MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	TCC	2	6	8	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017484	TGT	2	6	63	68	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017484	TCA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017484	TCA	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017484	ACT	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017484	AAT	2	6	107	112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017484	TGA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017484	AGG	2	6	217	222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017484	TAA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017484	TCT	2	6	906	911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017484	TAT	2	6	2917	2922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017484	GTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017484	ATT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017484	TGG	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017484	TCA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017484	CCT	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017484	CTA	2	6	11529	11534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017484	AAT	2	6	11573	11578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017484	TTG	2	6	11618	11623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017484	TGT	2	6	11632	11637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017484	TAT	2	6	11648	11653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017484	TCA	2	6	11859	11864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017484	GTT	2	6	11877	11882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017484	GTT	2	6	11894	11899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017484	TCT	2	6	11925	11930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017484	CTT	2	6	12082	12087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017484	TCA	2	6	12174	12179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017484	ATA	2	6	12180	12185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017484	TCT	2	6	12282	12287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017484	ATG	2	6	12314	12319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017484	TCA	3	9	12381	12389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017484	AAT	2	6	12536	12541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017484	TGT	2	6	12599	12604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017484	CTT	3	9	12706	12714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017484	TGT	2	6	12767	12772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017484	CTT	3	9	12874	12882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017484	TTC	2	6	13019	13024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017484	TTA	2	6	13049	13054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017484	ACA	2	6	14432	14437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017484	AGG	2	6	14457	14462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017484	AAT	2	6	17458	17463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017484	GAC	2	6	17514	17519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017484	AAC	2	6	17554	17559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017484	GCA	2	6	17777	17782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017484	CAA	2	6	17825	17830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017484	ATG	2	6	17837	17842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017484	TAG	2	6	17862	17867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017484	ATC	2	6	17894	17899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017484	TCA	2	6	17901	17906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017484	ACC	2	6	17951	17956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017484	GGT	2	6	17960	17965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017484	TTA	2	6	18108	18113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017484	AGT	2	6	18175	18180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017484	AAG	2	6	18182	18187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017484	ATC	2	6	18261	18266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017484	ATA	2	6	18319	18324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017484	TTG	2	6	18398	18403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017484	ATG	2	6	18427	18432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017484	AAT	2	6	18515	18520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017484	AGA	2	6	18638	18643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017484	TCC	2	6	20748	20753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017484	GAA	2	6	20834	20839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017484	CTA	2	6	20874	20879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017484	AAT	2	6	20893	20898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017484	AGG	2	6	20912	20917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017484	TCA	2	6	21739	21744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017484	TTC	2	6	23156	23161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017484	ATT	2	6	23175	23180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017484	TTA	3	9	23215	23223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017484	AAC	2	6	23294	23299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017484	TGC	2	6	23443	23448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017484	TAG	2	6	23494	23499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017484	TAA	2	6	23623	23628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017484	TCT	2	6	24042	24047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017484	TAA	2	6	24069	24074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017484	TAC	2	6	24075	24080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017484	AAT	2	6	25434	25439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017484	TTA	2	6	25449	25454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017484	TAG	2	6	25465	25470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017484	AGA	2	6	26087	26092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017484	CGT	2	6	26108	26113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017484	TGA	2	6	26332	26337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017484	CAG	2	6	26405	26410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017484	GTG	2	6	26430	26435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017484	TAA	2	6	26806	26811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017484	ATT	2	6	26831	26836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017484	TAT	2	6	26902	26907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017484	TTA	2	6	26985	26990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017484	TAA	2	6	26992	26997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017484	GAA	2	6	27028	27033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017484	TAA	2	6	27314	27319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017484	TAA	2	6	27323	27328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017484	AGA	2	6	27333	27338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017484	ATT	2	6	27383	27388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017484	TTG	2	6	27449	27454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017484	TTA	2	6	27712	27717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017484	TTG	2	6	27736	27741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017484	CAA	2	6	27771	27776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017484	TGA	2	6	27791	27796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017484	AGG	2	6	27802	27807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017484	CTT	2	6	28786	28791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017484	ATT	2	6	30999	31004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017484	AAT	2	6	31020	31025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017484	CTT	2	6	31067	31072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017484	CTT	2	6	31096	31101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017484	CAT	2	6	31129	31134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.