MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes M7 chromosome

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017537	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017537	AAAAAT	2	12	44930	44941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017537	GTGGCT	2	12	71195	71206	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017537	GCAGTG	2	12	79261	79272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017537	GTCTGC	2	12	89848	89859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017537	CAGGTT	2	12	165014	165025	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017537	TAAAAA	2	12	192458	192469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017537	TTTTTC	2	12	215846	215857	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017537	GAAAAC	2	12	245656	245667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017537	ATTCAA	2	12	256541	256552	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017537	AAGGAA	2	12	258112	258123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017537	TAGGCG	2	12	259767	259778	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017537	ATTCAA	2	12	262563	262574	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017537	AAGGAA	2	12	264134	264145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017537	TAGGCG	2	12	265789	265800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017537	TTATAT	2	12	282392	282403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017537	AACTTT	2	12	311466	311477	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017537	ATTAAA	2	12	361154	361165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017537	CATAGA	2	12	369707	369718	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017537	TAGTTT	2	12	407743	407754	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017537	AAAACA	2	12	426015	426026	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017537	TTGTTT	2	12	426042	426053	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017537	AGCGGC	2	12	447587	447598	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017537	AATAAA	2	12	463379	463390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017537	ATAAAT	2	12	542045	542056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017537	AAATGT	2	12	558205	558216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017537	TAAGGA	2	12	558747	558758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017537	TTATCT	2	12	558866	558877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017537	AAATGT	2	12	568207	568218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017537	AGATTT	2	12	577027	577038	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017537	AAATAA	2	12	617413	617424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017537	ATCATT	2	12	647833	647844	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017537	ATCATT	2	12	684729	684740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017537	GAATAA	2	12	709666	709677	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017537	TATAGG	2	12	734694	734705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017537	AATTAG	2	12	762599	762610	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017537	AAATAG	2	12	883728	883739	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017537	GTAATC	2	12	890531	890542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017537	TTACAA	2	12	890549	890560	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017537	ATGAAA	2	12	899154	899165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017537	TTGACT	2	12	1026220	1026231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017537	AGGAAG	2	12	1036398	1036409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017537	AGGTTT	2	12	1064861	1064872	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017537	CTTTTT	2	12	1082529	1082540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017537	AAAAAT	2	12	1112406	1112417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017537	TTTAGT	2	12	1121342	1121353	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017537	TTTTTA	2	12	1157144	1157155	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017537	CTTTTT	2	12	1160680	1160691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017537	CTTTTT	2	12	1192482	1192493	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017537	GAAAAA	2	12	1222464	1222475	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017537	GTTTAT	2	12	1266945	1266956	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017537	AGGTGA	2	12	1297117	1297128	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017537	TATTAA	2	12	1302288	1302299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017537	ACAATT	2	12	1322838	1322849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017537	ACAATT	2	12	1324984	1324995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017537	GTACAA	2	12	1422857	1422868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017537	TTTTAA	2	12	1450094	1450105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017537	TACCAA	2	12	1475488	1475499	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017537	AAAGCC	2	12	1518523	1518534	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017537	CTCTTC	2	12	1602386	1602397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017537	TAAAAA	2	12	1617849	1617860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017537	TAATTA	2	12	1638708	1638719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017537	GGTTGT	2	12	1658221	1658232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017537	GAATAA	2	12	1659776	1659787	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017537	GTAAAC	2	12	1660927	1660938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017537	ACAAAA	2	12	1669553	1669564	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017537	AAAATA	2	12	1673875	1673886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017537	AAATAA	2	12	1718795	1718806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017537	CGCCTA	2	12	1754079	1754090	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017537	TTTCCT	2	12	1755731	1755742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017537	TTGAAT	2	12	1757303	1757314	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017537	CTTCTA	2	12	1775562	1775573	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017537	CGCCTA	2	12	1859116	1859127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017537	TTTCCT	2	12	1860768	1860779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017537	TTGAAT	2	12	1862340	1862351	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017537	TTATTT	2	12	1868657	1868668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017537	CTCTAT	2	12	1973569	1973580	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017537	TCATTT	2	12	1974767	1974778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017537	GTTTTC	2	12	2001934	2001945	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017537	CAAAAA	2	12	2019658	2019669	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017537	GAAAAA	2	12	2023520	2023531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017537	AGAAAA	2	12	2030353	2030364	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017537	TTCACT	2	12	2161369	2161380	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017537	TATATT	2	12	2243042	2243053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017537	AATTTT	2	12	2299242	2299253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017537	AAATTG	2	12	2305418	2305429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017537	CTCTGT	2	12	2312262	2312273	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017537	TAATAC	2	12	2396020	2396031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017537	CGCCTA	2	12	2420796	2420807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017537	TTTCCT	2	12	2422700	2422711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017537	TTGAAT	2	12	2424273	2424284	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017537	TAAAAT	2	12	2502725	2502736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017537	CTTTTT	2	12	2575776	2575787	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017537	ATTTAA	2	12	2588180	2588191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017537	ATCCCA	2	12	2595677	2595688	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017537	TTTTTA	2	12	2607505	2607516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017537	GAAAAA	2	12	2616897	2616908	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017537	CGCCTA	2	12	2655771	2655782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017537	TTTCCT	2	12	2657675	2657686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017537	TTGAAT	2	12	2659248	2659259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017537	CGTCTT	2	12	2688383	2688394	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017537	TCGGTT	2	12	2729211	2729222	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017537	CCTCTT	2	12	2744396	2744407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017537	TAAATC	2	12	2765867	2765878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017537	CAAAAA	2	12	2802878	2802889	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017537	CATATC	2	12	2864318	2864329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017537	TATCAA	2	12	2914689	2914700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017537	AAATGA	2	12	2914703	2914714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017537	TAAAAA	2	12	2914773	2914784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017537	AAGTAT	2	12	2915648	2915659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017537	CTCTTA	2	12	2922740	2922751	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.