MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017474	CTGGTA	2	12	461317	461328	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1502	NC_017474	AATT	2	8	461357	461364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017474	CGT	2	6	461384	461389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017474	TTC	2	6	461394	461399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017474	ATTG	2	8	461432	461439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017474	GTT	2	6	461453	461458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017474	CGC	2	6	461470	461475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_017474	CAT	2	6	461509	461514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017474	CCG	2	6	461646	461651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_017474	ACA	2	6	461664	461669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017474	TCC	2	6	461696	461701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_017474	GTA	2	6	461709	461714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017474	CTCTAT	2	12	461736	461747	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017474	GAC	2	6	461780	461785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017474	AATT	2	8	461786	461793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017474	ATTT	2	8	461802	461809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017474	ACG	2	6	461847	461852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017474	T	7	7	461908	461914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017474	A	6	6	461970	461975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017474	CATT	2	8	462014	462021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_017474	CAC	2	6	462083	462088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_017474	TCA	2	6	462096	462101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017474	TTGC	2	8	462102	462109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_017474	TAA	2	6	462112	462117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017474	T	6	6	462128	462133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017474	CTG	2	6	462229	462234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017474	TCT	2	6	462423	462428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017474	TGA	2	6	462606	462611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017474	CAC	2	6	462653	462658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_017474	CCG	2	6	462660	462665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_017474	GCCG	2	8	462739	462746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_017474	GCA	2	6	462771	462776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017474	TAA	2	6	462830	462835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017474	GCT	2	6	462962	462967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017474	ATC	2	6	463060	463065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017474	GTC	2	6	463114	463119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017474	TTG	3	9	463127	463135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017474	AAG	2	6	463144	463149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017474	TCT	2	6	463233	463238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017474	TGA	2	6	463300	463305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017474	TCG	2	6	463311	463316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017474	AGT	2	6	463348	463353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017474	GGA	2	6	463396	463401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017474	TTG	2	6	463430	463435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017474	TG	3	6	463434	463439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017474	ATG	2	6	463455	463460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017474	AAC	2	6	463498	463503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017474	GTG	2	6	463531	463536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017474	A	6	6	463622	463627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017474	TAT	2	6	463655	463660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017474	GGA	2	6	463681	463686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017474	GGTTTC	2	12	463732	463743	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1553	NC_017474	AC	3	6	463830	463835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_017474	GCT	2	6	463844	463849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017474	T	7	7	463913	463919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017474	CTG	2	6	463947	463952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017474	GTGC	2	8	464159	464166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_017474	GTAT	2	8	464181	464188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017474	GCA	2	6	464245	464250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017474	TTC	2	6	464394	464399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017474	CAT	2	6	464404	464409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017474	AGC	2	6	464455	464460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017474	TGA	2	6	464530	464535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017474	GGT	2	6	464551	464556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017474	AAC	2	6	464569	464574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017474	TCA	2	6	464578	464583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017474	TGA	2	6	464626	464631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017474	GAA	2	6	464636	464641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017474	A	6	6	464640	464645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017474	TGT	3	9	464680	464688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017474	T	6	6	464707	464712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017474	GGA	2	6	464743	464748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017474	GAA	2	6	465265	465270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017474	CG	3	6	465271	465276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_017474	AGG	2	6	465277	465282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017474	ATG	2	6	466946	466951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017474	TCTGG	2	10	469270	469279	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1578	NC_017474	AGG	2	6	469293	469298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017474	GAGT	2	8	471407	471414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017474	TCT	2	6	471437	471442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_017474	AGA	2	6	471453	471458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017474	AGC	2	6	471552	471557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_017474	TTG	2	6	475167	475172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017474	TGAAGA	2	12	475205	475216	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017474	GTAG	2	8	475243	475250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017474	ATAA	2	8	475257	475264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017474	GCC	2	6	475265	475270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_017474	TGC	2	6	475317	475322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_017474	GCTCG	2	10	475325	475334	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1590	NC_017474	GAC	2	6	475336	475341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1592	NC_017474	CCA	2	6	475398	475403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_017474	AT	3	6	475491	475496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017474	TA	3	6	475506	475511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017474	AAG	2	6	475577	475582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017474	GGT	2	6	475585	475590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017474	AGG	2	6	475633	475638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017474	GTT	2	6	475686	475691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017474	AGCT	2	8	475756	475763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_017474	AGC	2	6	475811	475816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017474	TTG	2	6	475818	475823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017474	AT	4	8	475868	475875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017474	TTGA	2	8	475942	475949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017474	GTG	2	6	475957	475962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017474	CTC	2	6	478801	478806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_017474	ATTTGT	2	12	478820	478831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017474	T	6	6	478859	478864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017474	ATC	2	6	478885	478890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017474	CAA	2	6	478941	478946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_017474	T	7	7	479254	479260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017474	AAAT	2	8	479282	479289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017474	GTT	2	6	479294	479299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017474	TGG	2	6	479325	479330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017474	GGA	3	9	479339	479347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017474	AGC	2	6	480264	480269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_017474	TTG	2	6	480273	480278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017474	ATTT	2	8	480351	480358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017474	CAT	2	6	481399	481404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_017474	A	6	6	481412	481417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017474	GA	3	6	481431	481436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017474	GTG	2	6	481496	481501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017474	TTGG	2	8	482512	482519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017474	ATT	2	6	482571	482576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017474	TAT	2	6	484505	484510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017474	AAG	2	6	484523	484528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017474	TGTT	2	8	484549	484556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017474	TC	3	6	485140	485145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_017474	GCG	2	6	485207	485212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017474	ACA	2	6	487530	487535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_017474	TTG	2	6	487545	487550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017474	AGA	2	6	487565	487570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017474	CCT	2	6	488050	488055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_017474	CCT	2	6	489521	489526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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