MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017491	GCAAG	2	10	158638	158647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
502	NC_017491	GC	3	6	158661	158666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_017491	A	6	6	158737	158742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017491	AAAT	2	8	158746	158753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017491	ATC	2	6	158811	158816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017491	T	7	7	158925	158931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017491	CAAA	2	8	159064	159071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_017491	CCAC	2	8	159099	159106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
509	NC_017491	A	6	6	159121	159126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017491	CACC	2	8	159174	159181	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
511	NC_017491	TCCC	2	8	160188	160195	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
512	NC_017491	CTTT	2	8	161404	161411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_017491	T	6	6	161449	161454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017491	CAT	2	6	161869	161874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017491	CA	3	6	161922	161927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_017491	TAT	2	6	163097	163102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017491	CAT	2	6	163266	163271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017491	AGA	2	6	163659	163664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017491	ATA	2	6	163701	163706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017491	GCC	2	6	163707	163712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017491	GTT	2	6	163760	163765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017491	TAA	2	6	163775	163780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017491	TGT	2	6	163832	163837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017491	A	7	7	163839	163845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017491	TTG	2	6	163873	163878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017491	CAAA	2	8	163956	163963	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_017491	ATT	2	6	166819	166824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017491	TC	3	6	168590	168595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017491	GTT	2	6	168643	168648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017491	ATA	2	6	168739	168744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017491	T	6	6	168745	168750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017491	T	6	6	168763	168768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017491	CAG	2	6	169280	169285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017491	TGA	2	6	169344	169349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017491	T	7	7	170432	170438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017491	ATTC	2	8	170449	170456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017491	ACA	2	6	170537	170542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017491	GAAT	2	8	170573	170580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017491	GAAT	2	8	170589	170596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017491	CG	3	6	170608	170613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_017491	T	6	6	170661	170666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017491	GAG	2	6	171837	171842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017491	GAT	2	6	173237	173242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017491	AGG	2	6	173248	173253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017491	A	6	6	173254	173259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017491	AAG	2	6	174742	174747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017491	T	6	6	174774	174779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017491	CTA	2	6	174818	174823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017491	ACGA	2	8	174879	174886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_017491	GTGA	2	8	174889	174896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017491	T	6	6	175657	175662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017491	TTC	2	6	176984	176989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017491	TAGA	2	8	178493	178500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017491	AAG	2	6	178508	178513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017491	TTAC	2	8	178529	178536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_017491	GGGC	2	8	178551	178558	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
557	NC_017491	CTT	2	6	178567	178572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017491	T	6	6	178571	178576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017491	GTA	2	6	178590	178595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017491	GCA	4	12	178986	178997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017491	CAA	2	6	178999	179004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017491	CAG	2	6	179005	179010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017491	AGTA	2	8	180022	180029	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017491	TTTG	2	8	180612	180619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017491	ATG	2	6	181249	181254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017491	AAGTC	2	10	181453	181462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
567	NC_017491	TTAA	2	8	181469	181476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017491	A	6	6	181475	181480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017491	ATA	2	6	181537	181542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017491	GTTT	2	8	181571	181578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017491	T	7	7	181595	181601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017491	T	7	7	181603	181609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017491	ACA	2	6	181635	181640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017491	TA	3	6	181654	181659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017491	T	7	7	181700	181706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017491	GGT	2	6	183677	183682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017491	TGA	2	6	184834	184839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_017491	T	7	7	187828	187834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017491	GAA	2	6	187840	187845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017491	AAC	2	6	187902	187907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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584	NC_017491	TTTA	2	8	187929	187936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017491	TAA	2	6	187956	187961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017491	GGA	2	6	189033	189038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_017491	TAAGC	2	10	189417	189426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
589	NC_017491	TG	3	6	189448	189453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017491	CA	3	6	189503	189508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_017491	GTT	2	6	189563	189568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017491	ACA	2	6	189572	189577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017491	AAT	2	6	189616	189621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_017491	TCA	2	6	191165	191170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017491	GC	3	6	191271	191276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_017491	GCTCAC	2	12	191279	191290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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602	NC_017491	CTC	2	6	192559	192564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_017491	A	7	7	192566	192572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017491	T	6	6	192609	192614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017491	TTG	2	6	192621	192626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017491	TAAT	2	8	192644	192651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017491	CTT	2	6	193418	193423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017491	CAT	2	6	193434	193439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017491	A	7	7	193467	193473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017491	GTC	2	6	193493	193498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017491	TAC	2	6	193528	193533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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614	NC_017491	AGG	2	6	196050	196055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017491	T	7	7	196057	196063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017491	AT	3	6	197428	197433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_017491	GTC	2	6	198395	198400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017491	T	6	6	198404	198409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017491	TTTA	2	8	198425	198432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017491	TAA	2	6	198505	198510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017491	GCC	2	6	199253	199258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_017491	GCT	2	6	201444	201449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017491	CTT	2	6	201471	201476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017491	AAGC	2	8	202083	202090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_017491	ATC	2	6	202938	202943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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629	NC_017491	GAT	2	6	204156	204161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_017491	T	6	6	204222	204227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017491	ATT	2	6	204274	204279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017491	TTAT	2	8	204291	204298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017491	AAT	3	9	204351	204359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017491	ATA	2	6	204360	204365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017491	AAAG	2	8	204386	204393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017491	TCA	2	6	204401	204406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017491	ATAA	2	8	204422	204429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_017491	TA	3	6	204866	204871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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