MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Lorraine plasmid pLELO

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018141	TTCT	2	8	4644	4651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018141	TAAA	2	8	5801	5808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018141	TGAA	2	8	6398	6405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018141	AAAC	2	8	22045	22052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018141	AATT	2	8	25878	25885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018141	CTTA	2	8	30730	30737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018141	TTAT	2	8	39248	39255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018141	AATG	2	8	40338	40345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018141	ATTT	2	8	40443	40450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018141	TTCA	2	8	41174	41181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018141	TGAG	2	8	41790	41797	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018141	TTCC	2	8	42519	42526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018141	TTAA	2	8	43377	43384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018141	TATC	2	8	43608	43615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018141	AGTA	2	8	43747	43754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018141	TTTC	2	8	46348	46355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018141	ATTG	2	8	47554	47561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018141	GAAA	2	8	53360	53367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018141	TTTA	2	8	53384	53391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018141	AAGT	2	8	56648	56655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018141	TTCC	2	8	67301	67308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018141	TCAC	2	8	68658	68665	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018141	AAAT	2	8	68727	68734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018141	ATGA	2	8	68842	68849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018141	CAAT	2	8	68942	68949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018141	TTAA	2	8	70137	70144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018141	TAAA	2	8	74608	74615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018141	TTTG	2	8	83816	83823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018141	ATTC	2	8	86817	86824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018141	CCAA	2	8	88601	88608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018141	TTTA	2	8	88779	88786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018141	TAAG	2	8	88794	88801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018141	AATT	2	8	90779	90786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018141	CAAT	2	8	95971	95978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018141	TCAA	2	8	96710	96717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018141	CAAC	2	8	97197	97204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018141	AACC	2	8	97546	97553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018141	AGCC	2	8	97609	97616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018141	AAAT	2	8	98327	98334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018141	TAAT	2	8	98483	98490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018141	AATA	2	8	98530	98537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018141	TAAA	2	8	98721	98728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018141	CTGA	2	8	99363	99370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018141	GATA	2	8	100599	100606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018141	ATGA	2	8	100608	100615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018141	GTAA	2	8	100667	100674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018141	CAAA	2	8	100948	100955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018141	AAAG	2	8	101236	101243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018141	AATT	2	8	101437	101444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018141	GATT	2	8	102533	102540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018141	TACA	2	8	102711	102718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018141	ACGG	2	8	103921	103928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018141	ATAA	2	8	104930	104937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018141	ATCA	2	8	111264	111271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018141	TAAT	2	8	111622	111629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018141	TTGA	2	8	111636	111643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018141	TTAA	2	8	111792	111799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018141	TAAA	2	8	113161	113168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018141	TTTA	2	8	139049	139056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018141	TTTA	2	8	142688	142695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018141	CTGA	2	8	142893	142900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018141	TTTC	2	8	149103	149110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018141	TTAA	2	8	149138	149145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018141	AATT	2	8	149148	149155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018141	AGAT	2	8	149668	149675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018141	CAAT	2	8	149727	149734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018141	TCAT	2	8	149821	149828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018141	AAAT	2	8	150329	150336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.