MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017491	CTA	2	6	1324845	1324850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017491	AAAC	2	8	1324852	1324859	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_017491	AAAG	2	8	1324866	1324873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017491	TGCTA	2	10	1326303	1326312	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4005	NC_017491	ATG	2	6	1326327	1326332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017491	TTC	2	6	1326351	1326356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017491	CAA	2	6	1326718	1326723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017491	TCA	2	6	1326799	1326804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017491	ATT	2	6	1326863	1326868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017491	CGGTCT	2	12	1328154	1328165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017491	ATTTT	2	10	1329091	1329100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017491	GT	3	6	1330346	1330351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017491	CAA	2	6	1330375	1330380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017491	CAT	2	6	1330381	1330386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017491	GC	3	6	1330413	1330418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_017491	TTG	2	6	1330435	1330440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017491	ATT	2	6	1330946	1330951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017491	TCA	2	6	1330952	1330957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017491	CTT	2	6	1331034	1331039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017491	GAC	2	6	1331069	1331074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017491	GAGCA	2	10	1332991	1333000	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4022	NC_017491	AGA	2	6	1333961	1333966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017491	AGG	2	6	1334058	1334063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017491	TGG	2	6	1334585	1334590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017491	A	6	6	1334639	1334644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017491	TC	3	6	1334648	1334653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_017491	AGA	2	6	1334658	1334663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017491	T	6	6	1334669	1334674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017491	ATT	2	6	1334692	1334697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017491	CCT	2	6	1335346	1335351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_017491	TGGG	2	8	1335367	1335374	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017491	GCT	2	6	1335430	1335435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_017491	TTA	2	6	1335442	1335447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017491	TACAA	2	10	1335469	1335478	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4035	NC_017491	AGT	2	6	1335525	1335530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017491	TAA	2	6	1335537	1335542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017491	AAAT	2	8	1336429	1336436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017491	CCGG	2	8	1336441	1336448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_017491	T	7	7	1336462	1336468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017491	GCT	2	6	1336567	1336572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017491	AGC	2	6	1336604	1336609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017491	ATA	2	6	1336642	1336647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017491	TAT	2	6	1336648	1336653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017491	AGAA	2	8	1338183	1338190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017491	ACA	2	6	1338197	1338202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017491	ATCAAT	2	12	1340387	1340398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4047	NC_017491	GC	4	8	1340399	1340406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_017491	T	6	6	1340430	1340435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017491	CAT	2	6	1340496	1340501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017491	ACCA	2	8	1346361	1346368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_017491	T	6	6	1346373	1346378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017491	GGT	2	6	1346408	1346413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017491	GTT	2	6	1346439	1346444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017491	GAG	2	6	1346518	1346523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017491	AGG	2	6	1348890	1348895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017491	TAG	2	6	1349743	1349748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017491	TTTGA	2	10	1349760	1349769	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017491	GCTT	2	8	1349924	1349931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_017491	CTG	2	6	1352081	1352086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017491	T	7	7	1352087	1352093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017491	TCAA	2	8	1352180	1352187	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_017491	TAA	2	6	1352190	1352195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017491	AGG	2	6	1352204	1352209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017491	T	6	6	1353567	1353572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017491	GTC	2	6	1353584	1353589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017491	AAT	2	6	1353615	1353620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017491	T	7	7	1353636	1353642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017491	CAA	2	6	1353689	1353694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_017491	ACG	2	6	1354656	1354661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017491	T	6	6	1354664	1354669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017491	AAC	2	6	1354693	1354698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017491	TGAT	2	8	1354710	1354717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017491	A	6	6	1354736	1354741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017491	GT	4	8	1355280	1355287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017491	CGTT	2	8	1355301	1355308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_017491	GCTCAC	2	12	1355587	1355598	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_017491	AGG	2	6	1355607	1355612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017491	GAA	2	6	1357037	1357042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017491	TTG	2	6	1357973	1357978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017491	CTC	2	6	1358671	1358676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_017491	ATA	2	6	1358730	1358735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017491	AC	3	6	1358739	1358744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_017491	GTG	2	6	1358870	1358875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017491	GTT	2	6	1358890	1358895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017491	A	6	6	1363378	1363383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017491	TAT	2	6	1363423	1363428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017491	T	7	7	1363473	1363479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017491	A	6	6	1363501	1363506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017491	AGG	2	6	1363605	1363610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017491	ATT	2	6	1363650	1363655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017491	CGG	2	6	1363669	1363674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017491	AAG	2	6	1363683	1363688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017491	ATG	2	6	1363731	1363736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017491	AAT	2	6	1363784	1363789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017491	GGC	2	6	1363826	1363831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017491	TGGTCG	2	12	1364140	1364151	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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4098	NC_017491	GAA	2	6	1364273	1364278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017491	GAA	2	6	1364311	1364316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017491	GCT	2	6	1364354	1364359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017491	AAG	2	6	1364367	1364372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017491	TGTC	2	8	1364433	1364440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_017491	TGAT	2	8	1364457	1364464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017491	TGAA	2	8	1364499	1364506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017491	CGATC	2	10	1364599	1364608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4106	NC_017491	ATG	2	6	1364640	1364645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017491	TCA	2	6	1364650	1364655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_017491	ACA	2	6	1364694	1364699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017491	TTG	2	6	1364729	1364734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017491	TCCA	2	8	1364783	1364790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_017491	GAT	2	6	1364816	1364821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017491	TTGC	2	8	1364859	1364866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_017491	GGT	2	6	1364954	1364959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017491	GAA	2	6	1365040	1365045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017491	GAT	2	6	1365055	1365060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017491	CATG	2	8	1365109	1365116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_017491	TAC	2	6	1365122	1365127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017491	TTG	2	6	1365282	1365287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017491	ATG	2	6	1365294	1365299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017491	ATG	2	6	1365321	1365326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017491	ACA	2	6	1365336	1365341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017491	TGGT	2	8	1365350	1365357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017491	ACA	2	6	1365369	1365374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017491	CAT	2	6	1365386	1365391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017491	ACA	2	6	1365467	1365472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017491	TTGA	2	8	1365743	1365750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017491	AGA	2	6	1365766	1365771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017491	CTT	2	6	1365862	1365867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017491	CGA	2	6	1365868	1365873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_017491	TGAAA	2	10	1365965	1365974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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