MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 6491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017477	TAA	2	6	102601	102606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017477	ATA	2	6	102626	102631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017477	A	7	7	105179	105185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017477	T	6	6	105200	105205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017477	ACT	2	6	106348	106353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017477	T	6	6	106386	106391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017477	TTA	2	6	106429	106434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017477	AGA	2	6	106440	106445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017477	AGG	2	6	106481	106486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017477	CTT	2	6	106921	106926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017477	ATA	2	6	106936	106941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017477	ACA	2	6	107002	107007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017477	AAG	2	6	107040	107045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017477	AG	3	6	107065	107070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017477	CTG	2	6	107071	107076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017477	AGT	2	6	107078	107083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017477	GCT	2	6	107100	107105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017477	TAC	2	6	107131	107136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017477	GA	3	6	107147	107152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017477	TC	3	6	107165	107170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_017477	T	6	6	107172	107177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017477	TA	3	6	107189	107194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017477	AATTAA	2	12	107195	107206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017477	TAA	2	6	107209	107214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017477	TGT	2	6	107220	107225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017477	TA	3	6	107243	107248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017477	TAA	2	6	107271	107276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017477	ATC	2	6	108247	108252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017477	AGAGT	2	10	110777	110786	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017477	TAG	2	6	110800	110805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017477	AAG	2	6	111549	111554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017477	TAA	2	6	112427	112432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017477	GAT	2	6	112480	112485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017477	T	7	7	112493	112499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017477	CTTT	2	8	112784	112791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_017477	TAA	2	6	112798	112803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017477	AAT	2	6	112874	112879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017477	AAAAG	2	10	112892	112901	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017477	AAAT	2	8	112909	112916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017477	TAA	2	6	112935	112940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017477	TAT	2	6	113015	113020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017477	CAATA	2	10	115423	115432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
543	NC_017477	GTAA	2	8	115438	115445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017477	GTT	2	6	115454	115459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017477	AAC	2	6	115467	115472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017477	ATC	2	6	115484	115489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017477	GAC	2	6	115524	115529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017477	CAA	2	6	115562	115567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017477	GAAA	2	8	115579	115586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017477	CGG	2	6	115595	115600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017477	ATTT	2	8	115679	115686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017477	A	7	7	116366	116372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017477	AGC	2	6	116403	116408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017477	CTTT	2	8	118096	118103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_017477	AT	3	6	118110	118115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017477	ACA	2	6	118135	118140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017477	A	6	6	118140	118145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017477	AGG	3	9	118149	118157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017477	TAAA	2	8	118167	118174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017477	GTTA	2	8	118177	118184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017477	ATA	2	6	118187	118192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017477	CCT	2	6	118918	118923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017477	TAT	2	6	118926	118931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017477	GA	3	6	118963	118968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017477	TAA	2	6	119010	119015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017477	GGA	2	6	119559	119564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017477	ATT	2	6	121763	121768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017477	TC	3	6	121770	121775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_017477	TCC	2	6	122718	122723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_017477	CTT	2	6	122724	122729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017477	ATT	2	6	122752	122757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017477	GAA	2	6	122784	122789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017477	AAT	2	6	122793	122798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017477	AG	3	6	123559	123564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017477	AGT	2	6	123632	123637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017477	GCA	2	6	123672	123677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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578	NC_017477	AAT	2	6	123711	123716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017477	GAA	2	6	123741	123746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017477	TGA	2	6	123770	123775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017477	ACT	2	6	123798	123803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017477	AAAC	2	8	123814	123821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_017477	ATT	2	6	123824	123829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017477	A	6	6	123830	123835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017477	A	6	6	123851	123856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017477	T	6	6	123875	123880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017477	T	7	7	123888	123894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017477	AGT	2	6	123895	123900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017477	TAA	3	9	123906	123914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017477	ACGC	2	8	123928	123935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
591	NC_017477	GAC	2	6	123949	123954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017477	GAC	2	6	123958	123963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017477	T	6	6	123979	123984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017477	TAT	2	6	125004	125009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_017477	TAA	2	6	127092	127097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017477	AAGG	2	8	127117	127124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017477	TTAA	2	8	128207	128214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017477	ACAA	2	8	128299	128306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_017477	AATT	2	8	128318	128325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017477	GGA	2	6	128405	128410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017477	GAA	2	6	129778	129783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017477	T	6	6	129804	129809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017477	ATTA	2	8	129817	129824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017477	A	7	7	129824	129830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017477	TTA	2	6	129845	129850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017477	TAA	2	6	129867	129872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017477	GAATA	2	10	129909	129918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017477	AAGG	2	8	130604	130611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017477	TAA	2	6	131465	131470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017477	CA	3	6	131472	131477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_017477	GAT	2	6	131532	131537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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616	NC_017477	AGT	2	6	131563	131568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_017477	ATTA	2	8	131682	131689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017477	ATA	2	6	131697	131702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017477	TAG	2	6	133335	133340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017477	AT	4	8	133351	133358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017477	A	7	7	133370	133376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017477	T	7	7	133394	133400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017477	TAA	2	6	133435	133440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017477	T	8	8	135329	135336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017477	TG	3	6	135338	135343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017477	GAAG	2	8	135442	135449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017477	TGG	2	6	135499	135504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017477	GA	3	6	135602	135607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017477	TAG	2	6	135700	135705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017477	GA	3	6	135815	135820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017477	AT	3	6	135862	135867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017477	CGTA	2	8	137225	137232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_017477	T	6	6	138871	138876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017477	AAT	2	6	138877	138882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017477	CTA	2	6	138901	138906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017477	TAG	2	6	138907	138912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017477	ACTA	2	8	138916	138923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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