MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 8981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017482	CTT	2	6	154901	154906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017482	CTAG	2	8	154914	154921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_017482	ATA	2	6	154923	154928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017482	AAT	2	6	154970	154975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017482	TGG	2	6	155024	155029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017482	ATG	2	6	155137	155142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017482	CAT	2	6	155165	155170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017482	A	6	6	155207	155212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017482	CTAA	2	8	155271	155278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_017482	TAC	2	6	155281	155286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017482	TGGATA	2	12	155311	155322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017482	TACT	2	8	155339	155346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_017482	TTA	2	6	155476	155481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017482	GCA	2	6	155482	155487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017482	T	7	7	156669	156675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017482	ATA	2	6	156799	156804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017482	GTGTT	2	10	156852	156861	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017482	AGG	2	6	156896	156901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017482	TCAC	2	8	156902	156909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_017482	GATG	2	8	156933	156940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017482	TCC	2	6	158434	158439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_017482	TTTG	2	8	158498	158505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017482	TTA	2	6	158626	158631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017482	GAA	2	6	158643	158648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017482	ACA	2	6	159641	159646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017482	AAG	2	6	159658	159663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017482	CAA	2	6	159702	159707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017482	TAGAT	2	10	159813	159822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017482	GA	3	6	159891	159896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017482	AAAC	2	8	159993	160000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_017482	CCAC	2	8	160032	160039	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
532	NC_017482	A	6	6	160054	160059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017482	CACC	2	8	160107	160114	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
534	NC_017482	TCCC	2	8	161121	161128	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
535	NC_017482	AATT	2	8	162318	162325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017482	CTTT	2	8	162337	162344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017482	T	6	6	162382	162387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017482	TGAT	2	8	162406	162413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017482	TCT	2	6	162445	162450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017482	TGAA	2	8	162484	162491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017482	GGA	2	6	162535	162540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017482	CAT	2	6	162801	162806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017482	CA	3	6	162854	162859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017482	TAT	2	6	164029	164034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017482	CAT	2	6	164198	164203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017482	TAA	2	6	164251	164256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017482	AGA	2	6	164591	164596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017482	ATA	2	6	164633	164638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017482	GCC	2	6	164639	164644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017482	GTT	2	6	164692	164697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017482	TAA	2	6	164707	164712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017482	TGT	2	6	164764	164769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017482	A	7	7	164771	164777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017482	TTG	2	6	164805	164810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017482	CAAA	2	8	164888	164895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_017482	CTG	2	6	167079	167084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017482	GAG	2	6	167113	167118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017482	ATT	2	6	168611	168616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017482	TC	3	6	170382	170387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_017482	GTT	2	6	170435	170440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017482	ATA	2	6	170531	170536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017482	T	6	6	170537	170542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017482	T	6	6	170555	170560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017482	AGT	2	6	171073	171078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017482	TGA	2	6	171136	171141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017482	AGC	2	6	172195	172200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017482	T	6	6	172224	172229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017482	ATTC	2	8	172240	172247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_017482	ACA	2	6	172328	172333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017482	GAAT	2	8	172364	172371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017482	GAAT	2	8	172380	172387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017482	CG	3	6	172399	172404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017482	T	6	6	172452	172457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017482	GAG	2	6	173628	173633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017482	GAT	2	6	175028	175033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017482	AGG	2	6	175039	175044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_017482	A	6	6	176530	176535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017482	T	7	7	176550	176556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017482	T	6	6	176568	176573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017482	ACGA	2	8	176673	176680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_017482	TA	3	6	177455	177460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017482	TTC	2	6	178777	178782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017482	AAG	2	6	180301	180306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017482	TTAC	2	8	180322	180329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017482	TAAG	2	8	180338	180345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017482	GCT	2	6	180350	180355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017482	CTT	2	6	180360	180365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017482	T	6	6	180364	180369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017482	GTA	2	6	180383	180388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017482	GGA	2	6	180798	180803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017482	TAAA	2	8	180866	180873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017482	CTA	2	6	180882	180887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017482	AC	3	6	180905	180910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_017482	GGT	2	6	180988	180993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017482	GCT	2	6	181006	181011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017482	AATT	2	8	181091	181098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017482	CAAAC	2	10	181161	181170	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
599	NC_017482	TGT	2	6	181173	181178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017482	TGT	2	6	181221	181226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017482	CT	3	6	181293	181298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_017482	CAA	2	6	181329	181334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017482	ACA	2	6	181397	181402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017482	TAA	2	6	181543	181548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017482	GATAG	2	10	181587	181596	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017482	G	6	6	181671	181676	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017482	AGA	2	6	181718	181723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017482	TGA	2	6	181731	181736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017482	A	6	6	181756	181761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017482	T	6	6	181972	181977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017482	TCC	2	6	184572	184577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_017482	ACC	2	6	184611	184616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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614	NC_017482	TAT	2	6	187723	187728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017482	GAT	2	6	187799	187804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_017482	CTT	2	6	188848	188853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017482	GGA	2	6	188872	188877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017482	GTG	2	6	188890	188895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017482	CT	3	6	189885	189890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_017482	AGTA	2	8	189902	189909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017482	TTTG	2	8	190493	190500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017482	ATG	2	6	191130	191135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017482	AAGTC	2	10	191334	191343	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
626	NC_017482	TTAA	2	8	191350	191357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017482	A	6	6	191356	191361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017482	GTTT	2	8	191452	191459	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017482	T	7	7	191476	191482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017482	T	7	7	191484	191490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017482	ACA	2	6	191516	191521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017482	TA	3	6	191535	191540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017482	T	8	8	191581	191588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017482	GGT	2	6	193559	193564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017482	TGA	2	6	194716	194721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_017482	T	6	6	197711	197716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017482	GAA	2	6	197722	197727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017482	AAC	2	6	197784	197789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_017482	CTT	2	6	197805	197810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_017482	TTTA	2	8	197811	197818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017482	TAA	2	6	197838	197843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_017482	GGA	2	6	198915	198920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
644	NC_017482	TCC	2	6	199293	199298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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646	NC_017482	TG	3	6	199330	199335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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648	NC_017482	GTT	2	6	199445	199450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
649	NC_017482	ACA	2	6	199454	199459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_017482	AAT	2	6	199498	199503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_017482	GCT	2	6	200932	200937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_017482	CGG	2	6	201012	201017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_017482	GC	3	6	201031	201036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
655	NC_017482	GC	3	6	201153	201158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
656	NC_017482	TCA	2	6	201169	201174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_017482	GCTCAC	2	12	201283	201294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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661	NC_017482	TTG	2	6	202746	202751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
662	NC_017482	TAAT	2	8	202769	202776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_017482	CTT	2	6	203543	203548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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673	NC_017482	CCT	2	6	208504	208509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
674	NC_017482	GTC	2	6	208519	208524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
675	NC_017482	T	6	6	208527	208532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_017482	GGT	2	6	208539	208544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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682	NC_017482	AAC	2	6	211475	211480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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685	NC_017482	A	6	6	214197	214202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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689	NC_017482	TA	3	6	216011	216016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
690	NC_017482	TAA	2	6	216054	216059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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723	NC_017482	AGG	2	6	228983	228988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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742	NC_017482	A	6	6	235329	235334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_017482	TC	3	6	242460	242465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
763	NC_017482	TTTG	2	8	242479	242486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
764	NC_017482	T	7	7	243227	243233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
765	NC_017482	TGAT	2	8	243280	243287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
766	NC_017482	AAG	2	6	243304	243309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_017482	GTG	2	6	244054	244059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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774	NC_017482	CTT	2	6	244245	244250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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776	NC_017482	A	7	7	244384	244390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_017482	TGA	3	9	248977	248985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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781	NC_017482	TCT	2	6	249877	249882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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