MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 6491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017477	GCC	2	6	278045	278050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_017477	AAT	2	6	278072	278077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017477	AATT	2	8	278128	278135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017477	T	6	6	278144	278149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017477	ATA	2	6	278153	278158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017477	ATTG	2	8	279908	279915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017477	A	6	6	279938	279943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017477	ATT	2	6	279996	280001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017477	T	6	6	280011	280016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017477	TA	3	6	280141	280146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017477	GCG	2	6	280151	280156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017477	T	6	6	280157	280162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017477	AAG	2	6	280202	280207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017477	AGC	2	6	280214	280219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017477	CTTTT	2	10	280241	280250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1016	NC_017477	ATA	2	6	280251	280256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017477	TTC	2	6	280259	280264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017477	TCTAAT	2	12	280268	280279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1019	NC_017477	TAA	2	6	280280	280285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017477	AAT	2	6	280399	280404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017477	TTTTG	2	10	280449	280458	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017477	CTTT	2	8	280477	280484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_017477	ACA	2	6	280572	280577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017477	TAA	2	6	280614	280619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017477	AGT	2	6	280622	280627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017477	TTA	2	6	280629	280634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017477	CTT	2	6	280695	280700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017477	TTA	2	6	280701	280706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017477	AAT	2	6	280800	280805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017477	ATA	2	6	280823	280828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017477	AAC	2	6	280934	280939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017477	TCA	2	6	280999	281004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017477	GAT	2	6	281024	281029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017477	CAT	2	6	281036	281041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017477	AGA	2	6	281049	281054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017477	AGC	2	6	281177	281182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017477	TTA	2	6	281185	281190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017477	AGATT	2	10	281194	281203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017477	GTT	2	6	281243	281248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017477	CAG	2	6	281282	281287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017477	AACG	2	8	281294	281301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_017477	AATTG	2	10	281512	281521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017477	GAA	2	6	281525	281530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017477	TAAG	2	8	281537	281544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017477	AG	3	6	281543	281548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017477	T	7	7	281561	281567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017477	A	7	7	281572	281578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017477	TCA	2	6	281605	281610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017477	T	6	6	281635	281640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017477	AT	3	6	281654	281659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017477	ACA	2	6	281688	281693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017477	GGA	2	6	281773	281778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017477	TTTG	2	8	281829	281836	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017477	A	6	6	281903	281908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017477	ATC	2	6	281927	281932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017477	ATT	2	6	281962	281967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017477	GGA	2	6	282010	282015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017477	AATA	2	8	283174	283181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017477	AT	4	8	283185	283192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017477	T	7	7	283225	283231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017477	TTA	2	6	283272	283277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017477	GAAG	2	8	283330	283337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017477	AAG	2	6	285062	285067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017477	G	6	6	286460	286465	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017477	T	7	7	286655	286661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017477	GTA	2	6	287156	287161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017477	GA	3	6	287535	287540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017477	TAAG	2	8	287583	287590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017477	T	6	6	287644	287649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017477	A	7	7	289174	289180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017477	ATT	2	6	289190	289195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017477	TA	3	6	289784	289789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017477	TAT	2	6	289803	289808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017477	A	6	6	289871	289876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017477	T	6	6	293085	293090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017477	TA	3	6	293093	293098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017477	ATTTA	2	10	293129	293138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017477	T	6	6	293144	293149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017477	A	6	6	293165	293170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017477	A	7	7	293174	293180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017477	TA	4	8	293185	293192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017477	AT	4	8	293211	293218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017477	TAA	2	6	293225	293230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017477	CTAT	2	8	293232	293239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_017477	AATT	2	8	293242	293249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017477	TAAA	2	8	293264	293271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017477	TAAT	2	8	293284	293291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017477	TGCT	2	8	293313	293320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_017477	ATG	2	6	293350	293355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017477	AAG	2	6	293356	293361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017477	AG	3	6	293397	293402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017477	T	6	6	294640	294645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017477	AAG	2	6	294892	294897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017477	AGTA	2	8	294914	294921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017477	TTAC	2	8	294958	294965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_017477	T	6	6	295621	295626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017477	ATA	2	6	295644	295649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017477	TATT	2	8	295669	295676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017477	AGTAA	2	10	295678	295687	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017477	CATC	2	8	296195	296202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_017477	TAA	2	6	296207	296212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017477	A	6	6	296217	296222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017477	TAA	2	6	296282	296287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017477	TTC	2	6	296327	296332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017477	TCA	2	6	296340	296345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017477	ACG	2	6	296405	296410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017477	AGTA	2	8	296431	296438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017477	ACT	2	6	296442	296447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017477	TTA	2	6	296484	296489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017477	GAT	2	6	296626	296631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017477	AGT	2	6	296738	296743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017477	CAT	2	6	296755	296760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017477	TTG	2	6	296775	296780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017477	T	7	7	296858	296864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017477	AAT	2	6	296880	296885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017477	TTTA	2	8	296964	296971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017477	CTT	2	6	297049	297054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017477	TAA	2	6	297057	297062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017477	AGTA	2	8	297065	297072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017477	TAT	2	6	297073	297078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017477	TTA	3	9	297088	297096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017477	A	7	7	297124	297130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017477	TA	3	6	297143	297148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017477	TGTA	2	8	297163	297170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017477	TACT	2	8	298622	298629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_017477	AAT	2	6	298659	298664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017477	ATG	2	6	299535	299540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017477	AT	3	6	299542	299547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017477	AT	3	6	299558	299563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017477	ATA	2	6	299674	299679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017477	TTG	2	6	299684	299689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017477	A	6	6	299701	299706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017477	ATA	2	6	303871	303876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017477	GAA	3	9	305341	305349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017477	TTCTTT	2	12	305369	305380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1136	NC_017477	TA	3	6	305466	305471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017477	T	6	6	306753	306758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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