MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 1738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017552	AAT	2	6	219452	219457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017552	TA	3	6	219559	219564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017552	TGT	2	6	219581	219586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017552	GATTC	2	10	219589	219598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_017552	ATGA	2	8	219634	219641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017552	CTT	2	6	219718	219723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017552	CATTG	2	10	223041	223050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_017552	CGT	2	6	223064	223069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017552	AG	3	6	223108	223113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017552	CTT	2	6	223115	223120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017552	ATT	2	6	223159	223164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017552	AAT	2	6	223234	223239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017552	TG	3	6	223246	223251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017552	GTCTT	2	10	223327	223336	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_017552	T	6	6	223377	223382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017552	AAC	2	6	223387	223392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017552	TTA	2	6	223450	223455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017552	ATTT	2	8	223495	223502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017552	T	6	6	223543	223548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017552	ATC	2	6	223604	223609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017552	TCAA	2	8	223637	223644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_017552	TTC	2	6	223685	223690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017552	T	6	6	223749	223754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017552	ACC	2	6	223766	223771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017552	TA	3	6	223963	223968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017552	AGA	2	6	224032	224037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017552	ATA	2	6	224091	224096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017552	AG	3	6	224099	224104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017552	TTTAT	2	10	225361	225370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017552	TTCA	2	8	225431	225438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_017552	ATT	2	6	225544	225549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017552	ATT	2	6	225594	225599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017552	CA	3	6	225635	225640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_017552	T	6	6	225650	225655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017552	TCG	2	6	225659	225664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017552	A	6	6	225697	225702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017552	TAC	2	6	225772	225777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017552	TAT	2	6	225796	225801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017552	TTA	2	6	225808	225813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017552	TCA	2	6	225827	225832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017552	TAT	2	6	225849	225854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017552	ATA	2	6	225861	225866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017552	TTA	2	6	225944	225949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1047	NC_017552	AT	3	6	226070	226075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017552	T	6	6	226103	226108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017552	A	6	6	226138	226143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017552	TAA	2	6	226172	226177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017552	AGT	2	6	226183	226188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017552	T	7	7	226256	226262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017552	ACT	2	6	227450	227455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017552	TACT	2	8	227461	227468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_017552	CCT	2	6	227489	227494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_017552	AT	4	8	227561	227568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017552	ATT	2	6	227573	227578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017552	GAT	2	6	227582	227587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1060	NC_017552	TTTA	2	8	227738	227745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017552	TAAG	2	8	227746	227753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017552	AGA	2	6	227812	227817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017552	AAC	2	6	227827	227832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017552	A	6	6	227855	227860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017552	TTA	2	6	227875	227880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017552	AC	3	6	227886	227891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017552	ATTTA	2	10	227892	227901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017552	AGA	2	6	227942	227947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017552	TAA	2	6	228006	228011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017552	AGT	2	6	228017	228022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_017552	GTA	2	6	228084	228089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017552	GTT	2	6	228123	228128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_017552	ATT	2	6	228251	228256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017552	TTA	2	6	228257	228262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_017552	TAT	2	6	228390	228395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_017552	GTTT	2	8	229369	229376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017552	TAT	2	6	229429	229434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_017552	A	6	6	229452	229457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017552	A	6	6	229534	229539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1107	NC_017552	GTA	2	6	229682	229687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1110	NC_017552	TTAA	2	8	229900	229907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017552	AGT	2	6	229997	230002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_017552	TA	3	6	230221	230226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017552	AG	3	6	232121	232126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017552	TAGAA	2	10	232238	232247	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017552	CAA	2	6	232253	232258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017552	CTTCT	2	10	232279	232288	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1119	NC_017552	ATT	2	6	232329	232334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017552	T	6	6	232387	232392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017552	TTAAAA	2	12	232436	232447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1124	NC_017552	ACA	2	6	233085	233090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017552	AAAG	2	8	233101	233108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017552	TA	3	6	233155	233160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017552	TCA	2	6	234225	234230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1131	NC_017552	TTTC	2	8	234354	234361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_017552	ATT	2	6	234446	234451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_017552	ATA	2	6	234498	234503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017552	AAT	2	6	234507	234512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_017552	T	7	7	236059	236065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_017552	TAA	2	6	297366	297371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_017552	T	6	6	297395	297400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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