MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017491	TGC	2	6	321534	321539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017491	AAC	2	6	321550	321555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017491	ATG	2	6	321576	321581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017491	CAT	2	6	321605	321610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017491	ATG	2	6	321647	321652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017491	TGA	2	6	322365	322370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017491	A	6	6	322408	322413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017491	TGAA	2	8	322475	322482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017491	AAGC	2	8	322490	322497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_017491	A	6	6	326481	326486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017491	GC	3	6	326566	326571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_017491	TGT	2	6	326604	326609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017491	ATG	2	6	326696	326701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017491	ACAG	2	8	327829	327836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_017491	A	7	7	327853	327859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017491	TAA	2	6	327861	327866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017491	ATT	2	6	327890	327895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017491	GGT	2	6	327918	327923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017491	GCG	2	6	327948	327953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017491	GCC	2	6	328009	328014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017491	TGGT	2	8	328073	328080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017491	ATT	2	6	328824	328829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017491	TG	3	6	331289	331294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017491	AGG	2	6	331376	331381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017491	GCTCAC	2	12	333208	333219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017491	GCTCAC	2	12	333330	333341	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_017491	AGG	2	6	333351	333356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017491	T	6	6	336149	336154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017491	ATC	2	6	336240	336245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017491	GCT	2	6	336246	336251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017491	TTGA	2	8	336281	336288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017491	T	6	6	336318	336323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017491	GGCG	2	8	339640	339647	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_017491	AATC	2	8	340937	340944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_017491	A	7	7	340976	340982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017491	GT	3	6	341003	341008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017491	T	6	6	341028	341033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017491	T	6	6	343404	343409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017491	CTC	2	6	344769	344774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_017491	AT	3	6	345148	345153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017491	TTA	2	6	345154	345159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017491	CTT	2	6	345529	345534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017491	GTGG	2	8	345546	345553	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017491	T	6	6	345563	345568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017491	GTG	2	6	345588	345593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017491	GAC	2	6	348646	348651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017491	A	6	6	348716	348721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017491	AG	3	6	348767	348772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017491	GCA	2	6	348789	348794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017491	CCA	2	6	348803	348808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_017491	TGA	2	6	350089	350094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017491	AATATT	2	12	350099	350110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017491	ATT	2	6	350166	350171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017491	A	7	7	351831	351837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017491	CATT	2	8	351891	351898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_017491	ACT	2	6	352584	352589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017491	T	6	6	352606	352611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017491	A	6	6	352630	352635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017491	TGA	2	6	352843	352848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017491	CGT	2	6	353125	353130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1062	NC_017491	TGCT	2	8	353151	353158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017491	GAC	2	6	353196	353201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017491	A	6	6	353203	353208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017491	TTCC	2	8	353296	353303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_017491	CGG	2	6	353312	353317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017491	CGT	2	6	353383	353388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017491	TTGC	2	8	353408	353415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017491	GAT	2	6	353475	353480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_017491	TCT	2	6	355371	355376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017491	GAT	2	6	355397	355402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017491	GAT	2	6	355557	355562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017491	TAT	2	6	355654	355659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017491	ATT	2	6	355676	355681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017491	AAT	2	6	355698	355703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017491	ATG	2	6	355829	355834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_017491	ACAA	2	8	356648	356655	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_017491	ATA	2	6	357504	357509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017491	CA	3	6	357683	357688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_017491	GTCT	2	8	357728	357735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_017491	GAA	2	6	357743	357748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_017491	AGG	2	6	361654	361659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_017491	AAC	2	6	364086	364091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017491	AGCGC	2	10	364115	364124	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1096	NC_017491	TGATT	2	10	366136	366145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_017491	AGG	2	6	370410	370415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017491	ATGCT	2	10	371390	371399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_017491	CG	3	6	371413	371418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_017491	A	6	6	371430	371435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017491	GAA	2	6	372438	372443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017491	T	6	6	372833	372838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017491	TCA	2	6	372868	372873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017491	TAG	2	6	372910	372915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1110	NC_017491	CTT	2	6	373763	373768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017491	TTTG	2	8	373788	373795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_017491	GTA	2	6	374151	374156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017491	AGTA	2	8	374165	374172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017491	TA	4	8	374196	374203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017491	A	6	6	374217	374222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017491	AC	3	6	374283	374288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_017491	CCA	2	6	374354	374359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_017491	TTG	2	6	374381	374386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017491	A	6	6	374420	374425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017491	TGGA	2	8	374437	374444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017491	GA	3	6	374554	374559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017491	A	6	6	374704	374709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017491	ATT	2	6	374984	374989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017491	CAA	2	6	375005	375010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017491	ATT	2	6	375095	375100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017491	AG	3	6	375125	375130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017491	ATT	2	6	375192	375197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017491	A	6	6	375239	375244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017491	ATG	2	6	375256	375261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017491	TAT	2	6	375293	375298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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