MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018528	TTTTAT	2	12	14673	14684	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018528	TAATAT	2	12	25507	25518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018528	TTTTAT	2	12	39788	39799	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018528	AGATGC	2	12	39973	39984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018528	CTTTTT	2	12	65241	65252	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018528	ATTGCA	2	12	67432	67443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018528	TGTGCT	2	12	71602	71613	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018528	CGGAGC	2	12	75088	75099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018528	TACTTT	2	12	78242	78253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018528	CACGGT	2	12	78780	78791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018528	CTTAAG	2	12	79852	79863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018528	TCATTT	2	12	115459	115470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018528	AATTTT	2	12	117122	117133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018528	CTTTTT	2	12	121766	121777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018528	TAAATT	2	12	168899	168910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018528	TTTGCA	2	12	182146	182157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018528	TGTCTT	2	12	199184	199195	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018528	ATAGAC	2	12	228446	228457	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018528	TTTTAG	2	12	231854	231865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018528	GCTTAA	2	12	254961	254972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018528	TTTTTA	2	12	280976	280987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018528	TGGATT	2	12	352891	352902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018528	TTATCT	2	12	372246	372257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018528	AAAGAA	2	12	375641	375652	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018528	ACCTCA	2	12	377182	377193	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018528	GCTTAA	2	12	392899	392910	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018528	ATAAAA	2	12	395329	395340	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018528	GTTTTT	2	12	397465	397476	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018528	CTTAAG	2	12	405987	405998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018528	ATCTAA	2	12	441453	441464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018528	CGGAGC	2	12	457447	457458	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018528	GAAAAA	2	12	473421	473432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018528	CGGAGC	2	12	476320	476331	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018528	CGGATA	2	12	498313	498324	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018528	TAGCTC	2	12	498515	498526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018528	GCTTAA	2	12	514066	514077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018528	TTAAAA	2	12	595054	595065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018528	TAGTCA	2	12	655196	655207	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018528	TACTAA	2	12	660014	660025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018528	AAAAAT	2	12	661530	661541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018528	CTTAAG	2	12	671953	671964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018528	TAATAG	2	12	674770	674781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018528	GCTTAA	2	12	681221	681232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018528	TTGAGG	2	12	702610	702621	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018528	TTCTTT	2	12	704152	704163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018528	CCAAAA	2	12	711259	711270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018528	AAAAAT	2	12	711549	711560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018528	AGATGA	2	12	712706	712717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018528	TTTATT	2	12	715644	715655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018528	TTAAAA	2	12	791652	791663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018528	TAGTCA	2	12	794222	794233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018528	TAATTA	2	12	810812	810823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018528	CGCTGG	2	12	814464	814475	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018528	AAATAA	2	12	859008	859019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018528	TGTTTT	2	12	863108	863119	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018528	ATTATG	2	12	874122	874133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018528	AAATAA	2	12	880005	880016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018528	TTTTGA	2	12	922354	922365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018528	TAATCC	2	12	937056	937067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018528	CATCAG	2	12	949952	949963	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018528	CAATAG	2	12	950680	950691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018528	AAATAA	2	12	951861	951872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018528	AAAAAG	2	12	954410	954421	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018528	CATCCT	2	12	964725	964736	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018528	GCAATT	2	12	965454	965465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018528	TTTTTA	2	12	978778	978789	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018528	AAAAAG	2	12	978794	978805	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018528	ATTTAG	2	12	1015078	1015089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018528	TAAGTT	2	12	1021471	1021482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018528	GGGATT	2	12	1026274	1026285	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018528	TTATTT	2	12	1032648	1032659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018528	TATAAT	2	12	1039535	1039546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018528	AAAATA	2	12	1046298	1046309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018528	TTTTTA	2	12	1051626	1051637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018528	TAATTA	2	12	1070924	1070935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018528	TAGAAC	2	12	1102816	1102827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018528	AATGCA	2	12	1111751	1111762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018528	CGTTTG	2	12	1119024	1119035	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018528	GCTTAA	2	12	1139766	1139777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018528	CTGTTT	2	12	1147875	1147886	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018528	TAAATT	2	12	1147935	1147946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018528	AAAATA	2	12	1151680	1151691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018528	GATCTA	2	12	1169212	1169223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018528	ATAAAA	2	12	1170637	1170648	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018528	CTAATT	2	12	1194658	1194669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018528	CTAAAA	2	12	1197191	1197202	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018528	TCAATC	2	12	1212373	1212384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018528	TTAAAA	2	12	1229064	1229075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018528	GATCAA	2	12	1237398	1237409	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018528	AGTTTC	2	12	1237432	1237443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018528	AGCACC	2	12	1238880	1238891	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018528	TGCAGC	2	12	1243887	1243898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018528	TATAAG	2	12	1249692	1249703	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018528	TTTAAT	2	12	1259245	1259256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018528	ACCTTG	2	12	1260441	1260452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018528	CATTTT	2	12	1265776	1265787	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018528	CTTTTT	2	12	1287230	1287241	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018528	AGTTTG	2	12	1302267	1302278	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018528	CAGGAA	2	12	1321860	1321871	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018528	TTGTAA	2	12	1326226	1326237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018528	TTTTTA	2	12	1351838	1351849	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018528	CATCTT	2	12	1361696	1361707	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018528	ATGATA	2	12	1361753	1361764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018528	TTTCCT	2	12	1363195	1363206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018528	GCTTAA	2	12	1366986	1366997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018528	AAAAAT	2	12	1395610	1395621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018528	TTAAAA	2	12	1398383	1398394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018528	ATAAAA	2	12	1406382	1406393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018528	GATATA	2	12	1438812	1438823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018528	AAGTAG	2	12	1444564	1444575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018528	TGCCTT	2	12	1444646	1444657	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018528	ATTACC	2	12	1445012	1445023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018528	TTCTAT	2	12	1460480	1460491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018528	AAAGAA	2	12	1487655	1487666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018528	CTTTTT	2	12	1505613	1505624	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018528	TTTAAA	2	12	1515695	1515706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018528	TGGCTC	2	12	1530061	1530072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018528	GTCATT	2	12	1547850	1547861	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018528	TATCTC	2	12	1552442	1552453	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018528	TTTCAT	2	12	1552711	1552722	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018528	GCTTAA	2	12	1564957	1564968	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018528	CGCTTC	2	12	1584863	1584874	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018528	ATATTA	2	12	1592201	1592212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018528	CTCTAT	2	12	1605449	1605460	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018528	TCAATT	2	12	1605951	1605962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018528	TTTTTA	2	12	1627943	1627954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018528	TTTTTA	2	12	1648698	1648709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.