MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017474	GGT	2	6	139629	139634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017474	TTTC	2	8	141072	141079	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_017474	CTT	2	6	141492	141497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017474	TGT	2	6	141510	141515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017474	TCA	2	6	141520	141525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017474	A	8	8	141589	141596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017474	AAG	2	6	143160	143165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017474	GGC	2	6	143207	143212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017474	CTT	2	6	143225	143230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017474	GAT	2	6	144621	144626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017474	TATTTT	2	12	144668	144679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017474	TTG	2	6	144685	144690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017474	GCCT	2	8	144739	144746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
514	NC_017474	TAT	2	6	144747	144752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017474	GTCAT	2	10	144762	144771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
516	NC_017474	TTAC	2	8	145777	145784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_017474	AGTA	2	8	145789	145796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017474	AAC	2	6	146317	146322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017474	T	6	6	146369	146374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017474	GTGATG	2	12	147093	147104	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017474	ATT	2	6	147176	147181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017474	A	6	6	147182	147187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017474	TG	3	6	147282	147287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017474	T	6	6	147305	147310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017474	T	6	6	147312	147317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017474	A	6	6	147336	147341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017474	TA	3	6	147363	147368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017474	AGC	2	6	147405	147410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017474	T	8	8	147411	147418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017474	AGC	2	6	150672	150677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017474	TCA	2	6	150710	150715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017474	ACA	2	6	150719	150724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017474	A	6	6	150764	150769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017474	ACAT	2	8	151574	151581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_017474	GAATAA	2	12	152738	152749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017474	GAAT	2	8	152813	152820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017474	AAG	2	6	152934	152939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017474	GAGGC	2	10	154772	154781	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
539	NC_017474	CAC	2	6	155773	155778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_017474	A	7	7	155788	155794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017474	T	6	6	155811	155816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017474	TCC	2	6	156182	156187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_017474	CAG	2	6	156228	156233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017474	TTA	2	6	156244	156249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017474	ATG	2	6	156261	156266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017474	AAT	2	6	156274	156279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017474	AGG	2	6	157743	157748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017474	A	7	7	157749	157755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017474	A	6	6	158969	158974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017474	TC	3	6	158978	158983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_017474	GA	3	6	158992	158997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017474	CCT	2	6	159882	159887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_017474	CTG	2	6	160018	160023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017474	AGA	2	6	160048	160053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017474	GTT	2	6	160835	160840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017474	A	7	7	161173	161179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017474	T	7	7	161200	161206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017474	CCT	2	6	164577	164582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_017474	GAT	2	6	164618	164623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017474	GAA	2	6	164626	164631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017474	A	6	6	164657	164662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017474	GTG	2	6	164680	164685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017474	ATC	2	6	164714	164719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017474	T	7	7	164724	164730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017474	TCA	2	6	164732	164737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017474	TTG	2	6	164758	164763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017474	A	6	6	164777	164782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017474	GCA	2	6	166321	166326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017474	A	7	7	166328	166334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017474	TAAC	2	8	166342	166349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_017474	GCAG	2	8	166377	166384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_017474	AAT	2	6	166422	166427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017474	CAG	2	6	166430	166435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017474	TGACAA	2	12	166509	166520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
575	NC_017474	CCT	2	6	166694	166699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_017474	TCA	2	6	166724	166729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_017474	T	6	6	166892	166897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017474	T	8	8	169369	169376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017474	GCG	2	6	169404	169409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017474	TGA	2	6	169452	169457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017474	CTG	2	6	169465	169470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017474	T	6	6	169506	169511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017474	TTC	2	6	169519	169524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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588	NC_017474	GTTCA	2	10	171228	171237	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
589	NC_017474	T	8	8	171264	171271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017474	AAT	2	6	171278	171283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017474	CAGA	2	8	171290	171297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
592	NC_017474	GGTA	2	8	171328	171335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017474	ATG	2	6	171412	171417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017474	ATA	2	6	171426	171431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017474	GAA	2	6	171444	171449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017474	TAAAAA	2	12	171454	171465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017474	A	7	7	171461	171467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017474	TGAA	2	8	171489	171496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017474	CAATG	2	10	171516	171525	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
600	NC_017474	AGG	2	6	171586	171591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017474	AG	3	6	172627	172632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017474	CAT	2	6	172760	172765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017474	ATT	2	6	173910	173915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017474	A	6	6	173916	173921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017474	TGT	2	6	173931	173936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017474	T	6	6	173948	173953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017474	ATT	2	6	175975	175980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017474	AAGG	2	8	175992	175999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017474	TTG	2	6	178058	178063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017474	CAA	2	6	178123	178128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017474	TCGAT	2	10	178151	178160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
612	NC_017474	AGG	2	6	178182	178187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017474	TCC	2	6	181148	181153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_017474	AAAC	2	8	181254	181261	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_017474	TGT	2	6	181355	181360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017474	T	6	6	181936	181941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017474	GAT	2	6	181978	181983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017474	TCG	2	6	181987	181992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017474	TTG	2	6	182030	182035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017474	AAGGT	2	10	182037	182046	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017474	CGT	2	6	182377	182382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017474	T	6	6	182419	182424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017474	A	6	6	182438	182443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017474	T	7	7	182463	182469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017474	TGAGG	2	10	182513	182522	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017474	AAATG	2	10	183477	183486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017474	TG	4	8	183524	183531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017474	T	8	8	183543	183550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017474	CCT	2	6	184550	184555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_017474	TTG	2	6	184561	184566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017474	CAT	3	9	184610	184618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017474	GTA	2	6	184673	184678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017474	AGAA	2	8	184693	184700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017474	TCT	2	6	184719	184724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017474	A	6	6	184822	184827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017474	TCA	2	6	184831	184836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017474	AGTA	2	8	184944	184951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017474	AGC	2	6	185405	185410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017474	ATG	2	6	185413	185418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_017474	T	6	6	185482	185487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_017474	ACA	2	6	186431	186436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_017474	GAC	2	6	186485	186490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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649	NC_017474	GA	3	6	187160	187165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
650	NC_017474	T	7	7	187634	187640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_017474	CAA	3	9	187858	187866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_017474	TCT	2	6	189508	189513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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654	NC_017474	TGCT	2	8	190238	190245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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660	NC_017474	TGG	2	6	192285	192290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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674	NC_017474	A	7	7	198337	198343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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686	NC_017474	A	6	6	204128	204133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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