MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017474	GTT	2	6	1253376	1253381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017474	TAAA	2	8	1253384	1253391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017474	TG	3	6	1253441	1253446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017474	ACT	2	6	1253447	1253452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017474	CGA	2	6	1253512	1253517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017474	GTT	2	6	1253560	1253565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017474	TTA	2	6	1253566	1253571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017474	ATT	2	6	1253577	1253582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017474	CCT	2	6	1253585	1253590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_017474	ACA	2	6	1253656	1253661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017474	AGG	2	6	1254382	1254387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017474	A	6	6	1255018	1255023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017474	GTAA	2	8	1255533	1255540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017474	CCT	2	6	1255565	1255570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_017474	A	7	7	1255618	1255624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017474	GC	3	6	1255625	1255630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_017474	GT	3	6	1255657	1255662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017474	ATA	2	6	1255677	1255682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017474	A	6	6	1255717	1255722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017474	CCG	2	6	1255723	1255728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_017474	AAT	2	6	1255779	1255784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017474	CCA	2	6	1255795	1255800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_017474	CAA	2	6	1256339	1256344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_017474	A	6	6	1256343	1256348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017474	ATT	2	6	1256365	1256370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017474	TCC	2	6	1256411	1256416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_017474	TGA	2	6	1256426	1256431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4029	NC_017474	CGG	2	6	1256607	1256612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017474	GCA	2	6	1256669	1256674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4032	NC_017474	CAG	2	6	1256725	1256730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_017474	GC	3	6	1256823	1256828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_017474	GTA	2	6	1256884	1256889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017474	T	7	7	1256913	1256919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017474	TTG	2	6	1257320	1257325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017474	ACG	2	6	1257467	1257472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4040	NC_017474	TTTA	2	8	1257566	1257573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017474	CAA	2	6	1257613	1257618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017474	A	6	6	1257617	1257622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017474	A	6	6	1257716	1257721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017474	AGC	2	6	1257767	1257772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4047	NC_017474	GTG	2	6	1259309	1259314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017474	CAT	2	6	1261141	1261146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4052	NC_017474	GAC	2	6	1269593	1269598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4055	NC_017474	AAT	2	6	1281193	1281198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4057	NC_017474	GTGAA	2	10	1281230	1281239	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_017474	TGT	2	6	1281466	1281471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017474	TGAC	2	8	1281481	1281488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_017474	CTTT	2	8	1281573	1281580	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_017474	AT	3	6	1281653	1281658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017474	TTG	2	6	1281705	1281710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_017474	AGCT	2	8	1286564	1286571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_017474	CAGT	2	8	1286575	1286582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4087	NC_017474	ATC	2	6	1289647	1289652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4089	NC_017474	AAT	2	6	1289753	1289758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017474	CGC	2	6	1289810	1289815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_017474	TTTTG	2	10	1289921	1289930	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017474	GAT	2	6	1290132	1290137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017474	TAC	2	6	1290163	1290168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4095	NC_017474	A	7	7	1290361	1290367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017474	CTT	2	6	1290475	1290480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4098	NC_017474	ATG	2	6	1290661	1290666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017474	TAAT	2	8	1290745	1290752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017474	CCT	2	6	1291285	1291290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_017474	T	6	6	1291290	1291295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017474	ATT	2	6	1291311	1291316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017474	T	6	6	1291667	1291672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017474	TCT	2	6	1291711	1291716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017474	CAATT	2	10	1291727	1291736	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4106	NC_017474	AGT	2	6	1291789	1291794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_017474	AAT	2	6	1293063	1293068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017474	GAAAAG	2	12	1293161	1293172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_017474	AAG	2	6	1293862	1293867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017474	A	6	6	1293876	1293881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017474	CTT	2	6	1295368	1295373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017474	A	7	7	1295422	1295428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017474	T	6	6	1295451	1295456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017474	GTT	2	6	1295469	1295474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017474	GTA	2	6	1295485	1295490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017474	TTGT	2	8	1295587	1295594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017474	T	7	7	1295605	1295611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017474	A	6	6	1296149	1296154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017474	GT	3	6	1296206	1296211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017474	ATG	3	9	1296253	1296261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017474	AAT	2	6	1297066	1297071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017474	T	6	6	1297120	1297125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017474	AAC	2	6	1297139	1297144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017474	AGG	2	6	1297194	1297199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017474	AGG	2	6	1297901	1297906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017474	AAT	2	6	1301595	1301600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017474	CGC	2	6	1301642	1301647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_017474	AGC	2	6	1301713	1301718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_017474	AAC	2	6	1301737	1301742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_017474	TGT	2	6	1301766	1301771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017474	CTAT	2	8	1301842	1301849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_017474	GAC	2	6	1301860	1301865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_017474	GTC	2	6	1301889	1301894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_017474	TTTG	2	8	1301896	1301903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_017474	A	6	6	1302748	1302753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_017474	GAA	2	6	1302784	1302789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_017474	TTG	2	6	1302856	1302861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_017474	AAG	2	6	1302936	1302941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_017474	A	7	7	1304900	1304906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_017474	GTA	2	6	1304922	1304927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_017474	CTG	2	6	1304974	1304979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4146	NC_017474	GCG	2	6	1305162	1305167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4147	NC_017474	TTCC	2	8	1305199	1305206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4148	NC_017474	TTC	2	6	1306591	1306596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4150	NC_017474	CGG	2	6	1306641	1306646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4161	NC_017474	TGG	2	6	1310644	1310649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_017474	AGG	2	6	1310660	1310665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_017474	CAAA	2	8	1311916	1311923	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4164	NC_017474	CTT	2	6	1311949	1311954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4165	NC_017474	GAC	2	6	1312006	1312011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4166	NC_017474	TA	3	6	1312021	1312026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_017474	GAA	2	6	1312041	1312046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4172	NC_017474	AGG	2	6	1312984	1312989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4173	NC_017474	AGG	2	6	1313716	1313721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4176	NC_017474	AGTA	2	8	1315001	1315008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4184	NC_017474	GAGC	2	8	1321311	1321318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4192	NC_017474	TGAG	2	8	1325195	1325202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4193	NC_017474	TGA	2	6	1325231	1325236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4201	NC_017474	AG	3	6	1326548	1326553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4202	NC_017474	GCGGA	2	10	1326557	1326566	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4203	NC_017474	TTG	3	9	1326587	1326595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4214	NC_017474	CA	3	6	1327354	1327359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4231	NC_017474	GTT	2	6	1337764	1337769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_017474	CAC	2	6	1345167	1345172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4253	NC_017474	TAGC	2	8	1345179	1345186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4254	NC_017474	CAT	2	6	1345193	1345198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_017474	TTG	2	6	1345895	1345900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_017474	GAC	2	6	1347610	1347615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_017474	T	6	6	1347625	1347630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_017474	AGG	2	6	1347654	1347659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_017474	TCA	2	6	1347671	1347676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_017474	CG	3	6	1347713	1347718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4263	NC_017474	GTT	3	9	1348688	1348696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4386	NC_017474	ATT	2	6	1386808	1386813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_017474	AC	3	6	1386907	1386912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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