MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 8479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017545	ACG	2	6	209198	209203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017545	CAG	2	6	209213	209218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017545	AGCA	2	8	209238	209245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_017545	AG	3	6	209302	209307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017545	ATT	2	6	209329	209334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017545	A	6	6	209340	209345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017545	TAA	2	6	210966	210971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017545	A	6	6	210970	210975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017545	AC	4	8	210995	211002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_017545	A	6	6	211004	211009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017545	ATT	2	6	211035	211040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017545	GAA	2	6	211045	211050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017545	T	6	6	211067	211072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017545	T	7	7	211075	211081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017545	AGA	2	6	211082	211087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017545	ATATA	2	10	211124	211133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017545	A	6	6	211204	211209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017545	CT	4	8	211221	211228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_017545	AATT	2	8	212839	212846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017545	AAT	2	6	212866	212871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017545	T	6	6	212881	212886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017545	AAG	2	6	212903	212908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017545	TAAC	2	8	212910	212917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_017545	GAG	2	6	213003	213008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017545	GAAA	2	8	214949	214956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017545	A	6	6	214954	214959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017545	AT	3	6	215886	215891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017545	GGA	2	6	215899	215904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017545	A	6	6	216348	216353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017545	AGG	2	6	216360	216365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017545	A	6	6	216844	216849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017545	CTT	2	6	216873	216878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017545	T	6	6	216877	216882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017545	CTC	2	6	217966	217971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_017545	AGTA	2	8	217980	217987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017545	A	7	7	217992	217998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017545	TCC	2	6	218983	218988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_017545	A	6	6	218992	218997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017545	A	6	6	219061	219066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017545	GTT	2	6	219067	219072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017545	GTA	2	6	219095	219100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017545	ACAAA	2	10	219173	219182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
543	NC_017545	GAGTG	2	10	219252	219261	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017545	T	6	6	219263	219268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017545	AATA	2	8	219898	219905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017545	TTTG	2	8	219923	219930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017545	T	8	8	219943	219950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017545	AGG	2	6	219969	219974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017545	A	7	7	220606	220612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017545	GAC	2	6	221239	221244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017545	TCTT	2	8	221275	221282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_017545	GAAT	2	8	221313	221320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017545	TTA	2	6	224892	224897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017545	GAAG	2	8	224899	224906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017545	T	6	6	226854	226859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017545	T	6	6	226885	226890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017545	T	7	7	226978	226984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017545	GGGA	2	8	227024	227031	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017545	AGCCG	2	10	227430	227439	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
560	NC_017545	TAT	2	6	227520	227525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017545	AGG	2	6	227557	227562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017545	T	7	7	227568	227574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017545	AATT	2	8	228012	228019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017545	TAA	2	6	228065	228070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017545	A	6	6	228069	228074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017545	GAAG	2	8	228092	228099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017545	ATTA	2	8	230058	230065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017545	ATAG	2	8	230096	230103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017545	GAAAAC	2	12	230111	230122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
570	NC_017545	A	6	6	230123	230128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017545	AATA	2	8	230213	230220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017545	A	6	6	230223	230228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017545	TAA	2	6	230236	230241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017545	TAA	2	6	230283	230288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017545	GAA	2	6	230295	230300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017545	AAC	2	6	230332	230337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017545	GAG	2	6	230389	230394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017545	TAT	2	6	232520	232525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_017545	TA	3	6	233382	233387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017545	AATT	2	8	234338	234345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017545	ATAG	2	8	234367	234374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017545	AG	3	6	235320	235325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017545	T	6	6	235344	235349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017545	A	8	8	235353	235360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017545	CAG	2	6	235396	235401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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599	NC_017545	AT	3	6	235827	235832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_017545	A	6	6	235953	235958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017545	GAAAA	2	10	235960	235969	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017545	AT	3	6	236030	236035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017545	AAC	2	6	236047	236052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017545	AAACA	2	10	236053	236062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_017545	TTC	2	6	236069	236074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_017545	T	6	6	236108	236113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017545	T	7	7	236147	236153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017545	TAA	2	6	236181	236186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017545	GAA	2	6	236212	236217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017545	AT	3	6	236293	236298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017545	AGA	2	6	236305	236310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_017545	AT	3	6	236466	236471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017545	TGATA	2	10	236530	236539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017545	A	6	6	236558	236563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017545	TGC	2	6	236584	236589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017545	T	6	6	236647	236652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017545	AGA	2	6	236653	236658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017545	A	6	6	236663	236668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017545	AGC	2	6	236698	236703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017545	ATT	2	6	236723	236728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017545	GGTTTT	2	12	236738	236749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017545	ACG	2	6	236782	236787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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632	NC_017545	GGAA	2	8	236887	236894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017545	CAA	2	6	236901	236906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017545	ATG	2	6	236949	236954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017545	A	6	6	237901	237906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017545	GAATA	2	10	239049	239058	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017545	TGT	2	6	240606	240611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017545	A	7	7	240620	240626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017545	AT	3	6	240687	240692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017545	AAAC	2	8	240710	240717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_017545	TCA	2	6	240727	240732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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643	NC_017545	T	7	7	240743	240749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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