MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 3879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017544	TGA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017544	AAT	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017544	TAA	2	6	7987	7992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017544	TTA	2	6	7998	8003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017544	TAA	2	6	12837	12842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017544	TAT	2	6	12887	12892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017544	AGT	2	6	15882	15887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017544	CTT	2	6	16140	16145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017544	CTC	2	6	21433	21438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017544	ATT	2	6	21575	21580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017544	GAG	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017544	TCA	2	6	23107	23112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017544	AAG	2	6	25846	25851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017544	GGA	2	6	27481	27486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017544	TCA	2	6	28963	28968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017544	GTC	2	6	29092	29097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017544	CAA	2	6	34608	34613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017544	AGG	2	6	40504	40509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017544	TCT	2	6	40520	40525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017544	AAT	2	6	40612	40617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017544	ATG	2	6	40630	40635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017544	AGG	2	6	41745	41750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017544	AGA	2	6	41751	41756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017544	AGG	2	6	45312	45317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017544	TTG	2	6	49359	49364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017544	ATA	2	6	49442	49447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017544	ATT	2	6	49469	49474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017544	AGG	2	6	49571	49576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017544	GAG	2	6	49919	49924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017544	AGG	2	6	50502	50507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017544	AAG	2	6	50836	50841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017544	TAT	2	6	51615	51620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017544	TTA	2	6	51730	51735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017544	GGA	2	6	52620	52625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017544	TAT	2	6	54016	54021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017544	ATT	2	6	54200	54205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017544	ACA	2	6	54212	54217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017544	ATT	2	6	54272	54277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017544	TGC	2	6	54294	54299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017544	AGA	2	6	54331	54336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017544	AAG	2	6	54392	54397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017544	ATT	2	6	54398	54403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017544	GAA	2	6	54505	54510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017544	GTG	2	6	54604	54609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017544	CAT	2	6	54638	54643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017544	TGA	2	6	54720	54725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017544	ATA	2	6	54746	54751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017544	TGA	2	6	54753	54758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017544	AAT	2	6	60193	60198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017544	ATA	2	6	60484	60489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017544	CAA	2	6	60803	60808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017544	CAA	3	9	66096	66104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017544	ACA	2	6	66116	66121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017544	GCA	2	6	72759	72764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017544	AGA	2	6	72785	72790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017544	ATA	2	6	72811	72816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017544	AGA	2	6	72865	72870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017544	AGA	2	6	72938	72943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017544	CTA	2	6	73131	73136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017544	ATT	2	6	73241	73246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017544	CTA	2	6	73430	73435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017544	GTG	2	6	73460	73465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017544	ATT	2	6	73489	73494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017544	TGC	2	6	73500	73505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017544	ATT	2	6	73513	73518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017544	TAA	2	6	73686	73691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017544	CAG	2	6	73698	73703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017544	ACT	2	6	73716	73721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017544	AAC	2	6	73722	73727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017544	AGG	2	6	73752	73757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017544	ATT	2	6	74669	74674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017544	TAG	3	9	75006	75014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017544	TAA	2	6	75026	75031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017544	TTA	2	6	75737	75742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017544	ACT	2	6	76594	76599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017544	GAG	2	6	79361	79366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017544	GTT	2	6	80421	80426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017544	AGC	2	6	80441	80446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017544	TAA	2	6	80556	80561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017544	AAT	2	6	80566	80571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017544	ATG	2	6	80648	80653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017544	GTT	2	6	80664	80669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017544	ATA	2	6	80782	80787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017544	AGG	2	6	80794	80799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017544	TCT	2	6	80842	80847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017544	ATA	2	6	80854	80859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017544	ATA	2	6	80925	80930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017544	TTG	2	6	80943	80948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017544	ATG	2	6	82482	82487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017544	ATC	2	6	82489	82494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017544	TGT	2	6	83116	83121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017544	TAA	2	6	83536	83541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017544	TGT	2	6	84581	84586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017544	TAA	2	6	84658	84663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017544	GAT	2	6	84668	84673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017544	TAG	2	6	84712	84717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017544	TAG	2	6	84764	84769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017544	ATA	2	6	84879	84884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017544	ACA	2	6	93896	93901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017544	ACA	2	6	100737	100742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017544	AAT	2	6	100759	100764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017544	AGG	2	6	100923	100928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017544	AGG	2	6	101913	101918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017544	GGA	2	6	102740	102745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017544	TAA	2	6	103751	103756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017544	ATA	2	6	104239	104244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017544	AGG	2	6	104287	104292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017544	CCT	2	6	104665	104670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017544	TGC	2	6	105054	105059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017544	TAT	2	6	105067	105072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017544	AAT	2	6	105084	105089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017544	GTT	2	6	105112	105117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017544	AGG	2	6	106136	106141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017544	AAG	2	6	106601	106606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017544	CCG	2	6	106617	106622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017544	AGG	2	6	113762	113767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017544	AAT	2	6	115761	115766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017544	CAA	2	6	117361	117366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017544	TTC	2	6	117399	117404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017544	TCC	2	6	118258	118263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017544	ACT	2	6	118429	118434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017544	CAT	2	6	119347	119352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017544	ATA	2	6	119440	119445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017544	ATG	2	6	119447	119452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017544	GGA	2	6	119532	119537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017544	ATT	2	6	119542	119547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017544	AGG	2	6	120549	120554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017544	GAA	2	6	120900	120905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017544	AGG	2	6	126006	126011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017544	AGG	2	6	127039	127044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017544	GCT	2	6	128203	128208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017544	AGG	2	6	130751	130756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017544	CTT	2	6	133102	133107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017544	TAT	2	6	133138	133143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017544	TGA	2	6	133216	133221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017544	AGG	2	6	133256	133261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017544	AAT	2	6	133835	133840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_017544	AAT	2	6	133916	133921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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