MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes L99

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017529	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017529	GTGGCT	2	12	71195	71206	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017529	AAAATT	2	12	82392	82403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017529	GTCTGC	2	12	89848	89859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017529	CAGGTT	2	12	165015	165026	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017529	TAAAAA	2	12	192459	192470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017529	TTTTTC	2	12	215846	215857	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017529	GAAAAC	2	12	245655	245666	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017529	ATTCAA	2	12	256744	256755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017529	AAGGAA	2	12	258315	258326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017529	TAGGCG	2	12	259968	259979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017529	ATTCAA	2	12	262762	262773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017529	AAGGAA	2	12	264333	264344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017529	TAGGCG	2	12	265986	265997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017529	TTATAT	2	12	282589	282600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017529	AACTTT	2	12	311663	311674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017529	ATTAAA	2	12	361351	361362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017529	CATAGA	2	12	369904	369915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017529	TAGTTT	2	12	409457	409468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017529	AAAACA	2	12	427729	427740	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017529	TTGTTT	2	12	427756	427767	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017529	AGCGGC	2	12	449301	449312	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017529	AATAAA	2	12	465092	465103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017529	ATAAAT	2	12	543757	543768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017529	AAATGT	2	12	559917	559928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017529	TAAGGA	2	12	560459	560470	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017529	TTATCT	2	12	560578	560589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017529	AAATGT	2	12	569919	569930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017529	AGATTT	2	12	578739	578750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017529	AAATAA	2	12	619127	619138	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017529	ATCATT	2	12	649637	649648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017529	ATCATT	2	12	686533	686544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017529	GAATAA	2	12	711710	711721	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017529	ACTTTT	2	12	718288	718299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017529	TATAGG	2	12	736738	736749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017529	AATTAG	2	12	764643	764654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017529	AAATAG	2	12	885770	885781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017529	GTAATC	2	12	892573	892584	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017529	TTACAA	2	12	892591	892602	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017529	ATGAAA	2	12	901196	901207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017529	TTGACT	2	12	1028263	1028274	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017529	AGGAAG	2	12	1038441	1038452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017529	AGGTTT	2	12	1066904	1066915	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017529	CTTTTT	2	12	1084572	1084583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017529	AAAAAT	2	12	1114450	1114461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017529	TTTAGT	2	12	1123386	1123397	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017529	CTTTTT	2	12	1162724	1162735	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017529	CTTTTT	2	12	1194526	1194537	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017529	GAAAAA	2	12	1224508	1224519	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017529	GTTTAT	2	12	1268986	1268997	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017529	AGGTGA	2	12	1299158	1299169	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017529	TATTAA	2	12	1304329	1304340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017529	ACAATT	2	12	1324879	1324890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017529	ACAATT	2	12	1327025	1327036	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017529	GTACAA	2	12	1424898	1424909	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017529	TTTTAA	2	12	1452135	1452146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017529	TACCAA	2	12	1477529	1477540	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017529	AAAGCC	2	12	1520564	1520575	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017529	CTCTTC	2	12	1604425	1604436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017529	TAAAAA	2	12	1619888	1619899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017529	TAATTA	2	12	1640747	1640758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017529	ATATCT	2	12	1644134	1644145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017529	GGTTGT	2	12	1660260	1660271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017529	GAATAA	2	12	1661815	1661826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017529	GTAAAC	2	12	1662966	1662977	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017529	ACAAAA	2	12	1671592	1671603	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017529	AAAATA	2	12	1675914	1675925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017529	CGCCTA	2	12	1756119	1756130	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017529	TTTCCT	2	12	1757771	1757782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017529	TTGAAT	2	12	1759343	1759354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017529	CTTCTA	2	12	1777602	1777613	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017529	CGCCTA	2	12	1861156	1861167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017529	TTTCCT	2	12	1862808	1862819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017529	TTGAAT	2	12	1864380	1864391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017529	TTATTT	2	12	1870697	1870708	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017529	CTCTAT	2	12	1975646	1975657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017529	TCATTT	2	12	1976844	1976855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017529	GTTTTC	2	12	2004010	2004021	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017529	CAAAAA	2	12	2021734	2021745	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017529	GAAAAA	2	12	2025596	2025607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017529	AGAAAA	2	12	2032429	2032440	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017529	TTCACT	2	12	2163424	2163435	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017529	TATATT	2	12	2245091	2245102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017529	TAGTAA	2	12	2299568	2299579	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017529	AATTTT	2	12	2301291	2301302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017529	AAATTG	2	12	2307467	2307478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017529	CTCTGT	2	12	2314311	2314322	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017529	TAATAC	2	12	2398069	2398080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017529	CGCCTA	2	12	2422843	2422854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017529	TTTCCT	2	12	2424747	2424758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017529	TTGAAT	2	12	2426319	2426330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017529	TAAAAT	2	12	2504771	2504782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017529	CTTTTT	2	12	2577822	2577833	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017529	ATTTAA	2	12	2590226	2590237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017529	ATCCCA	2	12	2597723	2597734	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017529	TTTTTA	2	12	2609551	2609562	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017529	GAAAAA	2	12	2618943	2618954	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017529	CGCCTA	2	12	2658807	2658818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017529	TTTCCT	2	12	2660710	2660721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017529	TTGAAT	2	12	2662282	2662293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017529	CGTCTT	2	12	2691417	2691428	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017529	AGATTA	2	12	2695970	2695981	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017529	TCGGTT	2	12	2732245	2732256	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017529	CCTCTT	2	12	2747430	2747441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017529	TAAATC	2	12	2768901	2768912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017529	CAAAAA	2	12	2805912	2805923	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017529	CATATC	2	12	2867353	2867364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017529	TATCAA	2	12	2917724	2917735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017529	AAATGA	2	12	2917738	2917749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017529	TAAAAA	2	12	2917808	2917819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017529	AAGTAT	2	12	2918683	2918694	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017529	CTCTTA	2	12	2925775	2925786	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.