MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	CTAAG	2	10	4739	4748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017499	CTATA	2	10	7063	7072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017499	CTAAG	2	10	14233	14242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017499	TGTAA	2	10	21987	21996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017499	TTGAA	2	10	29444	29453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017499	GAAAG	2	10	29733	29742	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017499	ATTCT	2	10	29841	29850	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017499	AACAA	2	10	49400	49409	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017499	AAGAT	2	10	52489	52498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017499	AAAAT	2	10	55035	55044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017499	TAAAA	2	10	62783	62792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017499	AGAAA	2	10	63087	63096	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017499	TTTTA	2	10	64202	64211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017499	AAGTT	2	10	64476	64485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017499	TACAT	2	10	66071	66080	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017499	ATAAA	2	10	68891	68900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017499	TTGTC	2	10	68954	68963	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017499	AAATT	2	10	69452	69461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017499	ATAAA	2	10	73056	73065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017499	GGAAT	2	10	74751	74760	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017499	AAACT	2	10	84022	84031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017499	TTCAT	2	10	93753	93762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017499	TAGTT	2	10	96793	96802	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017499	TTTCT	2	10	108136	108145	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017499	TGGAT	2	10	123334	123343	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017499	TATTT	2	10	129036	129045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017499	TAAAA	2	10	135418	135427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017499	AAATA	2	10	136600	136609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017499	TAAAA	2	10	138109	138118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017499	ATTTT	2	10	141607	141616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017499	TGATC	2	10	144987	144996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017499	TCAAT	2	10	145143	145152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017499	ATCAC	2	10	147347	147356	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017499	TGTTT	2	10	149903	149912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017499	TTTAC	2	10	150267	150276	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017499	ATTTA	2	10	150925	150934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017499	TATAA	2	10	151194	151203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017499	ACATT	2	10	151455	151464	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017499	ATTTT	2	10	154721	154730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017499	AATTC	2	10	158038	158047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017499	TTTTA	2	10	159824	159833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017499	TTATA	2	10	159984	159993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017499	ATTAA	2	10	160451	160460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017499	ATTTT	2	10	165011	165020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017499	AAAAC	2	10	165289	165298	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017499	TGCTT	2	10	166893	166902	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017499	ATAAA	2	10	169021	169030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017499	CACGA	2	10	178504	178513	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017499	TTTTA	2	10	189233	189242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017499	TAAAA	2	10	194478	194487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017499	AACAA	2	10	194954	194963	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017499	AAGTA	2	10	207016	207025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017499	TTTGA	2	10	207362	207371	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017499	TTTAC	2	10	208312	208321	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017499	AAATA	2	10	215947	215956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017499	GATTG	2	10	216005	216014	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017499	CATTA	2	10	216193	216202	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017499	AAATT	2	10	219401	219410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017499	AATTC	2	10	221366	221375	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017499	TCATT	2	10	226243	226252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017499	TTTTA	2	10	241879	241888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.