MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017491	TTC	2	6	1542343	1542348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_017491	CCT	2	6	1544688	1544693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_017491	TTCA	2	8	1544700	1544707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_017491	GCT	2	6	1544779	1544784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_017491	TTACT	2	10	1544802	1544811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4506	NC_017491	ATAG	2	8	1544826	1544833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017491	CAC	2	6	1544835	1544840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_017491	TGC	2	6	1549308	1549313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_017491	TCC	2	6	1553200	1553205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_017491	ATTT	2	8	1553212	1553219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017491	CCT	2	6	1553986	1553991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_017491	A	7	7	1554043	1554049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017491	TTA	2	6	1554290	1554295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017491	TTCA	2	8	1554328	1554335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4515	NC_017491	GTTG	2	8	1555645	1555652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017491	AAG	2	6	1555691	1555696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017491	ACTGTC	2	12	1555755	1555766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017491	TCC	2	6	1556888	1556893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_017491	A	6	6	1556902	1556907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017491	CTGC	2	8	1556909	1556916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_017491	TGTT	2	8	1557754	1557761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017491	GAC	2	6	1557786	1557791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_017491	TCAG	2	8	1557835	1557842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_017491	CA	3	6	1558975	1558980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_017491	TGG	2	6	1559011	1559016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017491	GGA	2	6	1559038	1559043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017491	GAAG	2	8	1559094	1559101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017491	AAAG	2	8	1559799	1559806	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_017491	AAAG	2	8	1561218	1561225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017491	AAAT	2	8	1565695	1565702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017491	TAA	2	6	1565729	1565734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017491	TCT	2	6	1565741	1565746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_017491	CGA	2	6	1565782	1565787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017491	A	6	6	1565789	1565794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017491	CCT	2	6	1566052	1566057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_017491	CCT	2	6	1566359	1566364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_017491	AATT	2	8	1566409	1566416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_017491	ATC	2	6	1566470	1566475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_017491	ATG	2	6	1566707	1566712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017491	G	7	7	1566821	1566827	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017491	A	9	9	1566966	1566974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017491	ATC	2	6	1567374	1567379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_017491	ATCG	2	8	1567482	1567489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_017491	TG	3	6	1568855	1568860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017491	TTTC	2	8	1568867	1568874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_017491	TAA	2	6	1569166	1569171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017491	CCT	2	6	1569462	1569467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_017491	ATAGC	2	10	1569486	1569495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4549	NC_017491	T	6	6	1569520	1569525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017491	CAT	2	6	1571706	1571711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_017491	TAT	2	6	1571716	1571721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017491	GAA	2	6	1571996	1572001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017491	A	6	6	1572337	1572342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017491	CCT	2	6	1577662	1577667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_017491	A	6	6	1577703	1577708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017491	CGT	2	6	1579567	1579572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_017491	T	6	6	1579655	1579660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017491	T	6	6	1579664	1579669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017491	A	8	8	1579674	1579681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017491	ATT	2	6	1579713	1579718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017491	CTC	2	6	1583613	1583618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_017491	AAT	2	6	1583663	1583668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017491	TAG	2	6	1583692	1583697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017491	GCC	2	6	1583869	1583874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_017491	ATGA	2	8	1583875	1583882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017491	CTC	2	6	1584144	1584149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_017491	CCT	2	6	1587288	1587293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4570	NC_017491	TCC	2	6	1589077	1589082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_017491	GAA	2	6	1589085	1589090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4573	NC_017491	GAA	2	6	1589564	1589569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017491	GC	3	6	1589580	1589585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_017491	TGC	2	6	1589619	1589624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4579	NC_017491	T	7	7	1589917	1589923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017491	AACT	2	8	1589950	1589957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4585	NC_017491	CGAT	2	8	1597351	1597358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4588	NC_017491	GTA	2	6	1601039	1601044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017491	TAT	2	6	1601049	1601054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4593	NC_017491	T	6	6	1601463	1601468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017491	CCG	2	6	1602183	1602188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4598	NC_017491	A	6	6	1603401	1603406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017491	A	6	6	1605655	1605660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017491	CATAG	2	10	1605670	1605679	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4601	NC_017491	CTC	2	6	1609820	1609825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_017491	GCT	2	6	1609835	1609840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_017491	GCA	2	6	1609842	1609847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_017491	TGT	2	6	1609857	1609862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017491	TCC	2	6	1610816	1610821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_017491	TCC	2	6	1611396	1611401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_017491	TAAAC	2	10	1611415	1611424	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4608	NC_017491	AGCA	2	8	1611432	1611439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_017491	CAC	2	6	1611495	1611500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_017491	ACC	2	6	1611540	1611545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_017491	A	7	7	1612767	1612773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017491	TCA	2	6	1612796	1612801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_017491	TG	3	6	1613789	1613794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017491	CCT	2	6	1613797	1613802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_017491	AGG	2	6	1613882	1613887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017491	TAC	2	6	1613910	1613915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_017491	GTAA	3	12	1613946	1613957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017491	ATCCA	2	10	1613987	1613996	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4619	NC_017491	CCT	2	6	1614287	1614292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_017491	CAA	2	6	1614322	1614327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_017491	TTG	2	6	1614357	1614362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017491	CCTGCC	2	12	1614392	1614403	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_017491	A	6	6	1614468	1614473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017491	TGCC	2	8	1614535	1614542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_017491	A	6	6	1614585	1614590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017491	TGA	2	6	1614598	1614603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4628	NC_017491	ATG	2	6	1614854	1614859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017491	CCGG	2	8	1614893	1614900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_017491	TTGAC	2	10	1614910	1614919	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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