MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	ATTC	2	8	90	97	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017499	TAAT	2	8	1071	1078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017499	TTAA	2	8	1108	1115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017499	CTAT	2	8	1158	1165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017499	GGAA	2	8	1239	1246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017499	TAAT	2	8	2543	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017499	CACT	2	8	2696	2703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017499	TAAT	2	8	5349	5356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017499	AGGT	2	8	5483	5490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017499	AAAT	2	8	6349	6356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017499	ATTT	2	8	6912	6919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017499	AACA	2	8	7101	7108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017499	ATTT	2	8	7212	7219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017499	TTTA	2	8	13362	13369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017499	ATTT	2	8	14152	14159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017499	AAAT	2	8	14300	14307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017499	AATT	2	8	14340	14347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017499	ATGT	2	8	15608	15615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017499	TTTA	2	8	17353	17360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017499	AGTA	2	8	17377	17384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017499	TTTA	2	8	17431	17438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017499	TAAC	2	8	17555	17562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017499	ATGC	2	8	20480	20487	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017499	AGAA	2	8	21932	21939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017499	AACA	2	8	22999	23006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017499	TGGT	2	8	23077	23084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017499	AAAG	2	8	24914	24921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017499	AGGT	2	8	26187	26194	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017499	ATAG	2	8	27358	27365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017499	AATT	2	8	27422	27429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017499	GAAA	2	8	42017	42024	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017499	TAGC	2	8	42149	42156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017499	TAAA	2	8	42172	42179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017499	AATA	2	8	52017	52024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017499	TTAT	2	8	52185	52192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017499	TAAA	2	8	52274	52281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017499	ATAA	2	8	52352	52359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017499	TAAC	2	8	53419	53426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017499	GAAA	2	8	55637	55644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017499	AATA	2	8	56857	56864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017499	TTTA	2	8	57052	57059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017499	ATTA	2	8	57091	57098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017499	GTGG	2	8	57204	57211	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017499	ATAA	2	8	62033	62040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017499	TGAT	2	8	62476	62483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017499	TAAA	2	8	62888	62895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017499	AATT	2	8	62966	62973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017499	GAGT	2	8	65775	65782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017499	AAAG	2	8	65891	65898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017499	AAAC	2	8	65906	65913	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017499	AAGA	2	8	65959	65966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017499	AAGA	2	8	65974	65981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017499	TTCA	2	8	67474	67481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017499	TAAA	2	8	68009	68016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017499	TCAA	2	8	68226	68233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017499	TAAA	2	8	69163	69170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017499	GTCA	2	8	69396	69403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017499	ATTA	2	8	69404	69411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017499	TATT	2	8	69434	69441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017499	AAGT	2	8	71935	71942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017499	ATAA	2	8	74663	74670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017499	AATC	2	8	74781	74788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017499	ATTA	2	8	83952	83959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017499	ATAA	2	8	84012	84019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017499	TTTA	2	8	84304	84311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017499	TAAA	2	8	85468	85475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017499	GTTA	2	8	85492	85499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017499	TATT	2	8	85579	85586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017499	TGTC	2	8	85670	85677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017499	TCTT	2	8	85685	85692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017499	TTCA	2	8	85710	85717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017499	TAAT	2	8	90109	90116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017499	TAGA	2	8	91650	91657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017499	ATAA	2	8	91697	91704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017499	TGCT	2	8	93959	93966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017499	CTTT	2	8	96671	96678	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017499	TGTA	2	8	99648	99655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017499	TCTT	2	8	105132	105139	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017499	AATG	2	8	108028	108035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017499	CATA	2	8	110340	110347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017499	GATA	2	8	118763	118770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017499	GTTT	2	8	118837	118844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017499	TAAA	2	8	125962	125969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017499	TTAT	2	8	125980	125987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017499	CTAG	2	8	126059	126066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017499	ACAA	2	8	126210	126217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017499	TCAG	2	8	127399	127406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017499	TAAA	2	8	127872	127879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017499	ATCA	2	8	128754	128761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017499	GATT	2	8	129160	129167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017499	TTAA	2	8	129200	129207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017499	GCTT	2	8	131107	131114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017499	TTAA	2	8	132969	132976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017499	AAAT	2	8	133024	133031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017499	TATT	2	8	133266	133273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017499	TTCT	2	8	133281	133288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017499	CTTT	2	8	133360	133367	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017499	AAGA	2	8	135081	135088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017499	CTGT	2	8	135469	135476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017499	TCTT	2	8	135499	135506	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017499	CTAT	2	8	135566	135573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017499	TTAT	2	8	136572	136579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017499	TTAT	2	8	136887	136894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017499	TTAC	2	8	136902	136909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017499	ATTT	2	8	137901	137908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017499	ATAA	2	8	137986	137993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017499	TCTT	2	8	140500	140507	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017499	TAAA	2	8	140619	140626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017499	GCTT	2	8	140748	140755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017499	TCAT	2	8	140865	140872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017499	ACTA	2	8	141865	141872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017499	ATTT	2	8	141936	141943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017499	TTTG	2	8	142423	142430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017499	TCTT	2	8	142555	142562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017499	ATCA	2	8	142619	142626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017499	AAAG	2	8	142807	142814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017499	ACCA	2	8	143154	143161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017499	TTGT	2	8	143191	143198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017499	TTTG	2	8	145380	145387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017499	ATTA	2	8	145417	145424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017499	TTTG	2	8	146993	147000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017499	CTTA	2	8	147298	147305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017499	AGCT	2	8	150082	150089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017499	GACA	2	8	150375	150382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017499	TATG	2	8	150456	150463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017499	CTTA	2	8	150794	150801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017499	ATTA	2	8	151009	151016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017499	ATTA	2	8	151096	151103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017499	AGAT	2	8	151270	151277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017499	TAAT	2	8	151651	151658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017499	TAAA	2	8	151724	151731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017499	TTTA	2	8	151811	151818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017499	TATT	2	8	152114	152121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017499	CAAA	2	8	152156	152163	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017499	TCAA	2	8	152203	152210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017499	TTTA	2	8	152222	152229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017499	TAAT	2	8	152302	152309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017499	ATTC	2	8	152438	152445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017499	ATTT	2	8	153786	153793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017499	AATT	2	8	153932	153939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017499	TTTC	2	8	154534	154541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017499	CTCC	2	8	154576	154583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_017499	ATTT	2	8	154670	154677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017499	TTAT	2	8	157575	157582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017499	TAAA	2	8	158023	158030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017499	ACTT	2	8	158064	158071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017499	TGAA	2	8	159467	159474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017499	ATAA	2	8	159527	159534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017499	TAAT	2	8	159632	159639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017499	TCTA	2	8	159868	159875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017499	AGAA	2	8	166803	166810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017499	TAGG	2	8	167597	167604	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017499	ATTT	2	8	167801	167808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.