MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 1350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017482	TAAT	2	8	3078	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017482	AAAT	2	8	9494	9501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017482	GAAA	2	8	9756	9763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017482	GGTA	2	8	12881	12888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017482	CTAA	2	8	16778	16785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017482	GTTT	2	8	17002	17009	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017482	GCTA	2	8	17206	17213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017482	AAGA	2	8	18439	18446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017482	TTTA	2	8	18586	18593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017482	ATAC	2	8	20016	20023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017482	TAAT	2	8	22913	22920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017482	TGCT	2	8	23000	23007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017482	TTTA	2	8	23019	23026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017482	GGAA	2	8	26943	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017482	GGGC	2	8	27216	27223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017482	TGCG	2	8	27257	27264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017482	TTTG	2	8	27484	27491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017482	GGGT	2	8	29988	29995	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017482	TTAA	3	12	31266	31277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017482	ATTA	2	8	35491	35498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017482	TTGC	2	8	36785	36792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017482	GTTT	2	8	42292	42299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017482	AAGT	2	8	43100	43107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017482	TGGG	2	8	43559	43566	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017482	AGAA	2	8	43658	43665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017482	ATGA	2	8	44053	44060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017482	TCTA	2	8	44096	44103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017482	CCTT	2	8	44370	44377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017482	AGTC	2	8	44393	44400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017482	TATT	2	8	44470	44477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017482	ATTT	2	8	45059	45066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017482	AAGA	2	8	46800	46807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017482	AAAT	2	8	46823	46830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017482	CTTT	2	8	49658	49665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017482	TGCG	2	8	51746	51753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017482	TAAA	2	8	56610	56617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017482	GAAG	2	8	64695	64702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017482	AAGG	2	8	65458	65465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017482	CTTG	2	8	69043	69050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017482	CAGA	2	8	69321	69328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017482	CGTG	2	8	69813	69820	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017482	ATAA	2	8	70434	70441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017482	TGAA	2	8	71960	71967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017482	ATTG	2	8	74084	74091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017482	AAAC	2	8	74247	74254	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017482	TTCA	2	8	78717	78724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017482	TAAT	2	8	78773	78780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017482	TAAA	2	8	82274	82281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017482	CAGT	2	8	82838	82845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017482	TGAT	2	8	82860	82867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017482	TTTG	2	8	86563	86570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017482	AATA	2	8	87872	87879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017482	CGAT	2	8	91182	91189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017482	CTGT	2	8	91202	91209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017482	CTTC	2	8	92559	92566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017482	GCCT	2	8	93547	93554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017482	AAAT	2	8	94738	94745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017482	TAGG	2	8	96286	96293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017482	TTTA	2	8	102651	102658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017482	GTTT	2	8	107599	107606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017482	TGAT	2	8	108131	108138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017482	GCTT	2	8	111742	111749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017482	ATTT	2	8	112291	112298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017482	GTAA	2	8	112828	112835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017482	CAAA	2	8	118932	118939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017482	ATTG	2	8	123539	123546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017482	TAAC	2	8	124159	124166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017482	CCTG	2	8	124801	124808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017482	TAAT	2	8	127517	127524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017482	ACAA	2	8	132175	132182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017482	CTTT	2	8	136425	136432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017482	ATAA	2	8	144921	144928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017482	TTCG	2	8	144930	144937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017482	ATTA	2	8	145058	145065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017482	GAAT	2	8	150729	150736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017482	GCAA	2	8	150797	150804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017482	ATGT	2	8	154520	154527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017482	CTAG	2	8	154914	154921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017482	CTAA	2	8	155271	155278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017482	TACT	2	8	155339	155346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017482	TCAC	2	8	156902	156909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017482	GATG	2	8	156933	156940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017482	TTTG	2	8	158498	158505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017482	AAAC	2	8	159993	160000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017482	CCAC	2	8	160032	160039	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_017482	CACC	2	8	160107	160114	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_017482	TCCC	2	8	161121	161128	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_017482	AATT	2	8	162318	162325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017482	CTTT	2	8	162337	162344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017482	TGAT	2	8	162406	162413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017482	TGAA	2	8	162484	162491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017482	CAAA	2	8	164888	164895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017482	ATTC	2	8	172240	172247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017482	GAAT	2	8	172364	172371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017482	GAAT	2	8	172380	172387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017482	ACGA	2	8	176673	176680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017482	TTAC	2	8	180322	180329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017482	TAAG	2	8	180338	180345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017482	TAAA	2	8	180866	180873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017482	AATT	2	8	181091	181098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017482	AGTA	2	8	189902	189909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017482	TTTG	2	8	190493	190500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017482	TTAA	2	8	191350	191357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017482	GTTT	2	8	191452	191459	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017482	TTTA	2	8	197811	197818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017482	TAAT	2	8	202769	202776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017482	TTGC	2	8	211339	211346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017482	TAAA	2	8	216121	216128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017482	AAAT	2	8	216176	216183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017482	ATTT	2	8	216184	216191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017482	CTTT	2	8	220462	220469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017482	TTAA	2	8	223417	223424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017482	TCAG	2	8	224426	224433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017482	TGCT	2	8	228703	228710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017482	TTAA	2	8	232214	232221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017482	CAAT	2	8	234236	234243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017482	TTGG	2	8	234271	234278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017482	AAAG	2	8	236103	236110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017482	GATC	2	8	236945	236952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017482	CGCT	2	8	242407	242414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017482	TTTG	2	8	242479	242486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017482	TGAT	2	8	243280	243287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017482	TCCA	2	8	244184	244191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017482	TGTT	2	8	244360	244367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017482	TTTC	2	8	250068	250075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017482	GTGC	2	8	260799	260806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017482	ATTT	2	8	261882	261889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017482	ATTT	2	8	263546	263553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017482	GTTT	2	8	263844	263851	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017482	TACA	2	8	276702	276709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017482	AAGA	2	8	276724	276731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017482	ATTG	2	8	276833	276840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017482	CGCA	2	8	276871	276878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017482	GTTG	2	8	285821	285828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017482	TGTT	2	8	290581	290588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017482	AGTT	2	8	297325	297332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017482	ATCA	2	8	297440	297447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017482	GATG	2	8	298700	298707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017482	AGAC	2	8	298965	298972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017482	CTAG	2	8	303787	303794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017482	GTCA	2	8	306538	306545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017482	TGGA	2	8	307022	307029	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017482	GTGA	2	8	307201	307208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017482	AGCG	2	8	307371	307378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017482	ATGG	2	8	308036	308043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017482	GAGC	2	8	308255	308262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017482	TAAG	2	8	308651	308658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017482	AGAA	2	8	308781	308788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017482	GCGA	2	8	308810	308817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017482	GCTT	2	8	308842	308849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017482	GTAG	2	8	309261	309268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017482	ATGT	2	8	309344	309351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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