MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 4003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017546	GCA	2	6	1680	1685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017546	TGA	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017546	AAT	2	6	5958	5963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017546	TAA	2	6	7922	7927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017546	TTA	2	6	7933	7938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017546	TAA	2	6	12772	12777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017546	TAT	2	6	12822	12827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017546	AGT	2	6	15817	15822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017546	CTT	2	6	16075	16080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017546	CAG	2	6	19419	19424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017546	TAA	2	6	19449	19454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017546	AGT	2	6	19475	19480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017546	TTG	2	6	19575	19580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017546	TTC	2	6	19655	19660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017546	CTA	2	6	19664	19669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017546	TGT	2	6	19804	19809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017546	CTC	2	6	21368	21373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017546	ATT	2	6	21510	21515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017546	GAG	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017546	TCA	2	6	23042	23047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017546	AAG	2	6	25781	25786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017546	GGA	2	6	27416	27421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017546	TCA	2	6	28898	28903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017546	GTC	2	6	29027	29032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017546	CAA	2	6	34542	34547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017546	AGG	2	6	40438	40443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017546	TCT	2	6	40454	40459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017546	AAT	2	6	40546	40551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017546	ATG	2	6	40564	40569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017546	AGG	2	6	41679	41684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017546	AGA	2	6	41685	41690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017546	AGG	2	6	45246	45251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017546	TTG	2	6	49293	49298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017546	ATA	2	6	49376	49381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017546	ATT	2	6	49403	49408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017546	AGG	2	6	49505	49510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017546	GAG	2	6	49853	49858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017546	AGG	2	6	50436	50441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017546	AAG	2	6	50770	50775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017546	TAT	2	6	51550	51555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017546	TTA	2	6	51665	51670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017546	GGA	2	6	52555	52560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017546	TGA	2	6	54656	54661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017546	ATA	2	6	54682	54687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017546	TGA	2	6	54689	54694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017546	AAT	2	6	60129	60134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017546	ATA	2	6	60420	60425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017546	CAA	2	6	60739	60744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017546	CAA	2	6	75636	75641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017546	AAC	2	6	75668	75673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017546	GTA	2	6	75681	75686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017546	ATA	2	6	76130	76135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017546	ATC	2	6	76925	76930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017546	GTA	2	6	76975	76980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017546	GAT	2	6	77398	77403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017546	ATT	2	6	77489	77494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017546	CCA	2	6	77637	77642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017546	GCA	2	6	77777	77782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017546	AAC	2	6	77785	77790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017546	GGA	2	6	78014	78019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017546	ACT	2	6	78819	78824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017546	GAG	2	6	81583	81588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017546	GTT	2	6	82643	82648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017546	AGC	2	6	82663	82668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017546	TAA	2	6	82778	82783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017546	AAT	2	6	82788	82793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017546	ATT	2	6	82811	82816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017546	TAA	2	6	82856	82861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017546	TAC	2	6	82864	82869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017546	GTT	2	6	82886	82891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017546	CTT	2	6	84794	84799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017546	AAT	2	6	84859	84864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017546	TAA	2	6	84879	84884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017546	ATA	2	6	84897	84902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017546	AAT	2	6	84920	84925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017546	AGG	2	6	84945	84950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017546	CTA	2	6	85585	85590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017546	TAA	2	6	85610	85615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017546	CAA	2	6	85702	85707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017546	TGT	2	6	86250	86255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017546	TAA	2	6	86670	86675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017546	TGT	2	6	87715	87720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017546	TAA	2	6	87792	87797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017546	GAT	2	6	87802	87807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017546	TAG	2	6	87846	87851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017546	TAG	2	6	87898	87903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017546	ATA	2	6	88013	88018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017546	ACA	2	6	97030	97035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017546	ACA	2	6	103871	103876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017546	AAT	2	6	103893	103898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017546	AGG	2	6	104057	104062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017546	AGG	2	6	105047	105052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017546	GGA	2	6	105874	105879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017546	TAA	2	6	106884	106889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017546	ATA	2	6	107372	107377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017546	AGG	2	6	107420	107425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017546	CCT	2	6	107798	107803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017546	TGC	2	6	108187	108192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017546	TAT	2	6	108200	108205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017546	AAT	2	6	108217	108222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017546	GTT	2	6	108245	108250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017546	AGG	2	6	109268	109273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017546	AAG	2	6	109733	109738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017546	CCG	2	6	109749	109754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017546	AGG	2	6	116894	116899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017546	AAT	2	6	118894	118899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017546	CAA	2	6	120494	120499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017546	TTC	2	6	120532	120537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017546	TCC	2	6	121391	121396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017546	ACT	2	6	121562	121567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017546	CAT	2	6	122480	122485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017546	ATA	2	6	122573	122578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017546	ATG	2	6	122580	122585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017546	GGA	2	6	122665	122670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017546	ATT	2	6	122675	122680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017546	AGG	2	6	123682	123687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017546	GAA	2	6	124033	124038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017546	AGG	2	6	129139	129144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017546	AGG	2	6	130172	130177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017546	GCT	2	6	131336	131341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017546	AGG	2	6	133884	133889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017546	CTT	2	6	136237	136242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017546	TAT	2	6	136273	136278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017546	TGA	2	6	136351	136356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017546	AGG	2	6	136391	136396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017546	AAT	2	6	136970	136975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017546	TCT	2	6	136995	137000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017546	AAT	2	6	137051	137056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017546	GTG	2	6	137080	137085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017546	CAG	2	6	137109	137114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017546	AGT	2	6	137167	137172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017546	ATT	2	6	140958	140963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017546	ATA	2	6	143200	143205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017546	ATT	2	6	144222	144227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017546	GAT	2	6	144228	144233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017546	ATA	2	6	144324	144329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017546	ATA	2	6	144885	144890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017546	GGC	2	6	144975	144980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017546	CAA	2	6	144994	144999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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