MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017552	AT	3	6	3928	3933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017552	TA	3	6	5108	5113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017552	AG	3	6	17810	17815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017552	CT	3	6	18232	18237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017552	GA	3	6	19504	19509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017552	GT	4	8	22267	22274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017552	GA	3	6	28542	28547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017552	AC	3	6	33511	33516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017552	GA	3	6	33537	33542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017552	CT	3	6	37754	37759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017552	GA	3	6	39026	39031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017552	TA	3	6	44543	44548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017552	AG	3	6	50935	50940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017552	TA	3	6	58073	58078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017552	TA	3	6	58167	58172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017552	CT	3	6	58593	58598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017552	AG	3	6	59021	59026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017552	TA	3	6	61864	61869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017552	CT	3	6	66846	66851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017552	CT	3	6	67022	67027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017552	AG	3	6	67279	67284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017552	AT	3	6	68850	68855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017552	AT	3	6	70421	70426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017552	TG	3	6	72459	72464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017552	TA	3	6	78967	78972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017552	TA	3	6	81623	81628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017552	GA	3	6	84334	84339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017552	TC	3	6	84470	84475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017552	TA	3	6	91102	91107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017552	AT	3	6	92936	92941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017552	TG	3	6	93900	93905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017552	AT	3	6	94315	94320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017552	GT	3	6	106270	106275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017552	TA	3	6	108213	108218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017552	TC	3	6	108539	108544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017552	CA	3	6	108835	108840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017552	CT	3	6	108910	108915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017552	TA	3	6	111400	111405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017552	TA	3	6	114447	114452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017552	AT	3	6	118164	118169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017552	GT	3	6	118175	118180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017552	TA	3	6	125827	125832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017552	TA	3	6	126562	126567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017552	TC	3	6	126618	126623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017552	AT	3	6	126752	126757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017552	TA	3	6	126915	126920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017552	AT	4	8	126981	126988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017552	TA	3	6	128589	128594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017552	TA	3	6	129244	129249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017552	TA	3	6	141768	141773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017552	AG	3	6	142489	142494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017552	AT	3	6	142893	142898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017552	TA	3	6	143681	143686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017552	CA	3	6	161499	161504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017552	TA	3	6	162808	162813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017552	AC	3	6	162863	162868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017552	TA	3	6	163031	163036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017552	CT	3	6	171404	171409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017552	GA	3	6	176030	176035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017552	AT	3	6	176194	176199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017552	TG	3	6	180095	180100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017552	TA	3	6	180133	180138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017552	TC	3	6	180443	180448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017552	AT	3	6	183415	183420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017552	AG	3	6	184577	184582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017552	TA	3	6	188631	188636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017552	GA	3	6	195704	195709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017552	TA	3	6	199132	199137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017552	CA	3	6	206305	206310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017552	TA	3	6	206448	206453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017552	TA	3	6	207993	207998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017552	CT	3	6	215957	215962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017552	AG	3	6	217162	217167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017552	TA	3	6	218854	218859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017552	TA	3	6	219559	219564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017552	AG	3	6	223108	223113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017552	TG	3	6	223246	223251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017552	TA	3	6	223963	223968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017552	AG	3	6	224099	224104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017552	CA	3	6	225635	225640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017552	TA	4	8	225958	225965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017552	AT	3	6	226040	226045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017552	AT	3	6	226070	226075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017552	AT	4	8	227561	227568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017552	AC	3	6	227886	227891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017552	TA	3	6	228932	228937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017552	TA	3	6	229814	229819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017552	TA	3	6	230221	230226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017552	AG	3	6	232121	232126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017552	TA	3	6	233155	233160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017552	TG	3	6	239257	239262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017552	CA	3	6	239487	239492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017552	TA	3	6	242154	242159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017552	TA	3	6	242683	242688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017552	AT	3	6	244720	244725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017552	GA	3	6	245143	245148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017552	TA	3	6	246852	246857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017552	GA	3	6	254205	254210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017552	AT	3	6	257346	257351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017552	AT	3	6	262317	262322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017552	TA	3	6	262373	262378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017552	GT	3	6	262555	262560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017552	AT	3	6	262717	262722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017552	TG	3	6	264267	264272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017552	TA	3	6	264443	264448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017552	CT	3	6	265898	265903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017552	TG	3	6	275563	275568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017552	TA	4	8	276366	276373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017552	CA	3	6	283284	283289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017552	GA	3	6	284195	284200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017552	TG	3	6	287116	287121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017552	AG	3	6	288409	288414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017552	CT	3	6	294399	294404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017552	AG	3	6	295923	295928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017552	AT	3	6	301201	301206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017552	AT	3	6	301217	301222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017552	TA	3	6	304005	304010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017552	TA	5	10	304134	304143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017552	AT	3	6	304929	304934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017552	CT	3	6	309566	309571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017552	TA	3	6	315522	315527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017552	AT	4	8	320888	320895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017552	AT	3	6	320954	320959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017552	TA	3	6	327164	327169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017552	AC	3	6	327665	327670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017552	TA	3	6	330503	330508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017552	GA	3	6	333172	333177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017552	TA	3	6	334233	334238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017552	AG	3	6	334984	334989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017552	AG	3	6	335101	335106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017552	CT	3	6	335280	335285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017552	AG	3	6	336553	336558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017552	AG	3	6	336747	336752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017552	AG	3	6	336782	336787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017552	AT	3	6	338433	338438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017552	AT	3	6	339314	339319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017552	AC	3	6	340094	340099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017552	GT	3	6	340645	340650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017552	TA	3	6	347385	347390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017552	TA	4	8	351303	351310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017552	GA	3	6	358160	358165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.