	AATTTT	2	12	2287745	2287756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018584	AAATTG	2	12	2293921	2293932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018584	CTCTGT	2	12	2300765	2300776	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018584	ATAAAT	2	12	2323447	2323458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018584	CTAAAG	2	12	2334487	2334498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018584	TTATTT	2	12	2391548	2391559	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018584	TAATAC	2	12	2420292	2420303	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018584	CGCCTA	2	12	2441088	2441099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018584	TTTCCT	2	12	2442991	2443002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018584	TTGAAT	2	12	2444561	2444572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018584	CTTTTT	2	12	2608056	2608067	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018584	ATCCCA	2	12	2627969	2627980	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018584	TTTTTA	2	12	2639797	2639808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018584	CGCCTA	2	12	2683785	2683796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018584	TTTCCT	2	12	2685688	2685699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018584	TTGAAT	2	12	2687260	2687271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018584	CCTCTT	2	12	2729731	2729742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018584	TAAATC	2	12	2752753	2752764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018584	AAACCA	2	12	2887263	2887274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018584	TATCAA	2	12	2894807	2894818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018584	TAAAAA	2	12	2894891	2894902	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018584	AAGTAT	2	12	2895758	2895769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.