MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN2

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017480	AGCT	2	8	461	468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017480	TTGC	2	8	528	535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017480	ATTC	2	8	2175	2182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017480	ATTA	2	8	2315	2322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017480	AGCA	2	8	2610	2617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017480	TCAT	2	8	2882	2889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017480	ATTA	2	8	5734	5741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017480	AAAT	2	8	5745	5752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017480	TCTT	2	8	5956	5963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017480	GAGT	2	8	7792	7799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017480	AAAT	2	8	7952	7959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017480	TTGA	2	8	8100	8107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017480	AATC	2	8	10555	10562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017480	GGTT	2	8	10634	10641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017480	CAAA	2	8	10675	10682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017480	ACGA	2	8	12787	12794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017480	ATAA	2	8	12920	12927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017480	AATA	2	8	14302	14309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017480	CATT	2	8	14400	14407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017480	CTTA	2	8	16179	16186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017480	GAAA	2	8	16662	16669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017480	ATGG	2	8	16761	16768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017480	TCAT	2	8	17666	17673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017480	TCAC	2	8	17836	17843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017480	AACA	2	8	18078	18085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017480	ACTA	2	8	18492	18499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017480	CAAT	2	8	18966	18973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017480	GAAC	2	8	19053	19060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.