MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	TTGATC	2	12	2752	2763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017499	ACATTA	2	12	8848	8859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017499	TATACA	2	12	11623	11634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017499	TGTAAA	2	12	17459	17470	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017499	AATGTG	2	12	42038	42049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017499	AATAAA	2	12	55457	55468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017499	AAGAGA	2	12	56500	56511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017499	ATTATA	2	12	64280	64291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017499	TTTTTC	2	12	68515	68526	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017499	GATAAA	2	12	71806	71817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017499	GTTGAT	2	12	83804	83815	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017499	TGTAGA	2	12	84110	84121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017499	TTAGAT	2	12	84652	84663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017499	TGAACT	2	12	99716	99727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017499	CGTCAT	2	12	110535	110546	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017499	ATCAAA	2	12	126180	126191	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017499	ACATCA	2	12	127967	127978	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017499	GATTAA	2	12	129008	129019	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017499	ATCTTT	2	12	138253	138264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017499	GTTTCA	2	12	138279	138290	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017499	ATTGAT	2	12	149915	149926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017499	AAAATT	2	12	151754	151765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017499	ATTAAA	2	12	154047	154058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017499	TTGATG	2	12	157865	157876	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017499	CATTTA	2	12	160106	160117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017499	ATTTTT	2	12	176584	176595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017499	TCTTTT	2	12	182429	182440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017499	AAATAT	2	12	188649	188660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017499	GTTACT	2	12	194847	194858	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017499	ACCTAT	2	12	206935	206946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017499	TATTCT	2	12	207630	207641	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017499	TCAAAG	2	12	208419	208430	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017499	ATACTG	2	12	208541	208552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017499	GCTACT	2	12	210335	210346	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017499	TTCCTA	2	12	215773	215784	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017499	TTCTCT	2	12	219835	219846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017499	AGCTTT	2	12	220183	220194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017499	GCAACT	2	12	231673	231684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.