MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 9184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017473	AT	3	6	1250763	1250768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017473	TTG	2	6	1250815	1250820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017473	TTGA	2	8	1251751	1251758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017473	TCC	2	6	1252057	1252062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_017473	T	7	7	1252064	1252070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017473	CTT	2	6	1252129	1252134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017473	TAT	2	6	1252156	1252161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017473	AGC	2	6	1252194	1252199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017473	GTG	2	6	1252208	1252213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017473	ATG	2	6	1252217	1252222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017473	A	7	7	1254489	1254495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017473	CAA	2	6	1254549	1254554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_017473	CAC	2	6	1254604	1254609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_017473	A	7	7	1255649	1255655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017473	AGCT	2	8	1255674	1255681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_017473	CAGT	2	8	1255685	1255692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_017473	TCC	2	6	1256866	1256871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_017473	A	6	6	1256926	1256931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017473	AGC	2	6	1256986	1256991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017473	ATT	2	6	1257215	1257220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017473	GTG	2	6	1258242	1258247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017473	ATC	2	6	1258757	1258762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017473	TGAC	2	8	1258778	1258785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_017473	AAT	2	6	1258863	1258868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017473	CGC	2	6	1258920	1258925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_017473	TTTTG	2	10	1259031	1259040	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017473	GAT	2	6	1259242	1259247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017473	TAC	2	6	1259273	1259278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017473	T	7	7	1259286	1259292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017473	A	7	7	1259471	1259477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017473	CTT	2	6	1259585	1259590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017473	TA	3	6	1259614	1259619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017473	ATG	2	6	1259771	1259776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017473	TAAT	2	8	1259855	1259862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017473	CCT	2	6	1260395	1260400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_017473	T	6	6	1260400	1260405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017473	ATT	2	6	1260421	1260426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017473	T	6	6	1260777	1260782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017473	TCT	2	6	1260821	1260826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017473	CAATT	2	10	1260837	1260846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4041	NC_017473	AGT	2	6	1260899	1260904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017473	AAT	2	6	1262129	1262134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017473	TGC	2	6	1262154	1262159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_017473	AAT	2	6	1262173	1262178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017473	GAAAAG	2	12	1262271	1262282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017473	CCT	2	6	1262927	1262932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_017473	AAG	2	6	1262972	1262977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017473	A	6	6	1262986	1262991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017473	CTT	2	6	1264478	1264483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017473	A	7	7	1264532	1264538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017473	T	6	6	1264561	1264566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017473	GTT	2	6	1264579	1264584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017473	GTA	2	6	1264595	1264600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017473	TTGT	2	8	1264697	1264704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017473	T	7	7	1264715	1264721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017473	A	6	6	1265259	1265264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017473	GT	3	6	1265316	1265321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017473	ATG	3	9	1265363	1265371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017473	AAT	2	6	1266176	1266181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017473	T	6	6	1266230	1266235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017473	AAC	2	6	1266249	1266254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017473	AGG	2	6	1266304	1266309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017473	AGG	2	6	1267011	1267016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017473	AAT	2	6	1270705	1270710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017473	CTAT	2	8	1270952	1270959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_017473	GAC	2	6	1270970	1270975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017473	GTC	2	6	1270999	1271004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017473	TTTG	2	8	1271006	1271013	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017473	A	6	6	1271858	1271863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017473	GAA	2	6	1271894	1271899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017473	TTG	2	6	1271966	1271971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017473	AAG	2	6	1272046	1272051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017473	A	7	7	1274010	1274016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017473	GTA	2	6	1274032	1274037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017473	CTG	2	6	1274084	1274089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017473	ACA	2	6	1274155	1274160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_017473	GCG	2	6	1274272	1274277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017473	TTCC	2	8	1274309	1274316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_017473	TTC	2	6	1275701	1275706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017473	GCAA	2	8	1275741	1275748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_017473	CGG	2	6	1275751	1275756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017473	GTG	2	6	1275759	1275764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017473	A	6	6	1275775	1275780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017473	GGC	2	6	1275816	1275821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017473	AGG	2	6	1276502	1276507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_017473	CGG	2	6	1279517	1279522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_017473	CGT	2	6	1279576	1279581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017473	GAT	2	6	1279599	1279604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017473	GAT	2	6	1279674	1279679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017473	T	7	7	1279721	1279727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017473	TGG	2	6	1279754	1279759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017473	AGG	2	6	1279770	1279775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017473	CAAA	2	8	1281026	1281033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_017473	CTT	2	6	1281059	1281064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017473	GAC	2	6	1281116	1281121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_017473	TA	3	6	1281131	1281136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017473	GAA	2	6	1281151	1281156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017473	AGG	2	6	1281164	1281169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017473	AAC	2	6	1282019	1282024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017473	CAT	3	9	1282050	1282058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_017473	TGA	2	6	1282061	1282066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017473	AGG	2	6	1282094	1282099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017473	AGG	2	6	1282826	1282831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017473	TCA	2	6	1283060	1283065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_017473	AAG	2	6	1283069	1283074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017473	AGTA	2	8	1284111	1284118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017473	AC	3	6	1286630	1286635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_017473	TCA	2	6	1286647	1286652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_017473	TCA	2	6	1286716	1286721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017473	TCA	2	6	1286770	1286775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017473	CGCT	2	8	1286781	1286788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_017473	ACA	2	6	1286899	1286904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017473	GGA	2	6	1286905	1286910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017473	TC	3	6	1288843	1288848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_017473	TGC	2	6	1288880	1288885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017473	TGA	2	6	1288887	1288892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017473	GGT	2	6	1288944	1288949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017473	TAGT	2	8	1289397	1289404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017473	GAG	2	6	1289413	1289418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017473	AT	3	6	1289421	1289426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017473	GAGC	2	8	1290421	1290428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_017473	AAC	2	6	1291130	1291135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017473	GC	3	6	1291143	1291148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_017473	ATC	2	6	1291205	1291210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017473	GAC	2	6	1291339	1291344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017473	AGG	2	6	1291414	1291419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017473	A	6	6	1294252	1294257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017473	ATTG	2	8	1294288	1294295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017473	TGAG	2	8	1294305	1294312	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017473	TGA	2	6	1294341	1294346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017473	TG	3	6	1294481	1294486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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