MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila

Total Repeats: 10096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_018140	CA	3	6	3462900	3462905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_018140	TAAA	2	8	3462916	3462923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_018140	GAC	2	6	3462946	3462951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_018140	ATC	2	6	3462961	3462966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_018140	TTAA	2	8	3462970	3462977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_018140	TTG	2	6	3463018	3463023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_018140	TAA	2	6	3464623	3464628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_018140	ATT	2	6	3464631	3464636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_018140	T	6	6	3464635	3464640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_018140	GCA	2	6	3464717	3464722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_018140	T	8	8	3464731	3464738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_018140	AAAT	2	8	3464741	3464748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_018140	CT	3	6	3464762	3464767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10014	NC_018140	CCT	2	6	3464783	3464788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_018140	TTA	2	6	3464862	3464867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_018140	ATT	2	6	3464886	3464891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_018140	AAG	2	6	3464990	3464995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_018140	AAT	2	6	3465038	3465043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_018140	ATC	2	6	3465073	3465078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_018140	GTT	2	6	3465099	3465104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_018140	AAC	2	6	3465128	3465133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_018140	T	9	9	3465266	3465274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_018140	ATT	2	6	3465576	3465581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_018140	AAT	2	6	3465628	3465633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_018140	AAT	2	6	3465748	3465753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_018140	T	6	6	3465765	3465770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_018140	ATA	2	6	3465772	3465777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_018140	T	6	6	3465787	3465792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_018140	TGC	2	6	3465805	3465810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_018140	A	6	6	3465823	3465828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_018140	AGA	2	6	3465834	3465839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_018140	ATTTT	2	10	3465856	3465865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_018140	T	6	6	3465862	3465867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_018140	ATT	2	6	3465971	3465976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_018140	TAA	2	6	3465985	3465990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_018140	GACA	2	8	3466004	3466011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10037	NC_018140	AGCC	2	8	3466899	3466906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10038	NC_018140	ATT	2	6	3466913	3466918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_018140	ATC	2	6	3466933	3466938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_018140	AT	3	6	3469238	3469243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_018140	CAT	2	6	3469255	3469260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_018140	ATC	2	6	3469326	3469331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_018140	TAT	2	6	3469333	3469338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_018140	TTA	2	6	3469411	3469416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_018140	TGAA	2	8	3469460	3469467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_018140	AATA	2	8	3469473	3469480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_018140	TTG	2	6	3469488	3469493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_018140	T	6	6	3469508	3469513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_018140	TC	3	6	3469530	3469535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_018140	GTT	2	6	3469563	3469568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_018140	AAT	2	6	3469681	3469686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_018140	AG	3	6	3469735	3469740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_018140	CAA	2	6	3469751	3469756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_018140	AG	3	6	3469771	3469776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_018140	GAAA	2	8	3469800	3469807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_018140	TA	3	6	3471680	3471685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_018140	AAT	2	6	3472601	3472606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_018140	TG	3	6	3475276	3475281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_018140	GAT	3	9	3475581	3475589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_018140	TAA	2	6	3476871	3476876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_018140	A	6	6	3476974	3476979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_018140	CAG	2	6	3477001	3477006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_018140	A	6	6	3477019	3477024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_018140	CA	3	6	3477052	3477057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_018140	ATA	2	6	3477061	3477066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_018140	ACA	2	6	3477086	3477091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_018140	GAA	2	6	3477132	3477137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_018140	TCC	2	6	3477238	3477243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_018140	T	7	7	3482212	3482218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_018140	GTT	2	6	3483366	3483371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_018140	TTA	3	9	3483374	3483382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_018140	TTA	2	6	3483403	3483408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_018140	CTCA	2	8	3485586	3485593	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_018140	ATT	2	6	3485613	3485618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_018140	ACA	2	6	3485626	3485631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_018140	CATT	2	8	3485680	3485687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10077	NC_018140	T	6	6	3485703	3485708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_018140	ATT	2	6	3485764	3485769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_018140	TA	3	6	3485873	3485878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_018140	TATT	2	8	3485905	3485912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_018140	CAA	2	6	3485984	3485989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_018140	TA	3	6	3485992	3485997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_018140	T	7	7	3486044	3486050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_018140	AAT	2	6	3488740	3488745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_018140	T	6	6	3488777	3488782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_018140	CAC	2	6	3488915	3488920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10087	NC_018140	TAA	3	9	3488929	3488937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_018140	AGA	2	6	3488954	3488959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_018140	ATG	2	6	3488976	3488981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_018140	CAT	2	6	3488991	3488996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_018140	ATGG	2	8	3492067	3492074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_018140	AAC	2	6	3492154	3492159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_018140	ATA	2	6	3492164	3492169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_018140	ACA	2	6	3492173	3492178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_018140	TAA	2	6	3492196	3492201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_018140	AAATCA	2	12	3492524	3492535	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.