MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017474	A	6	6	1637664	1637669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017474	CTT	2	6	1637682	1637687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017474	AAG	2	6	1637712	1637717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017474	A	7	7	1639566	1639572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017474	CCT	2	6	1642118	1642123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_017474	CCT	2	6	1642660	1642665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_017474	GAT	2	6	1642681	1642686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017474	TCATA	2	10	1645897	1645906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5009	NC_017474	CTAC	2	8	1653151	1653158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_017474	GCA	2	6	1653181	1653186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_017474	GCT	2	6	1653375	1653380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017474	AGT	2	6	1653419	1653424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017474	TAA	2	6	1653450	1653455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017474	AAT	2	6	1656477	1656482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017474	ACGA	2	8	1656515	1656522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_017474	TCGT	2	8	1656542	1656549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_017474	ACA	2	6	1656641	1656646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017474	TGT	2	6	1656670	1656675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017474	AGC	2	6	1656796	1656801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017474	AAT	2	6	1656848	1656853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017474	TCT	2	6	1656898	1656903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017474	TCC	2	6	1659193	1659198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_017474	GCC	2	6	1660033	1660038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_017474	CGG	2	6	1660044	1660049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017474	CCCTT	2	10	1660435	1660444	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5026	NC_017474	AGCC	2	8	1660470	1660477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_017474	GGC	2	6	1660683	1660688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017474	CTATG	2	10	1660742	1660751	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5029	NC_017474	TCC	2	6	1663789	1663794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_017474	AC	3	6	1665654	1665659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_017474	ATA	3	9	1665728	1665736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017474	A	7	7	1668858	1668864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017474	TCA	2	6	1668877	1668882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017474	CAA	2	6	1668905	1668910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017474	TCA	2	6	1668972	1668977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_017474	TTA	2	6	1668992	1668997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017474	AGA	2	6	1669029	1669034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017474	TGA	2	6	1669082	1669087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017474	GCAG	2	8	1669161	1669168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_017474	GTG	2	6	1669253	1669258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017474	CAC	2	6	1669261	1669266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_017474	CGC	2	6	1669276	1669281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_017474	CT	3	6	1669290	1669295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_017474	CAA	2	6	1669347	1669352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_017474	CTT	2	6	1669691	1669696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017474	A	7	7	1669733	1669739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017474	TAC	2	6	1669744	1669749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_017474	ACC	2	6	1669760	1669765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_017474	CAA	2	6	1669772	1669777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017474	TTTGTC	2	12	1669789	1669800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5051	NC_017474	A	6	6	1669802	1669807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017474	CTC	2	6	1670171	1670176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_017474	CAA	2	6	1670178	1670183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017474	A	6	6	1670187	1670192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017474	TAA	2	6	1670262	1670267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017474	AATA	2	8	1670282	1670289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017474	AATTA	2	10	1670327	1670336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017474	GTTT	2	8	1670344	1670351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017474	AAT	2	6	1670387	1670392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017474	TTA	2	6	1674333	1674338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017474	ATG	2	6	1674343	1674348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017474	CG	3	6	1674482	1674487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_017474	TCCC	2	8	1675292	1675299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5064	NC_017474	TTA	2	6	1675347	1675352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017474	CTGTT	2	10	1675413	1675422	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5066	NC_017474	GTT	2	6	1675433	1675438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017474	GTC	2	6	1675516	1675521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5069	NC_017474	TTTTGA	2	12	1677329	1677340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017474	TAA	2	6	1678384	1678389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017474	TGGC	2	8	1678967	1678974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_017474	T	6	6	1678976	1678981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017474	CCT	2	6	1682089	1682094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_017474	AGT	2	6	1682185	1682190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5077	NC_017474	ACC	2	6	1682305	1682310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_017474	T	7	7	1682314	1682320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017474	CAA	2	6	1682514	1682519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_017474	A	6	6	1682554	1682559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017474	ATT	2	6	1682677	1682682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017474	CCTTT	2	10	1684382	1684391	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5083	NC_017474	CCTT	2	8	1685254	1685261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_017474	ATT	2	6	1685280	1685285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017474	CAA	2	6	1685306	1685311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_017474	CCT	2	6	1687744	1687749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_017474	TAA	2	6	1687766	1687771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017474	ATCA	2	8	1687783	1687790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_017474	AAT	2	6	1687873	1687878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017474	GCA	2	6	1687921	1687926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017474	CTA	2	6	1687955	1687960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_017474	TCCGA	2	10	1688423	1688432	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5095	NC_017474	TTG	2	6	1688458	1688463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017474	TGG	2	6	1688548	1688553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_017474	T	6	6	1689930	1689935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017474	ATA	2	6	1689943	1689948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017474	A	7	7	1691059	1691065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017474	GCT	2	6	1691066	1691071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5103	NC_017474	CCT	2	6	1693382	1693387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_017474	GCACGC	2	12	1693407	1693418	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_017474	CGC	2	6	1693477	1693482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_017474	GC	3	6	1693511	1693516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_017474	AC	3	6	1693527	1693532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_017474	TCC	2	6	1694708	1694713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_017474	CCT	2	6	1695787	1695792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_017474	TTCT	2	8	1695875	1695882	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_017474	GC	3	6	1697016	1697021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_017474	GCA	2	6	1697034	1697039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017474	A	6	6	1697350	1697355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017474	T	6	6	1697400	1697405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017474	AATGCT	2	12	1697946	1697957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5117	NC_017474	AAT	2	6	1698013	1698018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017474	TTA	2	6	1698024	1698029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017474	ATT	2	6	1698035	1698040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017474	AAG	2	6	1698064	1698069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017474	ATC	2	6	1698153	1698158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_017474	A	7	7	1698188	1698194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017474	ACC	2	6	1698250	1698255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_017474	TAT	2	6	1698867	1698872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017474	TTAA	2	8	1698913	1698920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017474	AAT	2	6	1698921	1698926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017474	TC	3	6	1699509	1699514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_017474	AAC	2	6	1699571	1699576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017474	CA	3	6	1699607	1699612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_017474	GC	3	6	1699730	1699735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5132	NC_017474	T	6	6	1699820	1699825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017474	CAC	2	6	1699852	1699857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_017474	ATC	2	6	1699911	1699916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5249	NC_017474	GGCT	2	8	1748334	1748341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5259	NC_017474	A	6	6	1750965	1750970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_017474	A	6	6	1752876	1752881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_017474	TTGT	2	8	1753088	1753095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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