MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 1353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	GCAA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017491	TTTA	2	8	3208	3215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017491	TAAT	2	8	3613	3620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017491	AAAT	2	8	10029	10036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017491	GAAA	2	8	10291	10298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017491	CTAA	2	8	17213	17220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017491	TTTA	2	8	17828	17835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017491	ATTT	2	8	18468	18475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017491	ATAC	2	8	19257	19264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017491	AGTG	2	8	19359	19366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017491	ATTC	2	8	19390	19397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017491	TTTC	2	8	21207	21214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017491	GGGC	2	8	21553	21560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017491	TGCG	2	8	21595	21602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017491	TTTG	2	8	21816	21823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017491	TTAT	2	8	24256	24263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017491	GGGT	2	8	24320	24327	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017491	TTAA	3	12	25598	25609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017491	TTGC	2	8	31116	31123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017491	CAAA	2	8	32879	32886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017491	GTAT	2	8	33973	33980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017491	AGAA	2	8	35718	35725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017491	GTTT	2	8	36618	36625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017491	AAGT	2	8	37426	37433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017491	CCGG	2	8	37460	37467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017491	ATGA	2	8	38379	38386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017491	TCTA	2	8	38422	38429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017491	CCTT	2	8	38695	38702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017491	TAGT	2	8	38717	38724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017491	TATT	2	8	38793	38800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017491	ATTT	2	8	39382	39389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017491	CTTT	2	8	43173	43180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017491	CAAA	2	8	43236	43243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017491	TGCG	2	8	45261	45268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017491	AAAG	2	8	45530	45537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017491	TAAA	2	8	50126	50133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017491	TAAG	2	8	59412	59419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017491	AAAT	2	8	59429	59436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017491	CAGT	2	8	59570	59577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017491	GAAG	2	8	59786	59793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017491	AAGG	2	8	60549	60556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017491	CGTG	2	8	64897	64904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017491	AGAA	2	8	64949	64956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017491	TGAA	2	8	67044	67051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017491	ATAC	2	8	67084	67091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017491	ATTG	2	8	69168	69175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017491	AAAC	2	8	69330	69337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017491	TTCA	2	8	73800	73807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017491	TAAT	2	8	73856	73863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017491	TAAA	2	8	77356	77363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017491	CAGT	2	8	77920	77927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017491	TGAT	2	8	77942	77949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017491	TTTG	2	8	81645	81652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017491	TTGA	2	8	81778	81785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017491	GGGA	2	8	81842	81849	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017491	CGAT	2	8	84886	84893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017491	CTGT	2	8	84906	84913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017491	AAAT	2	8	87126	87133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017491	AGGT	2	8	88675	88682	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017491	TCAG	2	8	92809	92816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017491	CTTG	2	8	93174	93181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017491	GCCG	2	8	93525	93532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017491	TTTA	2	8	95040	95047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017491	TGAT	2	8	100407	100414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017491	CAAA	2	8	106961	106968	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017491	ATTT	2	8	107168	107175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017491	GTAA	2	8	108665	108672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017491	ATCA	2	8	111428	111435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017491	CAAA	2	8	114728	114735	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017491	ATTT	2	8	114802	114809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017491	ATTG	2	8	119232	119239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017491	CCTG	2	8	119778	119785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017491	GCAA	2	8	122853	122860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017491	GATT	2	8	124240	124247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017491	CAAG	2	8	125160	125167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017491	TAGC	2	8	128070	128077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017491	AGCC	2	8	130951	130958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017491	AGCC	2	8	131073	131080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017491	ATAA	2	8	132768	132775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017491	CTTT	2	8	137018	137025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017491	ATAA	2	8	145531	145538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017491	TTCG	2	8	145540	145547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017491	ATTA	2	8	145668	145675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017491	TTAA	2	8	146974	146981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017491	CGAA	2	8	150052	150059	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017491	GAAT	2	8	154684	154691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017491	ATCC	2	8	157829	157836	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017491	GATG	2	8	157926	157933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017491	AAAT	2	8	158746	158753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017491	CAAA	2	8	159064	159071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017491	CCAC	2	8	159099	159106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_017491	CACC	2	8	159174	159181	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_017491	TCCC	2	8	160188	160195	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_017491	CTTT	2	8	161404	161411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017491	CAAA	2	8	163956	163963	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017491	ATTC	2	8	170449	170456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017491	GAAT	2	8	170573	170580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017491	GAAT	2	8	170589	170596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017491	ACGA	2	8	174879	174886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017491	GTGA	2	8	174889	174896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017491	TAGA	2	8	178493	178500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017491	TTAC	2	8	178529	178536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017491	GGGC	2	8	178551	178558	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017491	AGTA	2	8	180022	180029	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017491	TTTG	2	8	180612	180619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017491	TTAA	2	8	181469	181476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017491	GTTT	2	8	181571	181578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017491	TTTA	2	8	187929	187936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017491	TAAT	2	8	192644	192651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017491	TTTA	2	8	198425	198432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017491	AAGC	2	8	202083	202090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017491	TTAT	2	8	204291	204298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017491	AAAG	2	8	204386	204393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017491	ATAA	2	8	204422	204429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017491	ATTA	2	8	209566	209573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017491	TAAA	2	8	209635	209642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017491	AAAT	2	8	209690	209697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017491	ATTT	2	8	209698	209705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017491	CTTT	2	8	213977	213984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017491	TTAA	2	8	222705	222712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017491	AAAG	2	8	226596	226603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017491	ACTG	2	8	227446	227453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017491	CGCT	2	8	232902	232909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017491	TTTG	2	8	232972	232979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017491	TGAT	2	8	233773	233780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017491	TGTT	2	8	234760	234767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017491	TTTC	2	8	240469	240476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017491	AGCC	2	8	246648	246655	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017491	GTGC	2	8	250948	250955	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017491	ATTT	2	8	252032	252039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017491	ATTT	2	8	253696	253703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017491	TACA	2	8	266927	266934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017491	AAGA	2	8	266949	266956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017491	GATT	2	8	267057	267064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017491	CGCA	2	8	267096	267103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017491	TTGG	2	8	269953	269960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017491	AGTT	2	8	280614	280621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017491	GATG	2	8	281997	282004	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017491	AGAC	2	8	282153	282160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017491	CATG	2	8	286819	286826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017491	CTAG	2	8	286977	286984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017491	GTCA	2	8	289716	289723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017491	TGGA	2	8	290200	290207	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017491	GTGA	2	8	290379	290386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017491	AGCG	2	8	290549	290556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017491	ATGG	2	8	291214	291221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017491	GAGC	2	8	291433	291440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017491	TAAG	2	8	291829	291836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017491	AGAA	2	8	291959	291966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017491	GCGA	2	8	291988	291995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017491	GCTT	2	8	292020	292027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017491	GTAG	2	8	292439	292446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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