MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 8189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017544	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017544	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017544	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017544	G	7	7	306	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017544	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017544	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017544	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017544	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017544	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017544	T	8	8	3055	3062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017544	A	7	7	4476	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017544	T	7	7	4505	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017544	AATA	2	8	4513	4520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017544	C	6	6	4525	4530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_017544	A	7	7	4543	4549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017544	AT	3	6	4562	4567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017544	TGA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017544	AAAG	2	8	6007	6014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017544	AAT	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017544	TAA	2	6	7987	7992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017544	TTA	2	6	7998	8003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017544	T	7	7	10644	10650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017544	A	6	6	10657	10662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017544	A	6	6	10707	10712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017544	A	7	7	12824	12830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017544	TAA	2	6	12837	12842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017544	A	6	6	12853	12858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017544	TAT	2	6	12887	12892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017544	AGT	2	6	15882	15887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017544	T	7	7	15912	15918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017544	AT	3	6	15977	15982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017544	A	6	6	16065	16070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017544	T	7	7	16080	16086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017544	T	6	6	16110	16115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017544	CTT	2	6	16140	16145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017544	G	6	6	17330	17335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017544	CTC	2	6	21433	21438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017544	T	6	6	21501	21506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017544	A	6	6	21563	21568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017544	ATT	2	6	21575	21580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017544	GAG	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017544	TCA	2	6	23107	23112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017544	A	6	6	24122	24127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017544	CG	3	6	24166	24171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017544	AAG	2	6	25846	25851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017544	GGA	2	6	27481	27486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017544	T	6	6	28237	28242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017544	AAAT	2	8	28905	28912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017544	A	7	7	28920	28926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017544	AT	3	6	28952	28957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017544	TCA	2	6	28963	28968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017544	A	6	6	29069	29074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017544	AGGA	2	8	29083	29090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017544	GTC	2	6	29092	29097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017544	TAAA	2	8	31012	31019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017544	A	7	7	31066	31072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017544	T	6	6	32083	32088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017544	T	7	7	32110	32116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017544	T	6	6	32143	32148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017544	GAAA	2	8	32165	32172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017544	A	6	6	32181	32186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017544	A	7	7	32541	32547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017544	T	6	6	32566	32571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017544	CCTT	2	8	33388	33395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017544	CAA	2	6	34608	34613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017544	AGG	2	6	40504	40509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017544	TCT	2	6	40520	40525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017544	A	7	7	40590	40596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017544	AAT	2	6	40612	40617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017544	ATG	2	6	40630	40635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017544	AAAT	2	8	40683	40690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017544	AGG	2	6	41745	41750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017544	AGA	2	6	41751	41756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017544	C	6	6	41776	41781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_017544	AGG	2	6	45312	45317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017544	ATAA	2	8	47246	47253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017544	GACTT	2	10	47275	47284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017544	TAAA	2	8	47308	47315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017544	AGTG	2	8	47325	47332	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017544	T	8	8	48006	48013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017544	TC	3	6	48027	48032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017544	TTAG	2	8	48059	48066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017544	TTG	2	6	49359	49364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017544	ATA	2	6	49442	49447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017544	ATT	2	6	49469	49474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017544	GCTC	2	8	49479	49486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017544	ATGGT	2	10	49529	49538	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017544	AGG	2	6	49571	49576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017544	GAG	2	6	49919	49924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017544	AGG	2	6	50502	50507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017544	T	6	6	50792	50797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017544	AAG	2	6	50836	50841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017544	TATT	2	8	50853	50860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017544	TA	3	6	50872	50877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017544	A	7	7	50883	50889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017544	T	7	7	51562	51568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017544	TAAA	2	8	51584	51591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017544	TAT	2	6	51615	51620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017544	A	6	6	51661	51666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017544	T	6	6	51682	51687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017544	TTA	2	6	51730	51735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017544	TAAAA	2	10	52567	52576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017544	GGA	2	6	52620	52625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017544	AT	3	6	54001	54006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017544	TAT	2	6	54016	54021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017544	T	6	6	54115	54120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017544	ATT	2	6	54200	54205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017544	ACA	2	6	54212	54217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017544	AGTTA	2	10	54225	54234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017544	ATT	2	6	54272	54277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017544	TGC	2	6	54294	54299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017544	AAGC	2	8	54323	54330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017544	AGA	2	6	54331	54336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017544	AAG	2	6	54392	54397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017544	ATT	2	6	54398	54403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017544	T	6	6	54428	54433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017544	GAA	2	6	54505	54510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017544	GTG	2	6	54604	54609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017544	CAT	2	6	54638	54643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017544	ATTA	2	8	54648	54655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017544	T	7	7	54692	54698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017544	TGA	2	6	54720	54725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017544	ATA	2	6	54746	54751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017544	TGA	2	6	54753	54758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017544	GTTA	2	8	54762	54769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017544	TTATG	2	10	54773	54782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017544	A	7	7	54816	54822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017544	AAT	2	6	60193	60198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017544	ATA	2	6	60484	60489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017544	CAA	2	6	60803	60808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017544	CATA	2	8	60818	60825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017544	T	6	6	60862	60867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017544	TA	3	6	60914	60919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017544	A	6	6	60919	60924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017544	A	7	7	64929	64935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017544	CAA	3	9	66096	66104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017544	ACA	2	6	66116	66121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017544	AAAG	2	8	71717	71724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017544	AAAAT	2	10	72705	72714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017544	GCA	2	6	72759	72764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017544	GGTA	2	8	72765	72772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017544	AGA	2	6	72785	72790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017544	ATA	2	6	72811	72816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017544	AGA	2	6	72865	72870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017544	TC	3	6	72914	72919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017544	AGA	2	6	72938	72943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017544	CTA	2	6	73131	73136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017544	ATGGA	2	10	73222	73231	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017544	ATT	2	6	73241	73246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017544	AT	3	6	73286	73291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017544	A	7	7	73394	73400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_017544	T	6	6	191105	191110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017544	CTA	2	6	191122	191127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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