MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 6491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017477	ACGTA	2	10	1084215	1084224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3502	NC_017477	T	6	6	1084228	1084233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017477	AT	3	6	1084315	1084320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017477	CTT	2	6	1084353	1084358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017477	TTAA	2	8	1084362	1084369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017477	T	6	6	1084391	1084396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017477	ATT	2	6	1084397	1084402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017477	A	7	7	1084433	1084439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017477	A	6	6	1084489	1084494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017477	TAC	2	6	1084501	1084506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_017477	CTA	2	6	1085055	1085060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_017477	GGTAT	2	10	1085078	1085087	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017477	TAC	2	6	1085090	1085095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_017477	CCT	2	6	1085117	1085122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_017477	ATA	2	6	1085142	1085147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017477	AGA	2	6	1085148	1085153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017477	AG	3	6	1085155	1085160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017477	T	6	6	1085730	1085735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017477	AAT	2	6	1085778	1085783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017477	AGG	2	6	1085786	1085791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017477	TAC	2	6	1085820	1085825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_017477	GAA	2	6	1085859	1085864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017477	AGC	2	6	1085871	1085876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3525	NC_017477	TTC	2	6	1085956	1085961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3529	NC_017477	TAA	2	6	1086156	1086161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017477	A	6	6	1086183	1086188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017477	TAT	2	6	1086692	1086697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017477	ATT	2	6	1086703	1086708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017477	AT	3	6	1086741	1086746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017477	ATA	2	6	1086757	1086762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017477	TCT	2	6	1086770	1086775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3539	NC_017477	TAT	2	6	1089430	1089435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3547	NC_017477	GCTT	2	8	1090820	1090827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_017477	TA	3	6	1090836	1090841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017477	ATT	2	6	1092114	1092119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017477	TAAAA	2	10	1092127	1092136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017477	ATA	2	6	1092152	1092157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017477	TAC	2	6	1092214	1092219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3554	NC_017477	AACT	2	8	1092233	1092240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_017477	CTTCT	2	10	1093229	1093238	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3558	NC_017477	A	6	6	1093316	1093321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017477	AAG	2	6	1093336	1093341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3561	NC_017477	ACT	2	6	1093383	1093388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3563	NC_017477	ATTA	2	8	1093436	1093443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017477	TTG	2	6	1093464	1093469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3571	NC_017477	TTTA	2	8	1094059	1094066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_017477	CT	3	6	1112140	1112145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_017477	T	6	6	1112204	1112209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017477	A	6	6	1112217	1112222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017477	CT	3	6	1112234	1112239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_017477	CTT	2	6	1112252	1112257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3607	NC_017477	CTTCA	2	10	1112722	1112731	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3610	NC_017477	TAT	2	6	1112869	1112874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017477	ATT	2	6	1112931	1112936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017477	ACTT	2	8	1112938	1112945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_017477	AAAC	2	8	1112952	1112959	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_017477	GCAA	2	8	1112965	1112972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_017477	ACT	2	6	1112984	1112989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3617	NC_017477	ATTA	2	8	1113060	1113067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017477	AAC	2	6	1113109	1113114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_017477	CT	3	6	1113133	1113138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_017477	ATT	2	6	1113145	1113150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017477	TATT	2	8	1113181	1113188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017477	T	6	6	1113187	1113192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017477	A	7	7	1113194	1113200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017477	CTG	2	6	1113204	1113209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3626	NC_017477	A	6	6	1114645	1114650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017477	TTGA	2	8	1114670	1114677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017477	ACC	2	6	1114696	1114701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_017477	TTTA	2	8	1114703	1114710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_017477	CTT	3	9	1114788	1114796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_017477	ACT	2	6	1114893	1114898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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