MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 1285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017474	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017474	TTTG	2	8	9774	9781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017474	GCAA	2	8	10590	10597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017474	ATTA	2	8	12658	12665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017474	AACG	2	8	15202	15209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017474	AAGC	2	8	18872	18879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017474	TAAT	2	8	19639	19646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017474	CGTT	2	8	20293	20300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017474	AGCT	2	8	21732	21739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017474	CGAG	2	8	21942	21949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017474	GGGT	2	8	22159	22166	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017474	GGTT	2	8	28926	28933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017474	CATA	2	8	28972	28979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017474	AGTG	2	8	29118	29125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017474	ATGA	2	8	34207	34214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017474	AAGC	2	8	35973	35980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017474	AGCA	2	8	37479	37486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017474	ATTT	2	8	37527	37534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017474	AAAC	2	8	38564	38571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017474	AGAA	2	8	40297	40304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017474	TATT	2	8	43437	43444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017474	CTTT	2	8	43676	43683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017474	TCTT	2	8	43768	43775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017474	CAAA	2	8	47705	47712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017474	AATC	2	8	51386	51393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017474	AACA	2	8	54893	54900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017474	TGAA	2	8	55072	55079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017474	TGAA	2	8	55114	55121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017474	GTGC	2	8	57245	57252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017474	TAGC	2	8	65481	65488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017474	ACAA	2	8	65851	65858	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017474	TTGT	2	8	65889	65896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017474	GACT	2	8	65963	65970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017474	TACT	2	8	71508	71515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017474	ATTA	2	8	82722	82729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017474	GAAA	2	8	85798	85805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017474	TCCC	2	8	87145	87152	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017474	AGTA	2	8	87180	87187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017474	GCAC	2	8	87486	87493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017474	CTGG	2	8	87638	87645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017474	TTGC	2	8	87672	87679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017474	TATT	2	8	88416	88423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017474	TATC	2	8	88480	88487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017474	TAAA	2	8	91485	91492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017474	TTTC	2	8	91546	91553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017474	CAAT	2	8	91643	91650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017474	CAAA	2	8	96918	96925	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017474	GTTG	2	8	97103	97110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017474	AAAT	2	8	97160	97167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017474	GTCT	2	8	97307	97314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017474	GGCA	2	8	101724	101731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017474	GTGA	2	8	101779	101786	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017474	CTTT	2	8	103224	103231	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017474	ATCA	2	8	104159	104166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017474	TTGT	2	8	107458	107465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017474	AAGA	2	8	108971	108978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017474	GATG	2	8	125580	125587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017474	ATTA	2	8	125796	125803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017474	TTAG	2	8	125846	125853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017474	TGAC	2	8	127272	127279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017474	TGGT	2	8	129768	129775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017474	TGTT	2	8	131549	131556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017474	CAGA	2	8	131633	131640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017474	AAAT	2	8	132742	132749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017474	ATTA	2	8	135090	135097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017474	TTAA	2	8	135230	135237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017474	GATT	2	8	138566	138573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017474	TTTC	2	8	141072	141079	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017474	GCCT	2	8	144739	144746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017474	TTAC	2	8	145777	145784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017474	AGTA	2	8	145789	145796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017474	ACAT	2	8	151574	151581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017474	GAAT	2	8	152813	152820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017474	TAAC	2	8	166342	166349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017474	GCAG	2	8	166377	166384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017474	CAGA	2	8	171290	171297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017474	GGTA	2	8	171328	171335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017474	TGAA	2	8	171489	171496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017474	AAGG	2	8	175992	175999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017474	AAAC	2	8	181254	181261	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017474	AGAA	2	8	184693	184700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017474	AGTA	2	8	184944	184951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017474	TTAA	2	8	185428	185435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017474	AAAG	2	8	185586	185593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017474	TGCT	2	8	190238	190245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017474	GTTT	2	8	191697	191704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017474	GAAA	2	8	191741	191748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017474	CAGC	2	8	192315	192322	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017474	TGTT	2	8	192461	192468	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017474	AGGC	2	8	192495	192502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017474	CTTT	2	8	198299	198306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017474	AAGA	2	8	207133	207140	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017474	TCAA	2	8	207203	207210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017474	TACT	2	8	207212	207219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017474	TAAA	2	8	208193	208200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017474	CCTT	2	8	209125	209132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017474	TATT	2	8	209210	209217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017474	TGAA	2	8	209269	209276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017474	ATGA	2	8	222100	222107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017474	TACA	2	8	222160	222167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017474	ATAA	2	8	224935	224942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017474	ATTA	2	8	231374	231381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017474	CAAA	2	8	247097	247104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017474	AAGC	2	8	251197	251204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017474	ATCA	2	8	251246	251253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017474	TATG	2	8	251277	251284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017474	AGCA	2	8	253199	253206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017474	TGCA	2	8	253285	253292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017474	GTGC	2	8	255832	255839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017474	TGAG	2	8	255881	255888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017474	GTCA	2	8	255914	255921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017474	TGGA	2	8	256399	256406	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017474	GTGA	2	8	256578	256585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017474	ATGG	2	8	257413	257420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017474	GAGC	2	8	257632	257639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017474	TAAG	2	8	258027	258034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017474	AGAA	2	8	258157	258164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017474	GCGA	2	8	258186	258193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017474	GCTT	2	8	258218	258225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017474	GAGC	2	8	259628	259635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017474	TAGG	2	8	260074	260081	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017474	CTGC	2	8	261067	261074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017474	TAAG	2	8	261141	261148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017474	AACC	2	8	263176	263183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017474	CCGA	2	8	263291	263298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017474	AAAG	2	8	270496	270503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017474	GCTT	2	8	271349	271356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017474	ATGG	2	8	276057	276064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017474	TAGA	2	8	276268	276275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017474	AAAG	2	8	279479	279486	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017474	CTTG	2	8	283522	283529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017474	GTTA	2	8	283535	283542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017474	ACAT	2	8	283553	283560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017474	CCGG	2	8	283631	283638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017474	TTTA	2	8	285106	285113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017474	TTGC	2	8	285136	285143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017474	TGCT	2	8	285170	285177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017474	ATGA	2	8	288201	288208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017474	TGGT	2	8	289601	289608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017474	ATGA	2	8	292888	292895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017474	CTTA	2	8	297480	297487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017474	TTGA	2	8	297526	297533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017474	AATC	2	8	297585	297592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017474	AGCC	2	8	305238	305245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017474	CAAA	2	8	308530	308537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017474	TGAT	2	8	308583	308590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017474	TTGT	2	8	313687	313694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017474	GTCT	2	8	313790	313797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017474	ATGG	2	8	320188	320195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017474	AGCA	2	8	324331	324338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017474	CGAG	2	8	327955	327962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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