MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017474	TCC	2	6	304712	304717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_017474	CTGCGA	2	12	305203	305214	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017474	AGCC	2	8	305238	305245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_017474	AAC	2	6	308367	308372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017474	TAA	2	6	308431	308436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017474	AAT	2	6	308441	308446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017474	GTT	2	6	308456	308461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017474	TGT	2	6	308486	308491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017474	GCA	2	6	308503	308508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017474	CAAA	2	8	308530	308537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_017474	A	6	6	308535	308540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017474	GAT	2	6	308551	308556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017474	TGAT	2	8	308583	308590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017474	ATTGC	2	10	309895	309904	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_017474	AAC	2	6	311624	311629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017474	CAT	2	6	311649	311654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017474	T	6	6	311692	311697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017474	CG	3	6	311709	311714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_017474	GCG	2	6	311811	311816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017474	CCT	2	6	312509	312514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017474	ATG	2	6	312524	312529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017474	TAA	2	6	312532	312537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017474	ATA	2	6	312563	312568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017474	AT	3	6	312597	312602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017474	T	6	6	312649	312654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017474	GGT	2	6	312738	312743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017474	AG	3	6	312752	312757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017474	GTG	3	9	312758	312766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017474	CGG	2	6	313093	313098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017474	TAG	2	6	313336	313341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017474	GAT	2	6	313609	313614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017474	GAA	2	6	313659	313664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017474	TTGT	2	8	313687	313694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017474	CCA	2	6	313708	313713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_017474	T	6	6	313732	313737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017474	GTCT	2	8	313790	313797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_017474	A	6	6	316401	316406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017474	T	6	6	319999	320004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017474	T	6	6	320016	320021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017474	TGT	3	9	320028	320036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017474	GTTGT	2	10	320091	320100	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017474	AGG	2	6	320144	320149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017474	ATGG	2	8	320188	320195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017474	GGC	2	6	320220	320225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017474	TCA	2	6	320258	320263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017474	ATG	2	6	321809	321814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017474	CAC	2	6	321821	321826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_017474	TCA	2	6	321845	321850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017474	AAT	2	6	321900	321905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017474	CGA	2	6	321917	321922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017474	GAC	2	6	321936	321941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017474	A	6	6	321946	321951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017474	TTC	2	6	321984	321989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017474	AAT	2	6	322028	322033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017474	ACC	2	6	322359	322364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_017474	GGT	2	6	322382	322387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017474	T	7	7	322391	322397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017474	A	6	6	322401	322406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017474	ACA	2	6	322467	322472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017474	TC	3	6	322501	322506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_017474	AC	3	6	322544	322549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_017474	TGA	2	6	322561	322566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017474	A	7	7	323757	323763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017474	AGG	2	6	323786	323791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017474	AG	3	6	324212	324217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017474	AGCA	2	8	324331	324338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_017474	AGTTA	2	10	327885	327894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017474	CGAG	2	8	327955	327962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017474	GGA	2	6	327975	327980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017474	ACCT	2	8	328946	328953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_017474	GAA	2	6	331390	331395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017474	TGG	2	6	331397	331402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017474	GCAA	2	8	331454	331461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_017474	ATAA	2	8	331462	331469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017474	GTGA	2	8	331492	331499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017474	AGC	2	6	334171	334176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017474	TG	4	8	334256	334263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017474	CAA	2	6	334279	334284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017474	TTA	2	6	334340	334345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017474	AATA	2	8	334362	334369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017474	CAT	2	6	334383	334388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017474	AT	3	6	334399	334404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017474	T	6	6	334413	334418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017474	ATA	2	6	334443	334448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017474	ATC	2	6	334508	334513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017474	CTT	2	6	334523	334528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017474	A	6	6	334558	334563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017474	AGA	2	6	334897	334902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017474	AAC	2	6	336426	336431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017474	GCC	2	6	336848	336853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_017474	GCT	2	6	337617	337622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017474	AT	3	6	337654	337659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017474	ATT	2	6	337662	337667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017474	TAA	2	6	337674	337679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017474	GCT	2	6	337694	337699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017474	T	6	6	337719	337724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017474	A	6	6	339577	339582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017474	TTA	2	6	341870	341875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017474	ATT	2	6	341876	341881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017474	AGG	2	6	341885	341890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017474	TGT	2	6	341963	341968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017474	AAAGC	2	10	342006	342015	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_017474	GTCT	2	8	342043	342050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_017474	AGC	2	6	342056	342061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017474	CTTC	2	8	342083	342090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_017474	ATC	2	6	342137	342142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017474	ACA	3	9	342197	342205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017474	AGGG	2	8	342208	342215	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017474	CAG	2	6	343775	343780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017474	T	6	6	343792	343797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017474	GCTT	2	8	343985	343992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_017474	AGG	2	6	344008	344013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017474	TCT	2	6	344041	344046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017474	AATC	2	8	346549	346556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_017474	CTG	2	6	348284	348289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017474	TGA	2	6	349206	349211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017474	AGAGG	2	10	349262	349271	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017474	TAA	2	6	349948	349953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017474	TTGTAA	2	12	350012	350023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017474	AG	3	6	350035	350040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017474	A	6	6	350088	350093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017474	TTTA	2	8	350102	350109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017474	AAT	2	6	350112	350117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017474	TAG	2	6	350143	350148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017474	GAT	2	6	350194	350199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017474	CAA	2	6	351915	351920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017474	AGG	2	6	351925	351930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017474	ATT	2	6	352961	352966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017474	TTGA	2	8	353007	353014	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017474	AGC	2	6	353120	353125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017474	GTTA	2	8	353126	353133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017474	TAG	2	6	353177	353182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017474	ACG	2	6	353213	353218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017474	TAA	2	6	353273	353278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017474	TA	3	6	353291	353296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_017474	T	6	6	353401	353406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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