MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017477	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017477	TGCT	2	8	11007	11014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017477	AAGC	2	8	11028	11035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017477	AGGA	2	8	11100	11107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017477	ATTA	2	8	14997	15004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017477	TAAT	2	8	21246	21253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017477	AGAT	2	8	22689	22696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017477	TTCA	2	8	23668	23675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017477	TAAA	2	8	31566	31573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017477	TTTG	2	8	31590	31597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017477	TATT	2	8	31659	31666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017477	TCAC	2	8	32030	32037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017477	TTCT	2	8	32038	32045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017477	CAAT	2	8	32258	32265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017477	AGTA	2	8	34582	34589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017477	TTTC	2	8	36477	36484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017477	TAAT	2	8	36718	36725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017477	ATAA	2	8	36861	36868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017477	GGTT	2	8	39253	39260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017477	CAAT	2	8	39682	39689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017477	GTAA	2	8	45064	45071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017477	AAGA	2	8	46616	46623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017477	TAAT	2	8	50003	50010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017477	AATC	2	8	50101	50108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017477	TAGC	2	8	50132	50139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017477	AATC	2	8	50142	50149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017477	TTAA	2	8	55648	55655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017477	TTAA	2	8	55823	55830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017477	CAAG	2	8	55999	56006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017477	AAGT	2	8	56264	56271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017477	TGGT	2	8	56298	56305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017477	TAAA	2	8	56637	56644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017477	CATG	2	8	56717	56724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017477	GTTG	2	8	56828	56835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017477	TAAT	2	8	56920	56927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017477	TTAG	2	8	57130	57137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017477	AATT	2	8	57217	57224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017477	ATTT	2	8	57411	57418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017477	ATTA	2	8	59729	59736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017477	ATTT	2	8	66519	66526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017477	TTAA	2	8	67115	67122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017477	GAAA	2	8	67258	67265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017477	CTTT	2	8	69824	69831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017477	TAAG	2	8	71754	71761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017477	AATA	2	8	76034	76041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017477	AAAT	2	8	76204	76211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017477	AAAT	2	8	82350	82357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017477	CTAA	2	8	85520	85527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017477	TTCT	2	8	86897	86904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017477	TAAG	2	8	86986	86993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017477	ATGT	2	8	87027	87034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017477	GATT	2	8	87087	87094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017477	GGTA	2	8	87154	87161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017477	ATTA	2	8	91590	91597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017477	TAAA	2	8	99133	99140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017477	TTTA	2	8	100548	100555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017477	CAGC	2	8	102555	102562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017477	CTTT	2	8	112784	112791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017477	AAAT	2	8	112909	112916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017477	GTAA	2	8	115438	115445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017477	GAAA	2	8	115579	115586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017477	ATTT	2	8	115679	115686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017477	CTTT	2	8	118096	118103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017477	TAAA	2	8	118167	118174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017477	GTTA	2	8	118177	118184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017477	AAAC	2	8	123814	123821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017477	ACGC	2	8	123928	123935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017477	AAGG	2	8	127117	127124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017477	TTAA	2	8	128207	128214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017477	ACAA	2	8	128299	128306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017477	AATT	2	8	128318	128325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017477	ATTA	2	8	129817	129824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017477	AAGG	2	8	130604	130611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017477	AAGT	2	8	131551	131558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017477	ATTA	2	8	131682	131689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017477	GAAG	2	8	135442	135449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017477	CGTA	2	8	137225	137232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017477	ACTA	2	8	138916	138923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017477	AATT	2	8	146896	146903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017477	ACAG	2	8	150980	150987	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017477	TAAT	2	8	155086	155093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017477	GATC	2	8	155697	155704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017477	GAAC	2	8	155786	155793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017477	TAAA	2	8	156974	156981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017477	TTAG	2	8	156984	156991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017477	TTTG	2	8	183225	183232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017477	ATTT	2	8	183258	183265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017477	AATA	2	8	187182	187189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017477	ATTA	2	8	187301	187308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017477	ATAA	2	8	189357	189364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017477	CTTA	2	8	191053	191060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017477	ATTA	2	8	191169	191176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017477	ATTT	2	8	191209	191216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017477	ATCA	2	8	191223	191230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017477	ATAA	2	8	191423	191430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017477	TGTT	2	8	191823	191830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017477	GGAG	2	8	191881	191888	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017477	TATC	2	8	202053	202060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017477	TAGT	2	8	202659	202666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017477	AGAA	2	8	203582	203589	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017477	AATT	2	8	204100	204107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017477	CTAT	2	8	204513	204520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017477	TTAA	2	8	204956	204963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017477	AGTA	2	8	204996	205003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017477	AAAG	2	8	205034	205041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017477	TGAT	2	8	205074	205081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017477	GTAA	2	8	208045	208052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017477	AATT	2	8	208860	208867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017477	GTGG	2	8	215890	215897	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017477	TGAA	2	8	220929	220936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017477	TGTC	2	8	227475	227482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017477	TCTA	2	8	227487	227494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017477	TAGA	2	8	230170	230177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017477	AGCA	2	8	230230	230237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017477	GTTA	2	8	230951	230958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017477	ATTT	2	8	233949	233956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017477	CTTT	2	8	236413	236420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017477	CAGC	2	8	238811	238818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017477	TGTT	2	8	238920	238927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017477	GATA	2	8	245529	245536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017477	TAAA	2	8	252753	252760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017477	ATTA	2	8	256861	256868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017477	TTTG	2	8	260468	260475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017477	AAAT	2	8	263536	263543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017477	TGAA	2	8	263603	263610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017477	AATT	2	8	269860	269867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017477	AATG	2	8	273035	273042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017477	AAAG	2	8	273128	273135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017477	ATTT	2	8	274829	274836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017477	TAAA	2	8	274956	274963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017477	ATTG	2	8	275884	275891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017477	ATAA	2	8	277156	277163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017477	AATT	2	8	277723	277730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017477	AATT	2	8	278128	278135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017477	ATTG	2	8	279908	279915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017477	CTTT	2	8	280477	280484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017477	AACG	2	8	281294	281301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017477	TAAG	2	8	281537	281544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017477	TTTG	2	8	281829	281836	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017477	AATA	2	8	283174	283181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017477	GAAG	2	8	283330	283337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017477	TAAG	2	8	287583	287590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017477	CTAT	2	8	293232	293239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017477	AATT	2	8	293242	293249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017477	TAAA	2	8	293264	293271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017477	TAAT	2	8	293284	293291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017477	TGCT	2	8	293313	293320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017477	AGTA	2	8	294914	294921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017477	TTAC	2	8	294958	294965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017477	TATT	2	8	295669	295676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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