MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 6491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017477	ATTCAT	2	12	1816733	1816744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6002	NC_017477	ATC	2	6	1816763	1816768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_017477	ATTAT	2	10	1816811	1816820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017477	ATTAT	2	10	1817148	1817157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017477	CCT	2	6	1822854	1822859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_017477	A	6	6	1822869	1822874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017477	CTT	2	6	1822887	1822892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_017477	CTTT	2	8	1822969	1822976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_017477	ATT	3	9	1822977	1822985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017477	TCC	2	6	1823680	1823685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_017477	CCT	2	6	1825275	1825280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_017477	A	7	7	1825351	1825357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017477	TCA	2	6	1826633	1826638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_017477	CTA	2	6	1826689	1826694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_017477	TAA	2	6	1826717	1826722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017477	AGT	2	6	1826739	1826744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017477	TA	3	6	1827504	1827509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017477	ATC	2	6	1827521	1827526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_017477	CCTA	2	8	1828669	1828676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_017477	TGCTT	2	10	1828696	1828705	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6021	NC_017477	AATC	2	8	1828726	1828733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6022	NC_017477	AGA	2	6	1829460	1829465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017477	TCT	2	6	1829491	1829496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_017477	TA	3	6	1829500	1829505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017477	TTAT	2	8	1829506	1829513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017477	CAA	2	6	1830445	1830450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_017477	TTTA	2	8	1830458	1830465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017477	AGC	2	6	1830467	1830472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_017477	T	6	6	1830485	1830490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017477	TA	3	6	1830498	1830503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017477	TCT	2	6	1830526	1830531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_017477	A	6	6	1830536	1830541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_017477	ATT	2	6	1832354	1832359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017477	A	6	6	1832399	1832404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017477	TTC	2	6	1832421	1832426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_017477	TTA	2	6	1833211	1833216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017477	ACTTA	2	10	1833229	1833238	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6038	NC_017477	TA	3	6	1833247	1833252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017477	TAT	2	6	1833269	1833274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017477	AAAAGA	2	12	1833327	1833338	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017477	T	6	6	1833353	1833358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017477	TTTA	2	8	1833373	1833380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017477	TTA	2	6	1833386	1833391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017477	ATT	2	6	1834291	1834296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017477	TAA	2	6	1834318	1834323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017477	AAT	2	6	1835331	1835336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_017477	CTC	2	6	1835368	1835373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_017477	AAG	2	6	1835391	1835396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017477	AAT	2	6	1835423	1835428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017477	ACT	2	6	1835436	1835441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_017477	A	6	6	1835445	1835450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_017477	TCA	2	6	1835477	1835482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_017477	CAA	2	6	1835505	1835510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017477	TCT	2	6	1835584	1835589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_017477	TAC	2	6	1835667	1835672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_017477	TTA	2	6	1835718	1835723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017477	A	7	7	1835735	1835741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017477	CGA	2	6	1835753	1835758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_017477	TTCG	2	8	1835785	1835792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_017477	ACCGCT	2	12	1835822	1835833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_017477	TGG	2	6	1835851	1835856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017477	ATG	2	6	1836008	1836013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017477	TCG	2	6	1836081	1836086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_017477	AAATG	2	10	1836089	1836098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017477	GTTG	2	8	1836153	1836160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017477	ATC	2	6	1836168	1836173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_017477	ATG	2	6	1836215	1836220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017477	T	6	6	1836276	1836281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017477	GTCC	2	8	1836309	1836316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_017477	A	7	7	1836413	1836419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017477	TGAC	2	8	1836421	1836428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_017477	AAT	2	6	1836434	1836439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_017477	GTCA	2	8	1836450	1836457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_017477	AGG	2	6	1836526	1836531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_017477	A	6	6	1839713	1839718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_017477	A	6	6	1839797	1839802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_017477	A	6	6	1842321	1842326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_017477	CTA	2	6	1842349	1842354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6080	NC_017477	T	7	7	1842444	1842450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_017477	T	6	6	1842877	1842882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_017477	A	6	6	1842891	1842896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017477	TAG	2	6	1842912	1842917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6085	NC_017477	TACCTT	2	12	1843810	1843821	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_017477	AGA	2	6	1843848	1843853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_017477	T	6	6	1843867	1843872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_017477	TAA	2	6	1843890	1843895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_017477	AAT	2	6	1843902	1843907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017477	TAT	2	6	1843938	1843943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_017477	GTT	2	6	1844045	1844050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_017477	TTA	2	6	1844051	1844056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_017477	CTC	2	6	1847557	1847562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_017477	TTAAT	2	10	1848083	1848092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_017477	TCC	2	6	1850133	1850138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_017477	TAT	2	6	1850173	1850178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_017477	TAT	2	6	1850225	1850230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017477	T	6	6	1850252	1850257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_017477	TA	3	6	1850319	1850324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017477	ATA	2	6	1851835	1851840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_017477	T	6	6	1852858	1852863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017477	TAT	2	6	1853655	1853660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_017477	TC	3	6	1853669	1853674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_017477	T	6	6	1853785	1853790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017477	TAA	2	6	1853802	1853807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_017477	T	6	6	1854662	1854667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017477	ACTA	2	8	1854668	1854675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6110	NC_017477	GAT	2	6	1854725	1854730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_017477	A	6	6	1856792	1856797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_017477	AGT	2	6	1856799	1856804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017477	TCA	2	6	1857760	1857765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_017477	A	7	7	1857777	1857783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017477	TAG	2	6	1857910	1857915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6117	NC_017477	GGT	2	6	1858051	1858056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017477	A	6	6	1858064	1858069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017477	T	6	6	1858104	1858109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_017477	A	7	7	1859162	1859168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017477	TAA	2	6	1860609	1860614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017477	CTT	2	6	1860615	1860620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_017477	ACTT	2	8	1861365	1861372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_017477	TA	3	6	1861399	1861404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017477	TAA	2	6	1861472	1861477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_017477	A	8	8	1864296	1864303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017477	A	6	6	1864395	1864400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_017477	A	6	6	1864799	1864804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_017477	AT	3	6	1864812	1864817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_017477	TA	3	6	1865792	1865797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_017477	CCT	2	6	1865803	1865808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6133	NC_017477	T	7	7	1867724	1867730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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