MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	TG	3	6	1214	1219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017499	GA	3	6	4941	4946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017499	TA	4	8	5317	5324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017499	AT	3	6	5331	5336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017499	AT	3	6	5370	5375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017499	TA	4	8	6708	6715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017499	TA	3	6	6730	6735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017499	TA	3	6	6769	6774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017499	TA	3	6	8709	8714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017499	AT	3	6	8782	8787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017499	TA	4	8	8919	8926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017499	AT	3	6	11540	11545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017499	TA	4	8	11549	11556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017499	TA	3	6	11569	11574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017499	AT	3	6	11597	11602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017499	TA	3	6	14068	14073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017499	AT	3	6	14130	14135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017499	TA	3	6	14170	14175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017499	AT	3	6	15523	15528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017499	AG	3	6	17473	17478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017499	AT	3	6	20502	20507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017499	GA	3	6	21977	21982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017499	TA	3	6	27460	27465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017499	AT	3	6	29869	29874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017499	AT	3	6	42069	42074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017499	AC	3	6	42113	42118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017499	TA	3	6	47778	47783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017499	AG	3	6	49149	49154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017499	GA	3	6	49291	49296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017499	AT	3	6	52288	52293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017499	AT	3	6	55243	55248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017499	AT	3	6	55664	55669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017499	TA	3	6	57003	57008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017499	TA	3	6	60646	60651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017499	AC	3	6	61988	61993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017499	TA	3	6	62261	62266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017499	GT	4	8	62614	62621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017499	AT	3	6	62863	62868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017499	AT	3	6	63822	63827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017499	AG	3	6	63858	63863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017499	AT	3	6	67631	67636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017499	TC	3	6	67935	67940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017499	AG	3	6	68098	68103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017499	TA	3	6	68125	68130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017499	TG	3	6	68380	68385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017499	AT	4	8	69484	69491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017499	TA	3	6	73021	73026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017499	GT	3	6	82362	82367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017499	TA	3	6	83796	83801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017499	GT	3	6	84065	84070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017499	TA	3	6	84103	84108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017499	TA	3	6	84220	84225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017499	GA	3	6	84274	84279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017499	AT	3	6	92285	92290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017499	AT	3	6	92319	92324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017499	AT	4	8	93858	93865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017499	TA	3	6	118796	118801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017499	TC	3	6	119033	119038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017499	TA	3	6	119087	119092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017499	AT	3	6	123374	123379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017499	AT	3	6	123483	123488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017499	TA	3	6	128340	128345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017499	GA	3	6	128490	128495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017499	AC	3	6	128745	128750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017499	TA	3	6	129168	129173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017499	TA	3	6	131156	131161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017499	TA	3	6	135008	135013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017499	CT	3	6	135199	135204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017499	CA	3	6	136626	136631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017499	TC	3	6	136710	136715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017499	AT	3	6	137872	137877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017499	TC	3	6	141473	141478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017499	TC	3	6	141826	141831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017499	GT	3	6	141849	141854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017499	AC	3	6	141856	141861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017499	AC	3	6	141930	141935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017499	TC	3	6	141990	141995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017499	AC	3	6	142285	142290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017499	AT	3	6	143427	143432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017499	AT	3	6	150169	150174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017499	AT	3	6	150520	150525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017499	AT	3	6	151066	151071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017499	TA	3	6	151183	151188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017499	AG	3	6	151344	151349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017499	TA	3	6	151517	151522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017499	AT	3	6	152060	152065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017499	AG	3	6	152319	152324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017499	TA	3	6	157782	157787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017499	TA	3	6	159727	159732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017499	TA	3	6	160131	160136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017499	AT	3	6	160417	160422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017499	TG	3	6	166674	166679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017499	TA	3	6	167535	167540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017499	AT	4	8	168365	168372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017499	TA	3	6	168986	168991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017499	AC	3	6	176714	176719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017499	TC	3	6	178631	178636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017499	TA	3	6	178781	178786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017499	TC	3	6	189220	189225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017499	CT	3	6	189650	189655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017499	AT	3	6	190438	190443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017499	AT	3	6	194412	194417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017499	GT	3	6	194559	194564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017499	TG	3	6	198946	198951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017499	TA	3	6	203619	203624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017499	TC	3	6	205566	205571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017499	AT	3	6	205869	205874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017499	TA	3	6	205913	205918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017499	AC	3	6	206679	206684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017499	AT	3	6	206884	206889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017499	AT	3	6	206983	206988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017499	AC	3	6	207235	207240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017499	AT	3	6	208129	208134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017499	AT	3	6	208270	208275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017499	AT	3	6	208324	208329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017499	TA	3	6	209823	209828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017499	AT	3	6	209870	209875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017499	AT	3	6	215324	215329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017499	AT	3	6	215354	215359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017499	TA	3	6	215526	215531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017499	TA	3	6	219920	219925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017499	AT	3	6	220215	220220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017499	TA	3	6	222136	222141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017499	TG	3	6	231970	231975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017499	AT	3	6	234960	234965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017499	CT	3	6	241501	241506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017499	AT	3	6	241535	241540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017499	TA	3	6	242026	242031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.