MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6005	NC_017491	GTT	2	6	2044681	2044686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017491	CCT	2	6	2046952	2046957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_017491	ATGA	2	8	2047003	2047010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017491	A	7	7	2047636	2047642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017491	TGT	2	6	2047643	2047648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6012	NC_017491	TTG	2	6	2047848	2047853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017491	AAG	2	6	2047990	2047995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6016	NC_017491	ATC	2	6	2048068	2048073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_017491	TG	3	6	2048138	2048143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017491	ATCA	2	8	2048176	2048183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6021	NC_017491	A	7	7	2053242	2053248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_017491	ACTTT	2	10	2099540	2099549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6133	NC_017491	ATT	2	6	2100068	2100073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_017491	TCA	2	6	2100102	2100107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_017491	CA	3	6	2100125	2100130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6136	NC_017491	A	6	6	2100165	2100170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_017491	GTC	2	6	2100235	2100240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6141	NC_017491	ACGC	2	8	2101147	2101154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6142	NC_017491	TGTC	2	8	2101467	2101474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6147	NC_017491	CCAT	2	8	2104926	2104933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6164	NC_017491	TCG	2	6	2114779	2114784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6166	NC_017491	TA	3	6	2117347	2117352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6251	NC_017491	ATG	2	6	2154094	2154099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6254	NC_017491	CAA	2	6	2154224	2154229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_017491	A	6	6	2154236	2154241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_017491	GCT	2	6	2154275	2154280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6259	NC_017491	ATTT	2	8	2160251	2160258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_017491	T	6	6	2160256	2160261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_017491	A	6	6	2160277	2160282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_017491	CTT	2	6	2160299	2160304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6263	NC_017491	ATTTC	2	10	2160310	2160319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6396	NC_017491	T	7	7	2198658	2198664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6397	NC_017491	TGG	2	6	2198675	2198680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6398	NC_017491	ATC	2	6	2199017	2199022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6399	NC_017491	AAC	2	6	2199031	2199036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6400	NC_017491	TAAGT	2	10	2199045	2199054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_017491	ATT	2	6	2200133	2200138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_017491	CTC	2	6	2200139	2200144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6403	NC_017491	GAT	2	6	2200154	2200159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6404	NC_017491	CCTC	2	8	2201415	2201422	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6405	NC_017491	GTGAGC	2	12	2202217	2202228	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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6407	NC_017491	TGAGC	2	10	2202340	2202349	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6411	NC_017491	CAA	2	6	2202715	2202720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6412	NC_017491	T	6	6	2203260	2203265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6413	NC_017491	TTCCG	2	10	2203336	2203345	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6414	NC_017491	GCA	2	6	2203346	2203351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6419	NC_017491	TTTTA	2	10	2203628	2203637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6423	NC_017491	A	7	7	2203791	2203797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6424	NC_017491	A	6	6	2204829	2204834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6425	NC_017491	TGA	2	6	2204846	2204851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6427	NC_017491	AT	3	6	2205702	2205707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6428	NC_017491	TCC	2	6	2208225	2208230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6429	NC_017491	CATTC	2	10	2208266	2208275	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6430	NC_017491	T	6	6	2208938	2208943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6431	NC_017491	ATC	2	6	2209071	2209076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6432	NC_017491	AGC	2	6	2209159	2209164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6434	NC_017491	TGG	2	6	2210154	2210159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6435	NC_017491	ATC	2	6	2210475	2210480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6436	NC_017491	AGCCA	2	10	2212253	2212262	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6437	NC_017491	ACA	2	6	2212282	2212287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6438	NC_017491	ACCT	2	8	2212350	2212357	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6439	NC_017491	TGC	2	6	2212361	2212366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6440	NC_017491	TTCC	2	8	2212367	2212374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6441	NC_017491	CAT	2	6	2212398	2212403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6451	NC_017491	AG	3	6	2217189	2217194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6452	NC_017491	CAG	2	6	2217366	2217371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6455	NC_017491	TGA	2	6	2217583	2217588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6458	NC_017491	AAATG	2	10	2219107	2219116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6467	NC_017491	TTA	2	6	2226864	2226869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6470	NC_017491	GATT	2	8	2227033	2227040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6471	NC_017491	TTC	2	6	2227973	2227978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6500	NC_017491	A	6	6	2233804	2233809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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